MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_004337	GCGCC	2	10	3860139	3860148	0 %	0 %	40 %	60 %	24114978
61503	NC_004337	CGG	2	6	3860274	3860279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114978
61504	NC_004337	CGG	2	6	3860316	3860321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114978
61505	NC_004337	GCC	2	6	3860592	3860597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114979
61506	NC_004337	CTT	2	6	3860625	3860630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114979
61507	NC_004337	AAT	2	6	3860658	3860663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114979
61508	NC_004337	TGG	2	6	3860675	3860680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114979
61509	NC_004337	CCG	2	6	3860695	3860700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114979
61510	NC_004337	TAAA	2	8	3860707	3860714	75 %	25 %	0 %	0 %	24114979
61511	NC_004337	ACA	2	6	3860735	3860740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114979
61512	NC_004337	CGCC	2	8	3860779	3860786	0 %	0 %	25 %	75 %	24114979
61513	NC_004337	AAC	2	6	3860827	3860832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114979
61514	NC_004337	GAAC	2	8	3860850	3860857	50 %	0 %	25 %	25 %	24114979
61515	NC_004337	CAG	2	6	3860883	3860888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114979
61516	NC_004337	GCC	2	6	3860952	3860957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114979
61517	NC_004337	GAG	2	6	3860959	3860964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24114979
61518	NC_004337	CG	3	6	3860984	3860989	0 %	0 %	50 %	50 %	24114979
61519	NC_004337	AGA	2	6	3861017	3861022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114979
61520	NC_004337	CAG	2	6	3861039	3861044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114979
61521	NC_004337	AAT	2	6	3861096	3861101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114979
61522	NC_004337	AC	3	6	3861141	3861146	50 %	0 %	0 %	50 %	24114979
61523	NC_004337	GTG	2	6	3861190	3861195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114979
61524	NC_004337	TGG	2	6	3861197	3861202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114979
61525	NC_004337	GAA	3	9	3861231	3861239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114979
61526	NC_004337	GGC	2	6	3861303	3861308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114979
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61528	NC_004337	CCA	2	6	3861673	3861678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114979
61529	NC_004337	T	7	7	3861724	3861730	0 %	100 %	0 %	0 %	24114979
61530	NC_004337	ATG	2	6	3861745	3861750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114979
61531	NC_004337	TTAA	2	8	3861833	3861840	50 %	50 %	0 %	0 %	56480408
61532	NC_004337	CTT	2	6	3861842	3861847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
61533	NC_004337	CGC	2	6	3861912	3861917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
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61535	NC_004337	GC	3	6	3861979	3861984	0 %	0 %	50 %	50 %	56480408
61536	NC_004337	GCA	2	6	3861998	3862003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
61537	NC_004337	GTT	2	6	3862022	3862027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480408
61538	NC_004337	GCA	2	6	3862148	3862153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
61539	NC_004337	CCGC	2	8	3862183	3862190	0 %	0 %	25 %	75 %	56480408
61540	NC_004337	CTG	2	6	3862191	3862196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
61541	NC_004337	CGATA	2	10	3862247	3862256	40 %	20 %	20 %	20 %	56480408
61542	NC_004337	AGCC	2	8	3862257	3862264	25 %	0 %	25 %	50 %	56480408
61543	NC_004337	CGC	2	6	3862313	3862318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
61544	NC_004337	GCC	2	6	3862326	3862331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
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61547	NC_004337	GCC	2	6	3862419	3862424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480408
61548	NC_004337	TCTT	2	8	3862441	3862448	0 %	75 %	0 %	25 %	56480408
61549	NC_004337	GCT	2	6	3862532	3862537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
61550	NC_004337	TGA	2	6	3862538	3862543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
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61553	NC_004337	ACC	2	6	3862647	3862652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480408
61554	NC_004337	CTT	2	6	3862706	3862711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
61555	NC_004337	ACGC	2	8	3862761	3862768	25 %	0 %	25 %	50 %	56480408
61556	NC_004337	CTT	2	6	3862781	3862786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480408
61557	NC_004337	CCA	2	6	3862865	3862870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480408
61558	NC_004337	TGC	2	6	3862874	3862879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
61559	NC_004337	T	6	6	3862905	3862910	0 %	100 %	0 %	0 %	56480408
61560	NC_004337	TAG	2	6	3863011	3863016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
61561	NC_004337	TCG	2	6	3863038	3863043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480408
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61563	NC_004337	CTGC	2	8	3863057	3863064	0 %	25 %	25 %	50 %	56480408
61564	NC_004337	CAG	2	6	3863130	3863135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480408
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61567	NC_004337	AGT	2	6	3863184	3863189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480408
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61570	NC_004337	TCCT	2	8	3863677	3863684	0 %	50 %	0 %	50 %	24114982
61571	NC_004337	GTG	2	6	3863702	3863707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114982
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61573	NC_004337	GTGAT	2	10	3863951	3863960	20 %	40 %	40 %	0 %	24114983
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61583	NC_004337	CTG	2	6	3864647	3864652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114984
61584	NC_004337	CAG	2	6	3864674	3864679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114984
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61586	NC_004337	GC	3	6	3864764	3864769	0 %	0 %	50 %	50 %	24114984
61587	NC_004337	GCC	2	6	3864776	3864781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114984
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61590	NC_004337	TTCAC	2	10	3864882	3864891	20 %	40 %	0 %	40 %	24114984
61591	NC_004337	GTG	2	6	3865011	3865016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114984
61592	NC_004337	CG	3	6	3865064	3865069	0 %	0 %	50 %	50 %	24114984
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61601	NC_004337	CG	3	6	3865586	3865591	0 %	0 %	50 %	50 %	24114984
61602	NC_004337	CAG	2	6	3865652	3865657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114984
61603	NC_004337	CGC	2	6	3865876	3865881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114984
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