MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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68002	NC_004337	CAA	2	6	4261798	4261803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115309
68003	NC_004337	CTG	2	6	4261832	4261837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115309
68004	NC_004337	TCG	2	6	4261863	4261868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115309
68005	NC_004337	CCG	2	6	4261901	4261906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115309
68006	NC_004337	AAC	2	6	4261946	4261951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115309
68007	NC_004337	GAAC	2	8	4262008	4262015	50 %	0 %	25 %	25 %	24115309
68008	NC_004337	CTG	2	6	4262054	4262059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115309
68009	NC_004337	GC	3	6	4262085	4262090	0 %	0 %	50 %	50 %	24115309
68010	NC_004337	ATT	2	6	4262393	4262398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24115309
68011	NC_004337	CTA	2	6	4262485	4262490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115309
68012	NC_004337	ACC	2	6	4262543	4262548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24115309
68013	NC_004337	CTG	2	6	4262576	4262581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115309
68014	NC_004337	CGG	2	6	4262590	4262595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115309
68015	NC_004337	CAGC	2	8	4262626	4262633	25 %	0 %	25 %	50 %	24115309
68016	NC_004337	CGG	2	6	4262659	4262664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115309
68017	NC_004337	CGG	2	6	4262683	4262688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115309
68018	NC_004337	CGG	3	9	4262691	4262699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115309
68019	NC_004337	GCA	2	6	4262707	4262712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115309
68020	NC_004337	AGA	2	6	4262782	4262787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115309
68021	NC_004337	CTT	2	6	4262827	4262832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115309
68022	NC_004337	CAA	2	6	4262845	4262850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115309
68023	NC_004337	GCT	2	6	4263099	4263104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115310
68024	NC_004337	TCG	2	6	4263125	4263130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115310
68025	NC_004337	CTA	2	6	4263136	4263141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115310
68026	NC_004337	GCT	3	9	4263171	4263179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115310
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68028	NC_004337	CAT	2	6	4263204	4263209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115310
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68030	NC_004337	TGG	2	6	4263389	4263394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115310
68031	NC_004337	GTG	2	6	4263450	4263455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115310
68032	NC_004337	GGC	2	6	4263456	4263461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115310
68033	NC_004337	GAT	2	6	4263484	4263489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115310
68034	NC_004337	GC	3	6	4263539	4263544	0 %	0 %	50 %	50 %	24115310
68035	NC_004337	GCTC	2	8	4263573	4263580	0 %	25 %	25 %	50 %	24115310
68036	NC_004337	GCC	2	6	4263590	4263595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115310
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68038	NC_004337	TCAC	2	8	4263779	4263786	25 %	25 %	0 %	50 %	56480510
68039	NC_004337	ACCG	2	8	4263790	4263797	25 %	0 %	25 %	50 %	56480510
68040	NC_004337	CAG	2	6	4263844	4263849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480510
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68042	NC_004337	ATC	2	6	4264007	4264012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480510
68043	NC_004337	A	6	6	4264031	4264036	100 %	0 %	0 %	0 %	56480510
68044	NC_004337	CAC	2	6	4264060	4264065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480510
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68046	NC_004337	TGA	2	6	4264146	4264151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480510
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68049	NC_004337	GAA	2	6	4264330	4264335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480510
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68051	NC_004337	ATA	2	6	4264375	4264380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480510
68052	NC_004337	ATA	2	6	4264417	4264422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480510
68053	NC_004337	TAA	2	6	4264437	4264442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480510
68054	NC_004337	CTTC	2	8	4264541	4264548	0 %	50 %	0 %	50 %	56480510
68055	NC_004337	GATT	2	8	4264556	4264563	25 %	50 %	25 %	0 %	56480510
68056	NC_004337	TGA	2	6	4264599	4264604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480510
68057	NC_004337	A	6	6	4264618	4264623	100 %	0 %	0 %	0 %	56480510
68058	NC_004337	CCG	2	6	4264673	4264678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480510
68059	NC_004337	A	7	7	4264735	4264741	100 %	0 %	0 %	0 %	56480510
68060	NC_004337	GTT	2	6	4264758	4264763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480510
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68071	NC_004337	CGG	2	6	4265376	4265381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115312
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68083	NC_004337	GCTCCA	2	12	4266012	4266023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	24115312
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68089	NC_004337	CTT	2	6	4266423	4266428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115312
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68100	NC_004337	ATCA	2	8	4267129	4267136	50 %	25 %	0 %	25 %	24115313
68101	NC_004337	TC	3	6	4267236	4267241	0 %	50 %	0 %	50 %	24115313
68102	NC_004337	TCAC	2	8	4267274	4267281	25 %	25 %	0 %	50 %	24115313
68103	NC_004337	CA	3	6	4267305	4267310	50 %	0 %	0 %	50 %	24115313
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68459	NC_004337	TCG	2	6	4289199	4289204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115331
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68468	NC_004337	CTG	2	6	4289921	4289926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115331
68469	NC_004337	ATC	2	6	4289942	4289947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115331
68470	NC_004337	CGG	2	6	4289950	4289955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115331
68471	NC_004337	AGC	2	6	4289981	4289986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115331
68472	NC_004337	TGG	2	6	4290000	4290005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115331
68473	NC_004337	GCG	2	6	4290038	4290043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115331
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68475	NC_004337	CTG	2	6	4290101	4290106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115331
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68482	NC_004337	TCT	2	6	4290576	4290581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115332
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68488	NC_004337	CGCTGG	2	12	4290834	4290845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24115332
68489	NC_004337	TGG	3	9	4290843	4290851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115332
68490	NC_004337	GTG	2	6	4290887	4290892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115332
68491	NC_004337	GGC	2	6	4290925	4290930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115332
68492	NC_004337	CCGA	2	8	4290941	4290948	25 %	0 %	25 %	50 %	24115332
68493	NC_004337	TTG	2	6	4290969	4290974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24115332
68494	NC_004337	A	7	7	4290992	4290998	100 %	0 %	0 %	0 %	24115332
68495	NC_004337	TGA	2	6	4291026	4291031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115332
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68497	NC_004337	CGG	2	6	4291102	4291107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115332
68498	NC_004337	GCTG	2	8	4291167	4291174	0 %	25 %	50 %	25 %	24115332
68499	NC_004337	TCGC	2	8	4291180	4291187	0 %	25 %	25 %	50 %	24115332
68500	NC_004337	TGA	2	6	4291213	4291218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115332

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