MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_004337	TCG	2	6	565054	565059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111971
9503	NC_004337	GCCGGA	2	12	565100	565111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	24111971
9504	NC_004337	TAA	2	6	565202	565207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111971
9505	NC_004337	TTA	2	6	565278	565283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111971
9506	NC_004337	ATC	2	6	565300	565305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111971
9507	NC_004337	GCA	2	6	565351	565356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
9508	NC_004337	CAG	2	6	565397	565402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
9509	NC_004337	TTCT	2	8	565450	565457	0 %	75 %	0 %	25 %	24111971
9510	NC_004337	GCA	2	6	565517	565522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
9511	NC_004337	AC	3	6	565550	565555	50 %	0 %	0 %	50 %	24111971
9512	NC_004337	CAG	2	6	565590	565595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111971
9513	NC_004337	CCG	2	6	565694	565699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111971
9514	NC_004337	TTG	2	6	565702	565707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111971
9515	NC_004337	TTG	2	6	565737	565742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111971
9516	NC_004337	CAC	2	6	565752	565757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111971
9517	NC_004337	GCCT	2	8	565769	565776	0 %	25 %	25 %	50 %	24111971
9518	NC_004337	AT	3	6	565839	565844	50 %	50 %	0 %	0 %	24111971
9519	NC_004337	GGT	2	6	566126	566131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479688
9520	NC_004337	ATG	2	6	566181	566186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479688
9521	NC_004337	TCA	2	6	566187	566192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479688
9522	NC_004337	GGC	2	6	566249	566254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479688
9523	NC_004337	TTG	2	6	566268	566273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479688
9524	NC_004337	TGA	2	6	566298	566303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479688
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9526	NC_004337	GC	3	6	566440	566445	0 %	0 %	50 %	50 %	56479688
9527	NC_004337	CTC	2	6	566473	566478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56479688
9528	NC_004337	TGG	2	6	566571	566576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479688
9529	NC_004337	CTG	2	6	566627	566632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479688
9530	NC_004337	GC	3	6	566652	566657	0 %	0 %	50 %	50 %	56479688
9531	NC_004337	CCGA	2	8	566774	566781	25 %	0 %	25 %	50 %	56479688
9532	NC_004337	CGT	2	6	566836	566841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479688
9533	NC_004337	GCA	2	6	566904	566909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479688
9534	NC_004337	TGAAC	2	10	567031	567040	40 %	20 %	20 %	20 %	56479688
9535	NC_004337	CTGGCA	2	12	567082	567093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56479688
9536	NC_004337	ATC	2	6	567156	567161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111973
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9538	NC_004337	CACCG	2	10	567207	567216	20 %	0 %	20 %	60 %	24111973
9539	NC_004337	GCCA	2	8	567250	567257	25 %	0 %	25 %	50 %	24111973
9540	NC_004337	GC	4	8	567435	567442	0 %	0 %	50 %	50 %	24111973
9541	NC_004337	GCG	2	6	567599	567604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111973
9542	NC_004337	GCT	2	6	567609	567614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111973
9543	NC_004337	TGG	2	6	567726	567731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111973
9544	NC_004337	CTG	2	6	567836	567841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111973
9545	NC_004337	CAGCG	2	10	567884	567893	20 %	0 %	40 %	40 %	24111973
9546	NC_004337	CTG	2	6	568040	568045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111973
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9548	NC_004337	TGGT	2	8	568071	568078	0 %	50 %	50 %	0 %	24111973
9549	NC_004337	GCA	2	6	568124	568129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111973
9550	NC_004337	GC	3	6	568138	568143	0 %	0 %	50 %	50 %	24111973
9551	NC_004337	GAAA	2	8	568192	568199	75 %	0 %	25 %	0 %	24111974
9552	NC_004337	A	6	6	568197	568202	100 %	0 %	0 %	0 %	24111974
9553	NC_004337	AC	3	6	568285	568290	50 %	0 %	0 %	50 %	24111974
9554	NC_004337	ACG	2	6	568299	568304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111974
9555	NC_004337	GATT	2	8	568324	568331	25 %	50 %	25 %	0 %	24111974
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9558	NC_004337	CGTGG	2	10	568472	568481	0 %	20 %	60 %	20 %	24111974
9559	NC_004337	AAC	2	6	568502	568507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111974
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9595	NC_004337	ACC	2	6	570278	570283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111975
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