MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_004337	GAA	2	6	3471068	3471073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915335
55003	NC_004337	GCC	2	6	3471078	3471083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915335
55004	NC_004337	GCCA	2	8	3471098	3471105	25 %	0 %	25 %	50 %	344915335
55005	NC_004337	GAT	2	6	3471112	3471117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915335
55006	NC_004337	TGC	2	6	3471127	3471132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915335
55007	NC_004337	AAG	2	6	3471159	3471164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915335
55008	NC_004337	CGTTC	2	10	3471259	3471268	0 %	40 %	20 %	40 %	344915335
55009	NC_004337	ATG	2	6	3471285	3471290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915335
55010	NC_004337	CAC	2	6	3471301	3471306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915335
55011	NC_004337	TGGC	2	8	3471392	3471399	0 %	25 %	50 %	25 %	344915335
55012	NC_004337	CTA	2	6	3471436	3471441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915335
55013	NC_004337	CGC	2	6	3471476	3471481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915335
55014	NC_004337	GGT	2	6	3471488	3471493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915335
55015	NC_004337	TGG	2	6	3471495	3471500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915335
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55018	NC_004337	GCGG	2	8	3471693	3471700	0 %	0 %	75 %	25 %	56480322
55019	NC_004337	CAAA	2	8	3471704	3471711	75 %	0 %	0 %	25 %	56480322
55020	NC_004337	ATG	2	6	3471786	3471791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480322
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55023	NC_004337	CGC	2	6	3471910	3471915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480322
55024	NC_004337	GGC	2	6	3471931	3471936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480322
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55026	NC_004337	CGT	2	6	3472025	3472030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480322
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55028	NC_004337	ATG	2	6	3472042	3472047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480322
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55031	NC_004337	GC	3	6	3472105	3472110	0 %	0 %	50 %	50 %	56480322
55032	NC_004337	TGA	2	6	3472132	3472137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480322
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55035	NC_004337	CTG	2	6	3472365	3472370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480322
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55038	NC_004337	TGGG	2	8	3472520	3472527	0 %	25 %	75 %	0 %	24114637
55039	NC_004337	CTGG	2	8	3472714	3472721	0 %	25 %	50 %	25 %	24114637
55040	NC_004337	CCGCA	2	10	3472881	3472890	20 %	0 %	20 %	60 %	24114637
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55052	NC_004337	CGA	2	6	3473568	3473573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114638
55053	NC_004337	GCGCC	2	10	3473604	3473613	0 %	0 %	40 %	60 %	24114638
55054	NC_004337	TGA	2	6	3473740	3473745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114638
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55470	NC_004337	CAA	2	6	3497014	3497019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24114660
55471	NC_004337	TGA	2	6	3497134	3497139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114660
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55499	NC_004337	GCAGC	2	10	3498681	3498690	20 %	0 %	40 %	40 %	24114662
55500	NC_004337	TCG	2	6	3498704	3498709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114662

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