MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_004337	GAA	2	6	3318761	3318766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114467
52503	NC_004337	CAG	2	6	3318821	3318826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114467
52504	NC_004337	TTC	2	6	3318833	3318838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114467
52505	NC_004337	TCTT	2	8	3318933	3318940	0 %	75 %	0 %	25 %	24114467
52506	NC_004337	CCAG	2	8	3319090	3319097	25 %	0 %	25 %	50 %	24114467
52507	NC_004337	CCA	2	6	3319414	3319419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114468
52508	NC_004337	CCG	2	6	3319444	3319449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114468
52509	NC_004337	CAG	2	6	3319517	3319522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114468
52510	NC_004337	TCA	2	6	3319528	3319533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114468
52511	NC_004337	TCA	2	6	3319539	3319544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114468
52512	NC_004337	GAA	2	6	3319558	3319563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114468
52513	NC_004337	GAT	2	6	3319607	3319612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114468
52514	NC_004337	GCC	2	6	3319622	3319627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114468
52515	NC_004337	ACCA	2	8	3319651	3319658	50 %	0 %	0 %	50 %	24114468
52516	NC_004337	AGC	2	6	3319664	3319669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114468
52517	NC_004337	TCA	2	6	3319725	3319730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114468
52518	NC_004337	CTT	2	6	3319832	3319837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114468
52519	NC_004337	GTT	2	6	3320032	3320037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114469
52520	NC_004337	TCA	2	6	3320108	3320113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114469
52521	NC_004337	CGC	2	6	3320459	3320464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114470
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52524	NC_004337	CTT	3	9	3320492	3320500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114470
52525	NC_004337	TTC	2	6	3320592	3320597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114470
52526	NC_004337	TTG	2	6	3320650	3320655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114470
52527	NC_004337	ATCA	2	8	3320670	3320677	50 %	25 %	0 %	25 %	24114470
52528	NC_004337	CTG	2	6	3320733	3320738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114470
52529	NC_004337	TTTC	2	8	3320765	3320772	0 %	75 %	0 %	25 %	24114470
52530	NC_004337	AGC	2	6	3320802	3320807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114470
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52532	NC_004337	TGA	2	6	3321213	3321218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114471
52533	NC_004337	CAG	2	6	3321307	3321312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114471
52534	NC_004337	GGC	2	6	3321354	3321359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114471
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52536	NC_004337	A	6	6	3321514	3321519	100 %	0 %	0 %	0 %	24114471
52537	NC_004337	GATA	2	8	3321552	3321559	50 %	25 %	25 %	0 %	24114471
52538	NC_004337	GCCA	2	8	3321571	3321578	25 %	0 %	25 %	50 %	24114471
52539	NC_004337	ATGAC	2	10	3321605	3321614	40 %	20 %	20 %	20 %	24114471
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52542	NC_004337	TGCC	2	8	3321844	3321851	0 %	25 %	25 %	50 %	24114471
52543	NC_004337	CTG	2	6	3321964	3321969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114471
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52545	NC_004337	GC	3	6	3322105	3322110	0 %	0 %	50 %	50 %	24114471
52546	NC_004337	ATT	2	6	3322198	3322203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114471
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52550	NC_004337	TGC	2	6	3322310	3322315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114471
52551	NC_004337	GGCG	2	8	3322365	3322372	0 %	0 %	75 %	25 %	24114471
52552	NC_004337	TA	3	6	3322415	3322420	50 %	50 %	0 %	0 %	24114471
52553	NC_004337	AGCG	2	8	3322443	3322450	25 %	0 %	50 %	25 %	24114471
52554	NC_004337	CTT	2	6	3322790	3322795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114472
52555	NC_004337	CGT	2	6	3322796	3322801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114472
52556	NC_004337	GTC	2	6	3322812	3322817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114472
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52559	NC_004337	ATC	2	6	3322872	3322877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114472
52560	NC_004337	CTT	2	6	3322910	3322915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114472
52561	NC_004337	TCA	2	6	3322949	3322954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114472
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52567	NC_004337	CAG	2	6	3323073	3323078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114472
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52571	NC_004337	CG	3	6	3323158	3323163	0 %	0 %	50 %	50 %	24114472
52572	NC_004337	ATCGAT	2	12	3323193	3323204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24114472
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52970	NC_004337	TCC	2	6	3344905	3344910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24114498
52971	NC_004337	CTC	2	6	3344946	3344951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24114498
52972	NC_004337	CGA	2	6	3344960	3344965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114498
52973	NC_004337	AGA	2	6	3345011	3345016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114498
52974	NC_004337	GCA	2	6	3345053	3345058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114498
52975	NC_004337	ACG	2	6	3345094	3345099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114498
52976	NC_004337	GCCAGC	2	12	3345103	3345114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24114498
52977	NC_004337	TCA	3	9	3345143	3345151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114498
52978	NC_004337	ATA	2	6	3345159	3345164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114498
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52982	NC_004337	AGCA	2	8	3345401	3345408	50 %	0 %	25 %	25 %	56480288
52983	NC_004337	GGT	2	6	3345439	3345444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480288
52984	NC_004337	TCC	2	6	3345498	3345503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56480288
52985	NC_004337	TGC	2	6	3345550	3345555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480288
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52989	NC_004337	CGGG	2	8	3345860	3345867	0 %	0 %	75 %	25 %	56480288
52990	NC_004337	AC	3	6	3345873	3345878	50 %	0 %	0 %	50 %	56480288
52991	NC_004337	CTG	2	6	3345908	3345913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480288
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52998	NC_004337	GC	3	6	3346790	3346795	0 %	0 %	50 %	50 %	344915330
52999	NC_004337	TGT	2	6	3346892	3346897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915330
53000	NC_004337	GCA	2	6	3347007	3347012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915330

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