MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_004337	GAC	2	6	3828331	3828336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480401
61002	NC_004337	ACTG	2	8	3828388	3828395	25 %	25 %	25 %	25 %	56480401
61003	NC_004337	CAC	2	6	3828543	3828548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480401
61004	NC_004337	AGT	2	6	3828613	3828618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480401
61005	NC_004337	TAC	2	6	3828709	3828714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480401
61006	NC_004337	ACT	2	6	3828779	3828784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480401
61007	NC_004337	GA	3	6	3829721	3829726	50 %	0 %	50 %	0 %	24114949
61008	NC_004337	AT	3	6	3829727	3829732	50 %	50 %	0 %	0 %	24114949
61009	NC_004337	TGC	2	6	3829760	3829765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114949
61010	NC_004337	AAAC	2	8	3829816	3829823	75 %	0 %	0 %	25 %	24114949
61011	NC_004337	CAA	2	6	3829837	3829842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114949
61012	NC_004337	TGT	2	6	3829843	3829848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114949
61013	NC_004337	GCA	2	6	3829875	3829880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114949
61014	NC_004337	AT	3	6	3829888	3829893	50 %	50 %	0 %	0 %	24114949
61015	NC_004337	GA	3	6	3829907	3829912	50 %	0 %	50 %	0 %	24114949
61016	NC_004337	ATCTTG	2	12	3829915	3829926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	24114949
61017	NC_004337	A	6	6	3829979	3829984	100 %	0 %	0 %	0 %	24114949
61018	NC_004337	TC	3	6	3830009	3830014	0 %	50 %	0 %	50 %	24114949
61019	NC_004337	GCA	2	6	3830034	3830039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114949
61020	NC_004337	AGG	2	6	3830063	3830068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24114949
61021	NC_004337	TCT	2	6	3830139	3830144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114949
61022	NC_004337	GTT	2	6	3830151	3830156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114949
61023	NC_004337	AGA	2	6	3830160	3830165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114949
61024	NC_004337	TAAA	2	8	3830194	3830201	75 %	25 %	0 %	0 %	24114949
61025	NC_004337	TGT	2	6	3830204	3830209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114949
61026	NC_004337	ACA	2	6	3830247	3830252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114949
61027	NC_004337	A	8	8	3830300	3830307	100 %	0 %	0 %	0 %	24114949
61028	NC_004337	GGA	2	6	3830331	3830336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24114949
61029	NC_004337	CAT	2	6	3830338	3830343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114949
61030	NC_004337	TTA	2	6	3830344	3830349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114949
61031	NC_004337	CAA	2	6	3830368	3830373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114949
61032	NC_004337	GCGA	2	8	3830513	3830520	25 %	0 %	50 %	25 %	24114950
61033	NC_004337	TGC	2	6	3830583	3830588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114950
61034	NC_004337	CT	3	6	3830650	3830655	0 %	50 %	0 %	50 %	24114950
61035	NC_004337	CCG	2	6	3830684	3830689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114950
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61037	NC_004337	CCACT	2	10	3830769	3830778	20 %	20 %	0 %	60 %	24114950
61038	NC_004337	GAC	2	6	3830782	3830787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114950
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61040	NC_004337	GCC	2	6	3830856	3830861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114950
61041	NC_004337	CAGTG	2	10	3830875	3830884	20 %	20 %	40 %	20 %	24114950
61042	NC_004337	CAG	2	6	3830896	3830901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114950
61043	NC_004337	TC	4	8	3830925	3830932	0 %	50 %	0 %	50 %	24114950
61044	NC_004337	CAG	2	6	3830941	3830946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114950
61045	NC_004337	CTTT	2	8	3830980	3830987	0 %	75 %	0 %	25 %	24114950
61046	NC_004337	CAG	2	6	3831029	3831034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114950
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61050	NC_004337	GAC	2	6	3831218	3831223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114950
61051	NC_004337	GCG	2	6	3831225	3831230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114950
61052	NC_004337	CCAT	2	8	3831232	3831239	25 %	25 %	0 %	50 %	24114950
61053	NC_004337	T	6	6	3831354	3831359	0 %	100 %	0 %	0 %	344915353
61054	NC_004337	CTT	2	6	3831379	3831384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915353
61055	NC_004337	GAG	2	6	3831386	3831391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344915353
61056	NC_004337	GGC	2	6	3831449	3831454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915353
61057	NC_004337	AAC	2	6	3831473	3831478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915353
61058	NC_004337	CGG	2	6	3831487	3831492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915353
61059	NC_004337	CAG	2	6	3831496	3831501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915353
61060	NC_004337	CTTC	2	8	3831507	3831514	0 %	50 %	0 %	50 %	344915353
61061	NC_004337	CTGG	2	8	3831542	3831549	0 %	25 %	50 %	25 %	344915353
61062	NC_004337	CTG	2	6	3831605	3831610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915353
61063	NC_004337	TG	3	6	3831630	3831635	0 %	50 %	50 %	0 %	344915353
61064	NC_004337	ATCA	2	8	3831668	3831675	50 %	25 %	0 %	25 %	344915353
61065	NC_004337	TAT	2	6	3831818	3831823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114952
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61067	NC_004337	GCTT	2	8	3832080	3832087	0 %	50 %	25 %	25 %	24114952
61068	NC_004337	A	7	7	3832098	3832104	100 %	0 %	0 %	0 %	24114952
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61072	NC_004337	GGC	2	6	3832432	3832437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114952
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61075	NC_004337	GC	3	6	3832594	3832599	0 %	0 %	50 %	50 %	24114952
61076	NC_004337	GCCA	2	8	3832629	3832636	25 %	0 %	25 %	50 %	24114952
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61083	NC_004337	ATG	2	6	3833098	3833103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114952
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61085	NC_004337	GAC	2	6	3833151	3833156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114952
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61087	NC_004337	GA	3	6	3833312	3833317	50 %	0 %	50 %	0 %	24114952
61088	NC_004337	CAA	2	6	3833349	3833354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114952
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61091	NC_004337	TC	3	6	3833417	3833422	0 %	50 %	0 %	50 %	24114952
61092	NC_004337	AAC	2	6	3833472	3833477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114952
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61103	NC_004337	ATA	2	6	3834013	3834018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114952
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61110	NC_004337	TCAGAT	2	12	3834609	3834620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24114953
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61114	NC_004337	TCC	2	6	3834801	3834806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24114953
61115	NC_004337	CAGC	2	8	3834829	3834836	25 %	0 %	25 %	50 %	24114953
61116	NC_004337	ATCAC	2	10	3834893	3834902	40 %	20 %	0 %	40 %	24114953
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61470	NC_004337	CGAACC	2	12	3857966	3857977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	24114977
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