MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 41052

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_004116	TCA	2	6	2158088	2158093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538308
41002	NC_004116	ATT	2	6	2158115	2158120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538308
41003	NC_004116	TGG	2	6	2158132	2158137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22538308
41004	NC_004116	TGG	2	6	2158183	2158188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22538308
41005	NC_004116	AGTAA	2	10	2158202	2158211	60 %	20 %	20 %	0 %	22538308
41006	NC_004116	TAA	2	6	2158216	2158221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538308
41007	NC_004116	ACA	2	6	2158232	2158237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538308
41008	NC_004116	GTT	2	6	2158265	2158270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538308
41009	NC_004116	ACA	2	6	2158288	2158293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538308
41010	NC_004116	AG	3	6	2158294	2158299	50 %	0 %	50 %	0 %	22538308
41011	NC_004116	T	7	7	2158330	2158336	0 %	100 %	0 %	0 %	22538308
41012	NC_004116	G	6	6	2158345	2158350	0 %	0 %	100 %	0 %	22538308
41013	NC_004116	A	6	6	2158403	2158408	100 %	0 %	0 %	0 %	22538308
41014	NC_004116	TGT	2	6	2158426	2158431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538308
41015	NC_004116	TAA	2	6	2158435	2158440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538308
41016	NC_004116	TTG	2	6	2158509	2158514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22538308
41017	NC_004116	CGT	2	6	2158540	2158545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22538308
41018	NC_004116	TCA	2	6	2158592	2158597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538308
41019	NC_004116	GAA	2	6	2158715	2158720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22538308
41020	NC_004116	TGC	2	6	2158756	2158761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22538308
41021	NC_004116	AATT	2	8	2158819	2158826	50 %	50 %	0 %	0 %	22538308
41022	NC_004116	TCT	2	6	2158838	2158843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22538308
41023	NC_004116	ATCAA	2	10	2158846	2158855	60 %	20 %	0 %	20 %	22538308
41024	NC_004116	ATG	2	6	2158914	2158919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538308
41025	NC_004116	ATCA	2	8	2158931	2158938	50 %	25 %	0 %	25 %	22538308
41026	NC_004116	AG	3	6	2158960	2158965	50 %	0 %	50 %	0 %	22538308
41027	NC_004116	TTA	2	6	2159016	2159021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538308
41028	NC_004116	GTA	2	6	2159060	2159065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538308
41029	NC_004116	AGT	2	6	2159143	2159148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538308
41030	NC_004116	CCA	2	6	2159182	2159187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22538308
41031	NC_004116	GTG	2	6	2159220	2159225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22538308
41032	NC_004116	AAAC	2	8	2159231	2159238	75 %	0 %	0 %	25 %	22538308
41033	NC_004116	AAC	2	6	2159280	2159285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22538308
41034	NC_004116	ATCA	2	8	2159421	2159428	50 %	25 %	0 %	25 %	22538309
41035	NC_004116	AGA	2	6	2159480	2159485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22538309
41036	NC_004116	ATT	2	6	2159526	2159531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538309
41037	NC_004116	CAG	2	6	2159542	2159547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538309
41038	NC_004116	ACG	2	6	2159576	2159581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538309
41039	NC_004116	TAA	2	6	2159639	2159644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538309
41040	NC_004116	TGA	2	6	2159645	2159650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22538309
41041	NC_004116	AAAAG	2	10	2159737	2159746	80 %	0 %	20 %	0 %	22538309
41042	NC_004116	AT	3	6	2159771	2159776	50 %	50 %	0 %	0 %	22538309
41043	NC_004116	TA	3	6	2159793	2159798	50 %	50 %	0 %	0 %	22538309
41044	NC_004116	ATACG	2	10	2159803	2159812	40 %	20 %	20 %	20 %	22538309
41045	NC_004116	ACT	2	6	2159813	2159818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538309
41046	NC_004116	GAA	2	6	2159850	2159855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22538309
41047	NC_004116	ACT	2	6	2159885	2159890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22538309
41048	NC_004116	GAC	2	6	2159959	2159964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22538309
41049	NC_004116	TTA	2	6	2159973	2159978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22538309
41050	NC_004116	AAGAA	2	10	2159983	2159992	80 %	0 %	20 %	0 %	22538309
41051	NC_004116	TAA	2	6	2160089	2160094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22538309
41052	NC_004116	AAG	2	6	2160133	2160138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22538309

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.