MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_004337	GTG	2	6	3229702	3229707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114383
51002	NC_004337	TGA	2	6	3229721	3229726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114383
51003	NC_004337	TAT	2	6	3229731	3229736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114383
51004	NC_004337	AGC	2	6	3229766	3229771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114383
51005	NC_004337	TTC	2	6	3230465	3230470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114384
51006	NC_004337	CGG	2	6	3230492	3230497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114384
51007	NC_004337	TCG	2	6	3230525	3230530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51008	NC_004337	ACC	2	6	3230591	3230596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114384
51009	NC_004337	CTG	2	6	3230641	3230646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51010	NC_004337	AGT	2	6	3230673	3230678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114384
51011	NC_004337	CCTTC	2	10	3230690	3230699	0 %	40 %	0 %	60 %	24114384
51012	NC_004337	CGC	2	6	3230735	3230740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114384
51013	NC_004337	CTG	2	6	3230806	3230811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51014	NC_004337	ACC	2	6	3230881	3230886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114384
51015	NC_004337	TTCGC	2	10	3230942	3230951	0 %	40 %	20 %	40 %	24114384
51016	NC_004337	TCT	2	6	3230977	3230982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114384
51017	NC_004337	ACC	2	6	3230992	3230997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114384
51018	NC_004337	CTG	2	6	3231028	3231033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51019	NC_004337	TGG	2	6	3231059	3231064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114384
51020	NC_004337	TGG	2	6	3231068	3231073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114384
51021	NC_004337	TGGTG	2	10	3231086	3231095	0 %	40 %	60 %	0 %	24114384
51022	NC_004337	TCG	2	6	3231102	3231107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51023	NC_004337	TGC	2	6	3231125	3231130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51024	NC_004337	GT	3	6	3231149	3231154	0 %	50 %	50 %	0 %	24114384
51025	NC_004337	CTT	2	6	3231159	3231164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114384
51026	NC_004337	TG	3	6	3231206	3231211	0 %	50 %	50 %	0 %	24114384
51027	NC_004337	CCA	2	6	3231263	3231268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114384
51028	NC_004337	GGCG	2	8	3231276	3231283	0 %	0 %	75 %	25 %	24114384
51029	NC_004337	GCTG	2	8	3231309	3231316	0 %	25 %	50 %	25 %	24114384
51030	NC_004337	GCT	2	6	3231357	3231362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51031	NC_004337	TG	3	6	3231383	3231388	0 %	50 %	50 %	0 %	24114384
51032	NC_004337	G	6	6	3231411	3231416	0 %	0 %	100 %	0 %	24114384
51033	NC_004337	TGC	2	6	3231422	3231427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114384
51034	NC_004337	GGT	2	6	3231480	3231485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114384
51035	NC_004337	TAT	2	6	3231498	3231503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114384
51036	NC_004337	TAAT	2	8	3231615	3231622	50 %	50 %	0 %	0 %	24114384
51037	NC_004337	ATC	2	6	3231747	3231752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114385
51038	NC_004337	GCC	2	6	3231755	3231760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114385
51039	NC_004337	GAT	2	6	3231898	3231903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114385
51040	NC_004337	GCGT	2	8	3231967	3231974	0 %	25 %	50 %	25 %	24114385
51041	NC_004337	TGGCAC	2	12	3232006	3232017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24114385
51042	NC_004337	AGA	2	6	3232035	3232040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114385
51043	NC_004337	A	7	7	3232040	3232046	100 %	0 %	0 %	0 %	24114385
51044	NC_004337	GCT	2	6	3232078	3232083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114385
51045	NC_004337	TGT	2	6	3232115	3232120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114385
51046	NC_004337	GCCA	2	8	3232158	3232165	25 %	0 %	25 %	50 %	24114385
51047	NC_004337	CGC	2	6	3232271	3232276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114386
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51049	NC_004337	T	6	6	3232428	3232433	0 %	100 %	0 %	0 %	24114386
51050	NC_004337	CGC	2	6	3232437	3232442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114386
51051	NC_004337	TGG	2	6	3232454	3232459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114386
51052	NC_004337	GCA	2	6	3232622	3232627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114386
51053	NC_004337	GTG	2	6	3232687	3232692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114386
51054	NC_004337	CCGC	2	8	3232696	3232703	0 %	0 %	25 %	75 %	24114386
51055	NC_004337	TCG	2	6	3232804	3232809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114386
51056	NC_004337	GTA	2	6	3232870	3232875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114386
51057	NC_004337	CCG	2	6	3232876	3232881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114386
51058	NC_004337	ACC	2	6	3232950	3232955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114386
51059	NC_004337	TCA	2	6	3233059	3233064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114386
51060	NC_004337	CTG	2	6	3233067	3233072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114386
51061	NC_004337	ATGAA	2	10	3233083	3233092	60 %	20 %	20 %	0 %	24114386
