MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_004337	TGA	2	6	3405991	3405996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114556
54003	NC_004337	GAT	2	6	3406045	3406050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114556
54004	NC_004337	TGT	2	6	3406077	3406082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114556
54005	NC_004337	GT	3	6	3406081	3406086	0 %	50 %	50 %	0 %	24114556
54006	NC_004337	TGA	2	6	3406171	3406176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114556
54007	NC_004337	T	6	6	3406178	3406183	0 %	100 %	0 %	0 %	24114556
54008	NC_004337	GTC	2	6	3411826	3411831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480304
54009	NC_004337	T	7	7	3411876	3411882	0 %	100 %	0 %	0 %	56480304
54010	NC_004337	TCT	2	6	3411885	3411890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480304
54011	NC_004337	TGTT	2	8	3411895	3411902	0 %	75 %	25 %	0 %	56480304
54012	NC_004337	T	6	6	3411904	3411909	0 %	100 %	0 %	0 %	56480304
54013	NC_004337	TGC	2	6	3411919	3411924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480304
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54015	NC_004337	T	6	6	3411945	3411950	0 %	100 %	0 %	0 %	56480304
54016	NC_004337	AAT	2	6	3411977	3411982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480304
54017	NC_004337	CGA	2	6	3412087	3412092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480304
54018	NC_004337	TGA	2	6	3412126	3412131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480304
54019	NC_004337	GCAC	2	8	3412190	3412197	25 %	0 %	25 %	50 %	56480304
54020	NC_004337	TTGG	2	8	3412337	3412344	0 %	50 %	50 %	0 %	56480304
54021	NC_004337	TAG	2	6	3412374	3412379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480304
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54024	NC_004337	TGA	2	6	3412486	3412491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480304
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54028	NC_004337	T	6	6	3412759	3412764	0 %	100 %	0 %	0 %	24114558
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54053	NC_004337	CAG	2	6	3413939	3413944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480306
54054	NC_004337	A	6	6	3413946	3413951	100 %	0 %	0 %	0 %	56480306
54055	NC_004337	GTCA	2	8	3413968	3413975	25 %	25 %	25 %	25 %	56480306
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54089	NC_004337	AATG	2	8	3416027	3416034	50 %	25 %	25 %	0 %	56480309
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54103	NC_004337	AGA	2	6	3416636	3416641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114564
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54118	NC_004337	GTC	3	9	3417296	3417304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114565
54119	NC_004337	CTG	2	6	3417377	3417382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114565
54120	NC_004337	TGC	2	6	3417397	3417402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114565
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54125	NC_004337	GCA	2	6	3417698	3417703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114565
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54218	NC_004337	GTC	2	6	3422793	3422798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114570
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54221	NC_004337	CGCC	2	8	3423001	3423008	0 %	0 %	25 %	75 %	24114570
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54224	NC_004337	A	6	6	3423346	3423351	100 %	0 %	0 %	0 %	24114570
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54230	NC_004337	CTG	2	6	3423506	3423511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114570
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54233	NC_004337	GTAT	2	8	3423693	3423700	25 %	50 %	25 %	0 %	24114571
54234	NC_004337	TGT	2	6	3423812	3423817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114571
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