MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65501	NC_004337	GTG	2	6	4101173	4101178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115188
65502	NC_004337	CTG	2	6	4101218	4101223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115188
65503	NC_004337	A	7	7	4101428	4101434	100 %	0 %	0 %	0 %	24115189
65504	NC_004337	GGC	2	6	4101495	4101500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115189
65505	NC_004337	TGA	2	6	4101502	4101507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115189
65506	NC_004337	ACA	2	6	4101511	4101516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115189
65507	NC_004337	GAA	2	6	4101539	4101544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115189
65508	NC_004337	TGA	2	6	4101585	4101590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115189
65509	NC_004337	ATA	2	6	4101647	4101652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24115189
65510	NC_004337	CG	3	6	4101660	4101665	0 %	0 %	50 %	50 %	24115189
65511	NC_004337	TTCC	2	8	4101687	4101694	0 %	50 %	0 %	50 %	24115189
65512	NC_004337	GCC	2	6	4101729	4101734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115189
65513	NC_004337	GCC	2	6	4101756	4101761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115189
65514	NC_004337	GCG	2	6	4101795	4101800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115189
65515	NC_004337	CAA	2	6	4101865	4101870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24115189
65516	NC_004337	GAT	2	6	4101875	4101880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115189
65517	NC_004337	GACT	2	8	4101918	4101925	25 %	25 %	25 %	25 %	24115189
65518	NC_004337	CGC	2	6	4101937	4101942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115189
65519	NC_004337	CGG	2	6	4101973	4101978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115189
65520	NC_004337	GCC	2	6	4102023	4102028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115189
65521	NC_004337	AAG	2	6	4102035	4102040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115189
65522	NC_004337	GCA	2	6	4102051	4102056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115189
65523	NC_004337	GCG	2	6	4102116	4102121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115189
65524	NC_004337	TTTG	2	8	4102129	4102136	0 %	75 %	25 %	0 %	24115189
65525	NC_004337	AATT	2	8	4102253	4102260	50 %	50 %	0 %	0 %	24115189
65526	NC_004337	TGT	2	6	4102430	4102435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24115190
65527	NC_004337	TCAGAT	2	12	4102437	4102448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24115190
65528	NC_004337	GCCA	2	8	4102524	4102531	25 %	0 %	25 %	50 %	24115190
65529	NC_004337	CAG	2	6	4102564	4102569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115190
65530	NC_004337	AGA	2	6	4102574	4102579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115190
65531	NC_004337	TCC	2	6	4102629	4102634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24115190
65532	NC_004337	CAGC	2	8	4102657	4102664	25 %	0 %	25 %	50 %	24115190
65533	NC_004337	ATCAC	2	10	4102721	4102730	40 %	20 %	0 %	40 %	24115190
65534	NC_004337	T	6	6	4102771	4102776	0 %	100 %	0 %	0 %	24115191
65535	NC_004337	CAC	2	6	4102974	4102979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24115191
65536	NC_004337	AGGA	2	8	4102997	4103004	50 %	0 %	50 %	0 %	24115191
65537	NC_004337	ATGGAA	2	12	4103011	4103022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24115191
65538	NC_004337	GTC	2	6	4103763	4103768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480472
65539	NC_004337	GAGCA	2	10	4103789	4103798	40 %	0 %	40 %	20 %	56480472
65540	NC_004337	GGCA	2	8	4103850	4103857	25 %	0 %	50 %	25 %	56480472
65541	NC_004337	CAA	2	6	4103863	4103868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480472
65542	NC_004337	CGCC	2	8	4103874	4103881	0 %	0 %	25 %	75 %	56480472
65543	NC_004337	TGG	2	6	4103926	4103931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480472
65544	NC_004337	T	6	6	4103967	4103972	0 %	100 %	0 %	0 %	56480472
65545	NC_004337	GCT	2	6	4103976	4103981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480472
65546	NC_004337	CCG	2	6	4104133	4104138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480472
65547	NC_004337	CTT	3	9	4104163	4104171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480472
65548	NC_004337	ATT	2	6	4104206	4104211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56480472
65549	NC_004337	CAT	2	6	4104233	4104238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480472
65550	NC_004337	CAG	2	6	4104291	4104296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480472
65551	NC_004337	TAA	2	6	4104316	4104321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480472
65552	NC_004337	TCA	2	6	4104390	4104395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480472
65553	NC_004337	CGA	2	6	4104442	4104447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480472
65554	NC_004337	TG	4	8	4104478	4104485	0 %	50 %	50 %	0 %	56480472
65555	NC_004337	CCA	2	6	4104521	4104526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480472
65556	NC_004337	CCA	2	6	4104528	4104533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480472
65557	NC_004337	TGG	2	6	4104535	4104540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480472
65558	NC_004337	TCG	2	6	4104561	4104566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480472
65559	NC_004337	CAA	2	6	4104643	4104648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480472
65560	NC_004337	CGC	2	6	4104730	4104735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480472
65561	NC_004337	GCG	2	6	4104813	4104818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480473
65562	NC_004337	AATG	2	8	4104843	4104850	50 %	25 %	25 %	0 %	56480473
65563	NC_004337	GCC	2	6	4104990	4104995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480473
65564	NC_004337	ATC	2	6	4105015	4105020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480473
65565	NC_004337	CGGTT	2	10	4105053	4105062	0 %	40 %	40 %	20 %	56480473
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65567	NC_004337	CGC	2	6	4105152	4105157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480473
65568	NC_004337	GGC	2	6	4105162	4105167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480473
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65570	NC_004337	CAG	2	6	4105218	4105223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480473
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65573	NC_004337	GGA	2	6	4105321	4105326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56480473
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65585	NC_004337	GC	3	6	4105712	4105717	0 %	0 %	50 %	50 %	56480473
65586	NC_004337	CCA	2	6	4105772	4105777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480473
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65588	NC_004337	CGCC	2	8	4105817	4105824	0 %	0 %	25 %	75 %	56480473
65589	NC_004337	TCA	2	6	4105835	4105840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480473
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65601	NC_004337	CGC	2	6	4106361	4106366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115194
65602	NC_004337	AAT	2	6	4106450	4106455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24115194
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65604	NC_004337	T	6	6	4106529	4106534	0 %	100 %	0 %	0 %	24115194
65605	NC_004337	GCA	3	9	4106538	4106546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115194
65606	NC_004337	CTT	2	6	4106997	4107002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115195
65607	NC_004337	AT	3	6	4107056	4107061	50 %	50 %	0 %	0 %	24115195
65608	NC_004337	CCA	2	6	4107064	4107069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24115195
65609	NC_004337	TTC	2	6	4107109	4107114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24115195
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65612	NC_004337	CAG	2	6	4108502	4108507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480474
65613	NC_004337	CGCC	2	8	4108528	4108535	0 %	0 %	25 %	75 %	56480474
65614	NC_004337	ACGC	2	8	4108573	4108580	25 %	0 %	25 %	50 %	56480474
65615	NC_004337	T	6	6	4108589	4108594	0 %	100 %	0 %	0 %	56480474
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