MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_004337	GT	3	6	4011604	4011609	0 %	50 %	50 %	0 %	56480441
64002	NC_004337	GC	3	6	4011625	4011630	0 %	0 %	50 %	50 %	56480441
64003	NC_004337	GCC	2	6	4011639	4011644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480441
64004	NC_004337	CCAGGG	2	12	4011793	4011804	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56480441
64005	NC_004337	TGG	2	6	4011816	4011821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480441
64006	NC_004337	T	7	7	4012515	4012521	0 %	100 %	0 %	0 %	24115111
64007	NC_004337	TC	3	6	4012616	4012621	0 %	50 %	0 %	50 %	24115111
64008	NC_004337	TTGCC	2	10	4012623	4012632	0 %	40 %	20 %	40 %	24115111
64009	NC_004337	ATG	2	6	4012678	4012683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64010	NC_004337	TTG	2	6	4012694	4012699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24115111
64011	NC_004337	CAT	2	6	4012752	4012757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115111
64012	NC_004337	CCG	2	6	4012833	4012838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24115111
64013	NC_004337	ACGCC	2	10	4012871	4012880	20 %	0 %	20 %	60 %	24115111
64014	NC_004337	CTG	2	6	4012906	4012911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115111
64015	NC_004337	GT	3	6	4012922	4012927	0 %	50 %	50 %	0 %	24115111
64016	NC_004337	CTG	2	6	4013047	4013052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115111
64017	NC_004337	GAA	2	6	4013076	4013081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115111
64018	NC_004337	TTA	2	6	4013154	4013159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24115111
64019	NC_004337	GAT	2	6	4013211	4013216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64020	NC_004337	ATC	2	6	4013270	4013275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115111
64021	NC_004337	A	6	6	4013307	4013312	100 %	0 %	0 %	0 %	24115111
64022	NC_004337	CTG	2	6	4013347	4013352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115111
64023	NC_004337	CTG	2	6	4013383	4013388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115111
64024	NC_004337	GACG	2	8	4013397	4013404	25 %	0 %	50 %	25 %	24115111
64025	NC_004337	GAA	2	6	4013422	4013427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115111
64026	NC_004337	GAT	2	6	4013589	4013594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64027	NC_004337	TGA	2	6	4013663	4013668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64028	NC_004337	TGA	2	6	4013675	4013680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64029	NC_004337	TGA	2	6	4013717	4013722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115111
64030	NC_004337	CGA	2	6	4013759	4013764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115111
64031	NC_004337	GAAGGG	2	12	4013765	4013776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24115111
64032	NC_004337	CAGT	2	8	4013836	4013843	25 %	25 %	25 %	25 %	24115111
64033	NC_004337	ACTG	2	8	4013850	4013857	25 %	25 %	25 %	25 %	24115111
64034	NC_004337	GAC	3	9	4014671	4014679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480442
64035	NC_004337	CCCG	2	8	4014723	4014730	0 %	0 %	25 %	75 %	56480442
64036	NC_004337	GAC	3	9	4014770	4014778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480442
64037	NC_004337	CTT	4	12	4014796	4014807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480442
64038	NC_004337	GTC	2	6	4014864	4014869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480442
64039	NC_004337	GCGTGA	2	12	4014880	4014891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56480442
64040	NC_004337	TGC	2	6	4014963	4014968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480442
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64042	NC_004337	GC	3	6	4015156	4015161	0 %	0 %	50 %	50 %	56480442
64043	NC_004337	CTG	2	6	4015244	4015249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480442
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64045	NC_004337	CAT	2	6	4015330	4015335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480442
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64047	NC_004337	CGT	2	6	4015357	4015362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480442
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64049	NC_004337	GAA	2	6	4015504	4015509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480442
64050	NC_004337	GCT	2	6	4015633	4015638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480443
64051	NC_004337	CAA	2	6	4015676	4015681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480443
64052	NC_004337	T	6	6	4015719	4015724	0 %	100 %	0 %	0 %	56480443
64053	NC_004337	AAAT	2	8	4015740	4015747	75 %	25 %	0 %	0 %	56480443
64054	NC_004337	AGA	2	6	4015760	4015765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480443
64055	NC_004337	TGC	2	6	4015821	4015826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480443
64056	NC_004337	ATC	2	6	4015914	4015919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480443
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64058	NC_004337	TGA	2	6	4015963	4015968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480444
64059	NC_004337	A	7	7	4016018	4016024	100 %	0 %	0 %	0 %	56480444
64060	NC_004337	TGA	2	6	4016070	4016075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480444
64061	NC_004337	GAT	2	6	4016080	4016085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480444
64062	NC_004337	AT	3	6	4016084	4016089	50 %	50 %	0 %	0 %	56480444
64063	NC_004337	TA	4	8	4016119	4016126	50 %	50 %	0 %	0 %	56480444
64064	NC_004337	TGA	2	6	4016163	4016168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480444
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64071	NC_004337	CAGC	2	8	4016548	4016555	25 %	0 %	25 %	50 %	24115115
64072	NC_004337	A	6	6	4016585	4016590	100 %	0 %	0 %	0 %	24115115
64073	NC_004337	GA	3	6	4016601	4016606	50 %	0 %	50 %	0 %	24115115
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64095	NC_004337	CATC	2	8	4017313	4017320	25 %	25 %	0 %	50 %	24115115
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64102	NC_004337	CAT	2	6	4017689	4017694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915362
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64104	NC_004337	ATC	2	6	4017839	4017844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915362
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64111	NC_004337	TGG	2	6	4018595	4018600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115117
64112	NC_004337	AT	3	6	4018632	4018637	50 %	50 %	0 %	0 %	24115117
64113	NC_004337	TAC	2	6	4018642	4018647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115117
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64118	NC_004337	TGG	2	6	4019151	4019156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480445
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