MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004337	ACC	2	6	661192	661197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112045
11002	NC_004337	CT	3	6	661226	661231	0 %	50 %	0 %	50 %	24112045
11003	NC_004337	CTG	2	6	661360	661365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11004	NC_004337	ATG	2	6	661366	661371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
11005	NC_004337	CTG	2	6	661381	661386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11006	NC_004337	TGG	3	9	661421	661429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112045
11007	NC_004337	CGT	2	6	661431	661436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11008	NC_004337	CTT	2	6	661561	661566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112045
11009	NC_004337	TAC	2	6	661582	661587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
11010	NC_004337	ATC	2	6	661614	661619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
11011	NC_004337	CG	3	6	661740	661745	0 %	0 %	50 %	50 %	24112045
11012	NC_004337	ACA	2	6	661775	661780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112045
11013	NC_004337	CAT	2	6	661782	661787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112045
11014	NC_004337	GTC	2	6	661923	661928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11015	NC_004337	AT	3	6	661944	661949	50 %	50 %	0 %	0 %	24112045
11016	NC_004337	GCC	2	6	661953	661958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112045
11017	NC_004337	ATT	2	6	662005	662010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112045
11018	NC_004337	CTG	2	6	662056	662061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11019	NC_004337	TGCG	2	8	662129	662136	0 %	25 %	50 %	25 %	24112045
11020	NC_004337	GC	3	6	662146	662151	0 %	0 %	50 %	50 %	24112045
11021	NC_004337	GCA	2	6	662162	662167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11022	NC_004337	CAA	2	6	662169	662174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112045
11023	NC_004337	CGG	2	6	662183	662188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112045
11024	NC_004337	GAT	2	6	662217	662222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
11025	NC_004337	ACC	2	6	662266	662271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112045
11026	NC_004337	TGC	2	6	662337	662342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112045
11027	NC_004337	TGA	2	6	662348	662353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112045
11028	NC_004337	CGC	2	6	662844	662849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479704
11029	NC_004337	GCA	2	6	662854	662859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11030	NC_004337	GTC	2	6	662899	662904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11031	NC_004337	TTA	2	6	662934	662939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479704
11032	NC_004337	GTG	2	6	662956	662961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479704
11033	NC_004337	TTG	2	6	662990	662995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479704
11034	NC_004337	CAA	2	6	663015	663020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479704
11035	NC_004337	CTG	2	6	663073	663078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11036	NC_004337	ACC	2	6	663112	663117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479704
11037	NC_004337	AAC	2	6	663118	663123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479704
11038	NC_004337	GGC	2	6	663141	663146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479704
11039	NC_004337	GCG	2	6	663197	663202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479704
11040	NC_004337	GTC	2	6	663241	663246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11041	NC_004337	CAA	2	6	663276	663281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479704
11042	NC_004337	TGAA	2	8	663284	663291	50 %	25 %	25 %	0 %	56479704
11043	NC_004337	A	6	6	663296	663301	100 %	0 %	0 %	0 %	56479704
11044	NC_004337	CAT	2	6	663312	663317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479704
11045	NC_004337	ATG	2	6	663379	663384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479704
11046	NC_004337	CTG	2	6	663394	663399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11047	NC_004337	GAA	2	6	663420	663425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479704
11048	NC_004337	TCG	2	6	663443	663448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479704
11049	NC_004337	GATG	2	8	663516	663523	25 %	25 %	50 %	0 %	56479704
11050	NC_004337	CCG	2	6	663595	663600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479704
11051	NC_004337	T	7	7	663876	663882	0 %	100 %	0 %	0 %	24112047
11052	NC_004337	ACA	2	6	663883	663888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112047
11053	NC_004337	ACC	2	6	663905	663910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112047
11054	NC_004337	TTGG	2	8	663915	663922	0 %	50 %	50 %	0 %	24112047
11055	NC_004337	TCG	2	6	663984	663989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112047
11056	NC_004337	TC	3	6	664030	664035	0 %	50 %	0 %	50 %	24112047
11057	NC_004337	GCT	2	6	664120	664125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112047
11058	NC_004337	CCG	2	6	664215	664220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112047
11059	NC_004337	CGC	2	6	664243	664248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112047
11060	NC_004337	AGA	2	6	664272	664277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112047
11061	NC_004337	CTG	2	6	664328	664333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112047
11062	NC_004337	CCG	2	6	664358	664363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112047
11063	NC_004337	GAT	2	6	664375	664380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112047
11064	NC_004337	TGG	2	6	664422	664427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112047
11065	NC_004337	GGC	2	6	664432	664437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112047
11066	NC_004337	ACT	2	6	664458	664463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112047
11067	NC_004337	TGA	2	6	664536	664541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112047
11068	NC_004337	G	6	6	664579	664584	0 %	0 %	100 %	0 %	24112047
11069	NC_004337	AAT	2	6	664587	664592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112047
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11072	NC_004337	TGG	2	6	664892	664897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112048
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11076	NC_004337	GCT	3	9	665058	665066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112048
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11080	NC_004337	CGT	2	6	665225	665230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112048
11081	NC_004337	AAG	2	6	665250	665255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112048
11082	NC_004337	ATGGT	2	10	665291	665300	20 %	40 %	40 %	0 %	24112049
11083	NC_004337	A	6	6	665337	665342	100 %	0 %	0 %	0 %	24112049
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11087	NC_004337	CAG	3	9	665685	665693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112049
11088	NC_004337	TCGC	2	8	665704	665711	0 %	25 %	25 %	50 %	24112049
11089	NC_004337	CGA	2	6	665744	665749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112049
11090	NC_004337	GAT	2	6	665774	665779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112049
11091	NC_004337	TGG	2	6	665800	665805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112049
11092	NC_004337	CGAA	2	8	665812	665819	50 %	0 %	25 %	25 %	24112049
11093	NC_004337	ATG	2	6	665829	665834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112049
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11095	NC_004337	GAT	2	6	665937	665942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112049
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11099	NC_004337	A	6	6	666235	666240	100 %	0 %	0 %	0 %	56479705
11100	NC_004337	GGC	2	6	666300	666305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479705
11101	NC_004337	CGG	2	6	666415	666420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479705
11102	NC_004337	TGC	2	6	666502	666507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479705
11103	NC_004337	GCG	2	6	666559	666564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479705
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11105	NC_004337	CG	3	6	666723	666728	0 %	0 %	50 %	50 %	56479705
11106	NC_004337	TTG	2	6	666751	666756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479705
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11111	NC_004337	ATT	3	9	666937	666945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479705
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11122	NC_004337	AAT	2	6	669405	669410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112051
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11229	NC_004337	GTCA	2	8	674912	674919	25 %	25 %	25 %	25 %	24112056
11230	NC_004337	GT	3	6	675088	675093	0 %	50 %	50 %	0 %	24112057
11231	NC_004337	ATG	2	6	675170	675175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112057
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11233	NC_004337	TTC	2	6	675284	675289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112057
11234	NC_004337	CT	3	6	675297	675302	0 %	50 %	0 %	50 %	24112057
11235	NC_004337	TTA	2	6	675388	675393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112057
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11238	NC_004337	CGTT	2	8	675450	675457	0 %	50 %	25 %	25 %	24112057
11239	NC_004337	ACGT	2	8	675891	675898	25 %	25 %	25 %	25 %	56479706
11240	NC_004337	CTGC	2	8	675986	675993	0 %	25 %	25 %	50 %	56479706
11241	NC_004337	GCG	2	6	676001	676006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479706
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11244	NC_004337	TAC	2	6	676130	676135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479706
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