MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_004337	TAA	2	6	3529204	3529209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114686
56002	NC_004337	CGTC	2	8	3529559	3529566	0 %	25 %	25 %	50 %	24114687
56003	NC_004337	TA	3	6	3529573	3529578	50 %	50 %	0 %	0 %	24114687
56004	NC_004337	ATCG	2	8	3529598	3529605	25 %	25 %	25 %	25 %	24114687
56005	NC_004337	ATT	2	6	3529612	3529617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114687
56006	NC_004337	CGCTCG	2	12	3529628	3529639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24114687
56007	NC_004337	GTG	2	6	3529691	3529696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114687
56008	NC_004337	GCCT	2	8	3529745	3529752	0 %	25 %	25 %	50 %	24114687
56009	NC_004337	AGA	2	6	3529792	3529797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114687
56010	NC_004337	CAC	2	6	3529813	3529818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114687
56011	NC_004337	CTG	2	6	3529850	3529855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114687
56012	NC_004337	CCCG	2	8	3529874	3529881	0 %	0 %	25 %	75 %	24114687
56013	NC_004337	A	6	6	3529907	3529912	100 %	0 %	0 %	0 %	24114687
56014	NC_004337	CG	3	6	3529920	3529925	0 %	0 %	50 %	50 %	24114687
56015	NC_004337	GCA	2	6	3530002	3530007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114687
56016	NC_004337	CG	3	6	3530099	3530104	0 %	0 %	50 %	50 %	24114687
56017	NC_004337	GCG	2	6	3530193	3530198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114687
56018	NC_004337	GCG	2	6	3530229	3530234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114687
56019	NC_004337	ATT	2	6	3530305	3530310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114687
56020	NC_004337	CGG	2	6	3530323	3530328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114687
56021	NC_004337	TGT	2	6	3530331	3530336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114687
56022	NC_004337	TGA	2	6	3530341	3530346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114687
56023	NC_004337	TGC	2	6	3530379	3530384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114687
56024	NC_004337	CG	3	6	3530521	3530526	0 %	0 %	50 %	50 %	24114687
56025	NC_004337	CGCCAG	2	12	3530561	3530572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24114687
56026	NC_004337	GAACC	2	10	3530582	3530591	40 %	0 %	20 %	40 %	24114687
56027	NC_004337	GCCAC	2	10	3530610	3530619	20 %	0 %	20 %	60 %	24114687
56028	NC_004337	GCGT	2	8	3530634	3530641	0 %	25 %	50 %	25 %	24114687
56029	NC_004337	GCG	2	6	3530656	3530661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114687
56030	NC_004337	CTGG	2	8	3530665	3530672	0 %	25 %	50 %	25 %	24114687
56031	NC_004337	GTG	2	6	3530780	3530785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114687
56032	NC_004337	GCC	2	6	3530826	3530831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114687
56033	NC_004337	GCC	2	6	3530919	3530924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114687
56034	NC_004337	CTG	2	6	3530940	3530945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114687
56035	NC_004337	GAC	2	6	3530949	3530954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114687
56036	NC_004337	TGG	2	6	3531080	3531085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114688
56037	NC_004337	GGC	2	6	3531113	3531118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114688
56038	NC_004337	ACC	2	6	3531200	3531205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114688
56039	NC_004337	AAT	2	6	3531229	3531234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114688
56040	NC_004337	GC	3	6	3531236	3531241	0 %	0 %	50 %	50 %	24114688
56041	NC_004337	CAG	2	6	3531271	3531276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114688
56042	NC_004337	AAT	2	6	3531403	3531408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114688
56043	NC_004337	TCT	2	6	3531416	3531421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114688
56044	NC_004337	TTG	2	6	3531452	3531457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114688
56045	NC_004337	AGC	2	6	3531485	3531490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114688
56046	NC_004337	GTG	2	6	3531512	3531517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114688
56047	NC_004337	TTC	2	6	3531586	3531591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114688
56048	NC_004337	GCGCC	2	10	3531645	3531654	0 %	0 %	40 %	60 %	24114688
56049	NC_004337	ATG	2	6	3531658	3531663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114688
56050	NC_004337	CCA	2	6	3531738	3531743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114688
56051	NC_004337	CTG	2	6	3531766	3531771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114688
56052	NC_004337	ATA	2	6	3531785	3531790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114688
56053	NC_004337	TGTT	2	8	3531805	3531812	0 %	75 %	25 %	0 %	24114688
56054	NC_004337	ATT	2	6	3531832	3531837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56480337
56055	NC_004337	CAA	2	6	3531862	3531867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56480337
56056	NC_004337	TG	3	6	3531901	3531906	0 %	50 %	50 %	0 %	56480337
56057	NC_004337	CAAA	2	8	3531928	3531935	75 %	0 %	0 %	25 %	56480337
56058	NC_004337	TGC	2	6	3532095	3532100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480337
