MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_004337	GCA	4	12	3169479	3169490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114333
50002	NC_004337	GCTCA	2	10	3169549	3169558	20 %	20 %	20 %	40 %	24114333
50003	NC_004337	TCCT	2	8	3169920	3169927	0 %	50 %	0 %	50 %	24114333
50004	NC_004337	CCAG	2	8	3169937	3169944	25 %	0 %	25 %	50 %	24114333
50005	NC_004337	TCG	2	6	3170075	3170080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114334
50006	NC_004337	TTA	2	6	3170096	3170101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114334
50007	NC_004337	CTG	2	6	3170134	3170139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114334
50008	NC_004337	AC	3	6	3170146	3170151	50 %	0 %	0 %	50 %	24114334
50009	NC_004337	CCA	2	6	3170157	3170162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114334
50010	NC_004337	CAT	2	6	3170380	3170385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114334
50011	NC_004337	GT	3	6	3170400	3170405	0 %	50 %	50 %	0 %	24114334
50012	NC_004337	T	6	6	3170429	3170434	0 %	100 %	0 %	0 %	24114335
50013	NC_004337	TGA	2	6	3170441	3170446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114335
50014	NC_004337	TGCAGC	2	12	3170447	3170458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24114335
50015	NC_004337	TCA	2	6	3170561	3170566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114335
50016	NC_004337	CCA	2	6	3170610	3170615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114335
50017	NC_004337	C	6	6	3170639	3170644	0 %	0 %	0 %	100 %	24114335
50018	NC_004337	ATC	2	6	3170750	3170755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114335
50019	NC_004337	TCA	2	6	3170834	3170839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114335
50020	NC_004337	GCG	2	6	3170867	3170872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114335
50021	NC_004337	CCG	2	6	3170893	3170898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114335
50022	NC_004337	A	7	7	3170958	3170964	100 %	0 %	0 %	0 %	24114335
50023	NC_004337	AAT	2	6	3170989	3170994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114335
50024	NC_004337	GAA	2	6	3171252	3171257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480244
50025	NC_004337	AGCA	2	8	3171338	3171345	50 %	0 %	25 %	25 %	56480244
50026	NC_004337	GCC	2	6	3171376	3171381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480244
50027	NC_004337	TGC	2	6	3171390	3171395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480244
50028	NC_004337	A	6	6	3171401	3171406	100 %	0 %	0 %	0 %	56480244
50029	NC_004337	GC	3	6	3171415	3171420	0 %	0 %	50 %	50 %	56480244
50030	NC_004337	CGCGA	2	10	3171478	3171487	20 %	0 %	40 %	40 %	56480244
50031	NC_004337	GCGT	2	8	3171558	3171565	0 %	25 %	50 %	25 %	56480244
50032	NC_004337	AGC	2	6	3171582	3171587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480244
50033	NC_004337	AAG	2	6	3171704	3171709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480244
50034	NC_004337	ACC	2	6	3171733	3171738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480244
50035	NC_004337	CG	3	6	3171787	3171792	0 %	0 %	50 %	50 %	56480244
50036	NC_004337	CGAA	2	8	3171812	3171819	50 %	0 %	25 %	25 %	56480244
50037	NC_004337	TAA	2	6	3171831	3171836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480244
50038	NC_004337	AGC	2	6	3171854	3171859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480244
50039	NC_004337	ACT	2	6	3171878	3171883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56480244
50040	NC_004337	GGC	2	6	3171894	3171899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480244
50041	NC_004337	GCT	2	6	3171948	3171953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480244
50042	NC_004337	AAG	2	6	3171956	3171961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56480244
50043	NC_004337	GTG	2	6	3172115	3172120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480244
50044	NC_004337	TTG	2	6	3172241	3172246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480244
50045	NC_004337	CGT	2	6	3172281	3172286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480244
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50048	NC_004337	AGT	2	6	3172330	3172335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480244
50049	NC_004337	ACAA	2	8	3172346	3172353	75 %	0 %	0 %	25 %	56480244
50050	NC_004337	TCGG	2	8	3172402	3172409	0 %	25 %	50 %	25 %	56480244
50051	NC_004337	TTG	2	6	3172421	3172426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480244
50052	NC_004337	ACC	2	6	3172441	3172446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480244
50053	NC_004337	CAAG	2	8	3172461	3172468	50 %	0 %	25 %	25 %	56480244
50054	NC_004337	CGT	2	6	3172668	3172673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480244
50055	NC_004337	CGCA	2	8	3172686	3172693	25 %	0 %	25 %	50 %	56480244
50056	NC_004337	ACC	2	6	3172696	3172701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480244
50057	NC_004337	TGA	2	6	3172729	3172734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480244
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50060	NC_004337	GCTG	3	12	3172977	3172988	0 %	25 %	50 %	25 %	24114337
50061	NC_004337	TGA	2	6	3172998	3173003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915320
50062	NC_004337	TC	3	6	3173011	3173016	0 %	50 %	0 %	50 %	344915320
50063	NC_004337	GAC	2	6	3173029	3173034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915320
50064	NC_004337	ACC	2	6	3173071	3173076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915320
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50067	NC_004337	AGCA	2	8	3173171	3173178	50 %	0 %	25 %	25 %	344915320
50068	NC_004337	TGGCA	2	10	3173190	3173199	20 %	20 %	40 %	20 %	344915320
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50072	NC_004337	CGACG	2	10	3173361	3173370	20 %	0 %	40 %	40 %	344915320
50073	NC_004337	CAGCC	2	10	3173387	3173396	20 %	0 %	20 %	60 %	344915320
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50100	NC_004337	CA	3	6	3174836	3174841	50 %	0 %	0 %	50 %	24114340
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50114	NC_004337	CTCAT	2	10	3175820	3175829	20 %	40 %	0 %	40 %	56480246
50115	NC_004337	AGC	2	6	3175855	3175860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480246
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50117	NC_004337	TGGCAG	2	12	3176145	3176156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56480246
50118	NC_004337	TGG	2	6	3176233	3176238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480246
50119	NC_004337	GGT	2	6	3176278	3176283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480246
50120	NC_004337	GGC	2	6	3176287	3176292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480246
50121	NC_004337	GGC	2	6	3176299	3176304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56480246
50122	NC_004337	TGG	2	6	3176319	3176324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56480246
50123	NC_004337	TGA	2	6	3176335	3176340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480246
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50132	NC_004337	TCA	2	6	3177117	3177122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114342
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50203	NC_004337	TCT	2	6	3184467	3184472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114352
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50222	NC_004337	GCG	2	6	3185139	3185144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24114352
50223	NC_004337	GCA	2	6	3185157	3185162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114352
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50227	NC_004337	GA	3	6	3185288	3185293	50 %	0 %	50 %	0 %	24114352
50228	NC_004337	CAG	2	6	3185302	3185307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114352
50229	NC_004337	ATCA	2	8	3185347	3185354	50 %	25 %	0 %	25 %	24114352
50230	NC_004337	ATC	2	6	3185387	3185392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114352
50231	NC_004337	GC	3	6	3185439	3185444	0 %	0 %	50 %	50 %	24114352
50232	NC_004337	CTT	2	6	3185508	3185513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114352
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50469	NC_004337	CAG	2	6	3197610	3197615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114363
50470	NC_004337	GCA	2	6	3197621	3197626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114363
50471	NC_004337	CAT	2	6	3197637	3197642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114363
50472	NC_004337	TTG	2	6	3197654	3197659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114363
50473	NC_004337	TGA	2	6	3197723	3197728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114363
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