51062	NC_004337	GTT	2	6	3233142	3233147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114386
51063	NC_004337	GCA	2	6	3233207	3233212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114386
51064	NC_004337	TCG	2	6	3233233	3233238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114386
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51067	NC_004337	CG	3	6	3233335	3233340	0 %	0 %	50 %	50 %	24114386
51068	NC_004337	CGA	2	6	3233410	3233415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114386
51069	NC_004337	GCAG	2	8	3233446	3233453	25 %	0 %	50 %	25 %	24114386
51070	NC_004337	CGC	2	6	3233535	3233540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114386
51071	NC_004337	TGA	2	6	3233579	3233584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114386
51072	NC_004337	AGTTC	2	10	3233764	3233773	20 %	40 %	20 %	20 %	56480255
51073	NC_004337	AGT	2	6	3233782	3233787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480255
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51075	NC_004337	CCG	2	6	3233842	3233847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480255
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51077	NC_004337	GCG	2	6	3233894	3233899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480255
51078	NC_004337	GTCA	2	8	3233939	3233946	25 %	25 %	25 %	25 %	56480255
51079	NC_004337	CAG	2	6	3233966	3233971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51080	NC_004337	ACC	2	6	3234028	3234033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480255
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51082	NC_004337	GCA	2	6	3234145	3234150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51083	NC_004337	TTC	2	6	3234155	3234160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480255
51084	NC_004337	TGCT	2	8	3234165	3234172	0 %	50 %	25 %	25 %	56480255
51085	NC_004337	CAG	2	6	3234173	3234178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51086	NC_004337	CAG	2	6	3234239	3234244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51087	NC_004337	GTT	2	6	3234260	3234265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480255
51088	NC_004337	GC	3	6	3234274	3234279	0 %	0 %	50 %	50 %	56480255
51089	NC_004337	CTG	2	6	3234290	3234295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51090	NC_004337	GCTC	2	8	3234367	3234374	0 %	25 %	25 %	50 %	56480255
51091	NC_004337	GCCA	2	8	3234383	3234390	25 %	0 %	25 %	50 %	56480255
51092	NC_004337	GC	3	6	3234395	3234400	0 %	0 %	50 %	50 %	56480255
51093	NC_004337	TTCG	2	8	3234422	3234429	0 %	50 %	25 %	25 %	56480255
51094	NC_004337	CAC	2	6	3234443	3234448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480255
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51100	NC_004337	CTG	2	6	3234731	3234736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480255
51101	NC_004337	ATG	2	6	3234738	3234743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480255
51102	NC_004337	CG	4	8	3234745	3234752	0 %	0 %	50 %	50 %	56480255
51103	NC_004337	CAG	2	6	3234770	3234775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480255
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51106	NC_004337	GC	3	6	3234984	3234989	0 %	0 %	50 %	50 %	56480255
51107	NC_004337	CTG	2	6	3235055	3235060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480255
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51113	NC_004337	TGCTG	2	10	3235901	3235910	0 %	40 %	40 %	20 %	56480256
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51115	NC_004337	CGGT	2	8	3235978	3235985	0 %	25 %	50 %	25 %	56480256
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51117	NC_004337	GAT	2	6	3236000	3236005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480256
51118	NC_004337	CGG	2	6	3236008	3236013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480256
51119	NC_004337	TTC	2	6	3236084	3236089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56480256
51120	NC_004337	GAT	2	6	3236099	3236104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480256
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51230	NC_004337	TGC	2	6	3242173	3242178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114397
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51468	NC_004337	GTT	2	6	3255594	3255599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114410
51469	NC_004337	CAC	2	6	3255722	3255727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114410
51470	NC_004337	GAAG	2	8	3255830	3255837	50 %	0 %	50 %	0 %	24114410
51471	NC_004337	ATG	2	6	3255870	3255875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114410
51472	NC_004337	CCAG	2	8	3255883	3255890	25 %	0 %	25 %	50 %	24114410
51473	NC_004337	TCA	2	6	3256030	3256035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114410
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51475	NC_004337	CAG	2	6	3256187	3256192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114410
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51480	NC_004337	CTGG	2	8	3256490	3256497	0 %	25 %	50 %	25 %	24114410
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51491	NC_004337	CGGG	2	8	3256805	3256812	0 %	0 %	75 %	25 %	24114411
51492	NC_004337	GCC	2	6	3256881	3256886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114411
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51499	NC_004337	TTA	2	6	3257340	3257345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114411
51500	NC_004337	GTT	2	6	3257476	3257481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114411

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