56059	NC_004337	CGC	2	6	3532174	3532179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480337
56060	NC_004337	ACC	3	9	3532186	3532194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480337
56061	NC_004337	GGCCA	2	10	3532287	3532296	20 %	0 %	40 %	40 %	56480337
56062	NC_004337	ACC	2	6	3532344	3532349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480337
56063	NC_004337	ATC	3	9	3532359	3532367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480337
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56068	NC_004337	GCCA	2	8	3532545	3532552	25 %	0 %	25 %	50 %	56480337
56069	NC_004337	TGT	2	6	3532569	3532574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480337
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56076	NC_004337	CATCAC	2	12	3532843	3532854	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56480338
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56088	NC_004337	A	6	6	3533800	3533805	100 %	0 %	0 %	0 %	344915340
56089	NC_004337	GC	3	6	3533818	3533823	0 %	0 %	50 %	50 %	344915340
56090	NC_004337	TTC	2	6	3533860	3533865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915340
56091	NC_004337	CG	3	6	3533933	3533938	0 %	0 %	50 %	50 %	344915340
56092	NC_004337	TGGA	2	8	3534004	3534011	25 %	25 %	50 %	0 %	344915340
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56099	NC_004337	ATG	2	6	3534185	3534190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915340
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56101	NC_004337	ATG	2	6	3534239	3534244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915340
56102	NC_004337	GCT	2	6	3534261	3534266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915340
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56106	NC_004337	AG	3	6	3534369	3534374	50 %	0 %	50 %	0 %	344915340
56107	NC_004337	TGC	2	6	3534377	3534382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915340
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56464	NC_004337	A	6	6	3554178	3554183	100 %	0 %	0 %	0 %	24114706
56465	NC_004337	AAG	2	6	3554211	3554216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114706
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56468	NC_004337	ATC	2	6	3554350	3554355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480345
56469	NC_004337	TG	3	6	3554414	3554419	0 %	50 %	50 %	0 %	56480345
56470	NC_004337	CAG	2	6	3554464	3554469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480345
56471	NC_004337	TGG	2	6	3554528	3554533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480345
56472	NC_004337	CAC	2	6	3554587	3554592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480345
56473	NC_004337	GCA	2	6	3554598	3554603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480345
56474	NC_004337	GTG	2	6	3554606	3554611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480345
56475	NC_004337	CCAG	2	8	3554643	3554650	25 %	0 %	25 %	50 %	56480345
56476	NC_004337	CAC	2	6	3554665	3554670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480345
56477	NC_004337	CGA	2	6	3554686	3554691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480345
56478	NC_004337	CCA	2	6	3554733	3554738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480345
56479	NC_004337	ATC	2	6	3554776	3554781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480345
56480	NC_004337	TTA	2	6	3554789	3554794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56480345
56481	NC_004337	GGT	2	6	3554836	3554841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480345
56482	NC_004337	CACCGC	2	12	3554857	3554868	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56480345
56483	NC_004337	T	6	6	3554962	3554967	0 %	100 %	0 %	0 %	56480345
56484	NC_004337	TGCC	2	8	3555016	3555023	0 %	25 %	25 %	50 %	56480345
56485	NC_004337	GGCGTA	2	12	3555070	3555081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56480345
56486	NC_004337	GCATC	2	10	3555105	3555114	20 %	20 %	20 %	40 %	56480345
56487	NC_004337	TTC	2	6	3555134	3555139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480345
56488	NC_004337	GGA	2	6	3555190	3555195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56480345
56489	NC_004337	CGC	2	6	3555234	3555239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480345
56490	NC_004337	TCT	2	6	3555278	3555283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480345
56491	NC_004337	ATC	2	6	3555374	3555379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480345
56492	NC_004337	AGA	2	6	3555447	3555452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480345
56493	NC_004337	CAGC	2	8	3555510	3555517	25 %	0 %	25 %	50 %	56480345
56494	NC_004337	CGT	2	6	3555519	3555524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480345
56495	NC_004337	CCAGCG	2	12	3555600	3555611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56480345
56496	NC_004337	AGTG	2	8	3555655	3555662	25 %	25 %	50 %	0 %	56480345
56497	NC_004337	T	6	6	3555664	3555669	0 %	100 %	0 %	0 %	56480345
56498	NC_004337	ATC	2	6	3555688	3555693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480345
56499	NC_004337	ACC	3	9	3555784	3555792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480345
56500	NC_004337	CTGC	2	8	3555804	3555811	0 %	25 %	25 %	50 %	56480345

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