MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_004337	TAC	2	6	3950068	3950073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480427
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63004	NC_004337	AAGT	2	8	3950245	3950252	50 %	25 %	25 %	0 %	532141311
63005	NC_004337	GCC	2	6	3950380	3950385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141311
63006	NC_004337	TGC	2	6	3950439	3950444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141311
63007	NC_004337	AGGC	2	8	3950449	3950456	25 %	0 %	50 %	25 %	532141311
63008	NC_004337	CAGA	2	8	3950466	3950473	50 %	0 %	25 %	25 %	532141311
63009	NC_004337	TGA	2	6	3950503	3950508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141311
63010	NC_004337	TCT	2	6	3950515	3950520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532141311
63011	NC_004337	CCA	2	6	3950526	3950531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532141311
63012	NC_004337	TCGCGG	2	12	3950592	3950603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532141311
63013	NC_004337	ACTC	2	8	3950658	3950665	25 %	25 %	0 %	50 %	532141311
63014	NC_004337	TGT	2	6	3950788	3950793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532141311
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63017	NC_004337	CAG	2	6	3956814	3956819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115060
63018	NC_004337	TTTAG	2	10	3956921	3956930	20 %	60 %	20 %	0 %	24115060
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63023	NC_004337	AGT	2	6	3957257	3957262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115060
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63230	NC_004337	GCGGGT	2	12	3969306	3969317	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56480432
63231	NC_004337	CGG	2	6	3969394	3969399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480432
63232	NC_004337	GGC	2	6	3969416	3969421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480432
63233	NC_004337	GC	3	6	3969420	3969425	0 %	0 %	50 %	50 %	56480432
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63472	NC_004337	TGA	2	6	3981084	3981089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115081
63473	NC_004337	GGT	2	6	3981107	3981112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115082
63474	NC_004337	ATC	2	6	3981146	3981151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115082
63475	NC_004337	AACGA	2	10	3981152	3981161	60 %	0 %	20 %	20 %	24115082
63476	NC_004337	GGT	2	6	3981169	3981174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115082
63477	NC_004337	AGCG	2	8	3981233	3981240	25 %	0 %	50 %	25 %	24115082
63478	NC_004337	GCG	2	6	3981416	3981421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24115082
63479	NC_004337	A	6	6	3981452	3981457	100 %	0 %	0 %	0 %	24115082
63480	NC_004337	TCA	2	6	3981472	3981477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115082
63481	NC_004337	CGA	2	6	3981487	3981492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115082
63482	NC_004337	GAT	2	6	3981518	3981523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115082
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63484	NC_004337	CAG	2	6	3981580	3981585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115082
63485	NC_004337	GC	3	6	3981598	3981603	0 %	0 %	50 %	50 %	24115082
63486	NC_004337	TGA	2	6	3981693	3981698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24115082
63487	NC_004337	GCA	2	6	3981745	3981750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24115082
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63491	NC_004337	TGT	2	6	3981868	3981873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24115082
63492	NC_004337	GCT	2	6	3981889	3981894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24115082
63493	NC_004337	GAA	2	6	3981896	3981901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24115082
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63495	NC_004337	TGGC	2	8	3982021	3982028	0 %	25 %	50 %	25 %	24115082
63496	NC_004337	TGG	2	6	3982094	3982099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24115082
63497	NC_004337	TAT	2	6	3982180	3982185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24115083
63498	NC_004337	GGCG	2	8	3982189	3982196	0 %	0 %	75 %	25 %	24115083
63499	NC_004337	CG	3	6	3982224	3982229	0 %	0 %	50 %	50 %	24115083
63500	NC_004337	TCA	3	9	3982320	3982328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24115083

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