MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 41052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004116	TA	3	6	198327	198332	50 %	50 %	0 %	0 %	22536363
3502	NC_004116	ATA	2	6	198352	198357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536363
3503	NC_004116	TGT	2	6	198493	198498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536363
3504	NC_004116	TAA	2	6	198721	198726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536364
3505	NC_004116	TTA	2	6	198729	198734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536364
3506	NC_004116	TTA	2	6	198858	198863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536364
3507	NC_004116	GTC	2	6	198879	198884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536364
3508	NC_004116	CAT	3	9	199002	199010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536364
3509	NC_004116	GAA	2	6	199088	199093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536364
3510	NC_004116	GAG	2	6	199094	199099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536364
3511	NC_004116	TAAA	2	8	199109	199116	75 %	25 %	0 %	0 %	22536364
3512	NC_004116	ATT	2	6	199247	199252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536365
3513	NC_004116	TTG	2	6	199272	199277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536365
3514	NC_004116	ATA	2	6	199299	199304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536365
3515	NC_004116	GAG	2	6	199322	199327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536365
3516	NC_004116	ACT	2	6	199370	199375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536365
3517	NC_004116	TCT	2	6	199652	199657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536365
3518	NC_004116	AGA	2	6	199729	199734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536365
3519	NC_004116	GCT	2	6	199754	199759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536365
3520	NC_004116	GCA	2	6	199763	199768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536365
3521	NC_004116	GCTTTG	2	12	199779	199790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22536365
3522	NC_004116	GTT	2	6	199917	199922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536366
3523	NC_004116	ATT	2	6	199939	199944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3524	NC_004116	ATA	2	6	199970	199975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536366
3525	NC_004116	TCA	2	6	200030	200035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536366
3526	NC_004116	TTGT	2	8	200044	200051	0 %	75 %	25 %	0 %	22536366
3527	NC_004116	TAT	2	6	200052	200057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3528	NC_004116	AAC	2	6	200118	200123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536366
3529	NC_004116	TTA	2	6	200165	200170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3530	NC_004116	TGGT	2	8	200183	200190	0 %	50 %	50 %	0 %	22536366
3531	NC_004116	TTG	2	6	200210	200215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536366
3532	NC_004116	GGA	2	6	200224	200229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536366
3533	NC_004116	T	6	6	200239	200244	0 %	100 %	0 %	0 %	22536366
3534	NC_004116	TTCT	2	8	200262	200269	0 %	75 %	0 %	25 %	22536366
3535	NC_004116	TCAGT	2	10	200276	200285	20 %	40 %	20 %	20 %	22536366
3536	NC_004116	CAA	2	6	200348	200353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536366
3537	NC_004116	TAT	2	6	200373	200378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3538	NC_004116	TTG	2	6	200402	200407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536366
3539	NC_004116	ATG	2	6	200452	200457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536366
3540	NC_004116	GA	3	6	200544	200549	50 %	0 %	50 %	0 %	22536366
3541	NC_004116	GCG	2	6	200797	200802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22536366
3542	NC_004116	AAAT	2	8	200858	200865	75 %	25 %	0 %	0 %	22536366
3543	NC_004116	GGA	2	6	200925	200930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536366
3544	NC_004116	TCT	2	6	201056	201061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536366
3545	NC_004116	T	7	7	201141	201147	0 %	100 %	0 %	0 %	22536366
3546	NC_004116	GGT	2	6	201163	201168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536366
3547	NC_004116	A	6	6	201284	201289	100 %	0 %	0 %	0 %	22536366
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3550	NC_004116	ATT	3	9	201401	201409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3551	NC_004116	AG	3	6	201483	201488	50 %	0 %	50 %	0 %	22536366
3552	NC_004116	TAT	2	6	201536	201541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536366
3553	NC_004116	GGA	2	6	201621	201626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536366
3554	NC_004116	TGA	3	9	201649	201657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536366
3555	NC_004116	AGG	2	6	201702	201707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536367
3556	NC_004116	A	6	6	201753	201758	100 %	0 %	0 %	0 %	22536367
3557	NC_004116	T	7	7	201786	201792	0 %	100 %	0 %	0 %	22536367
3558	NC_004116	GAA	2	6	201809	201814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536367
3559	NC_004116	TTG	2	6	201864	201869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536367
3560	NC_004116	AAC	2	6	201948	201953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536367
3561	NC_004116	GAA	2	6	201982	201987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536367
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3563	NC_004116	AGCA	2	8	202020	202027	50 %	0 %	25 %	25 %	22536367
3564	NC_004116	A	6	6	202034	202039	100 %	0 %	0 %	0 %	22536367
3565	NC_004116	GTT	3	9	202082	202090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536367
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3567	NC_004116	GAT	2	6	202252	202257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536367
3568	NC_004116	GA	3	6	202311	202316	50 %	0 %	50 %	0 %	22536367
3569	NC_004116	AC	3	6	202547	202552	50 %	0 %	0 %	50 %	22536368
3570	NC_004116	CAAAA	2	10	202565	202574	80 %	0 %	0 %	20 %	22536368
3571	NC_004116	AT	3	6	202602	202607	50 %	50 %	0 %	0 %	22536368
3572	NC_004116	CTATT	2	10	202612	202621	20 %	60 %	0 %	20 %	22536368
3573	NC_004116	TTA	2	6	202644	202649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536368
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3575	NC_004116	TTGGT	2	10	202681	202690	0 %	60 %	40 %	0 %	22536368
3576	NC_004116	ATGT	2	8	202695	202702	25 %	50 %	25 %	0 %	22536368
3577	NC_004116	TGA	2	6	202756	202761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536368
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3580	NC_004116	TGT	2	6	202871	202876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536368
3581	NC_004116	TGGTAG	2	12	202882	202893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22536368
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3583	NC_004116	ATA	2	6	202994	202999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536368
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3588	NC_004116	CT	3	6	203261	203266	0 %	50 %	0 %	50 %	22536369
3589	NC_004116	GTT	2	6	203281	203286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536369
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3595	NC_004116	CAG	2	6	203444	203449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536369
3596	NC_004116	TTA	2	6	203501	203506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536369
3597	NC_004116	A	6	6	203521	203526	100 %	0 %	0 %	0 %	22536369
3598	NC_004116	AGC	2	6	203604	203609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536369
3599	NC_004116	TGG	2	6	203660	203665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536369
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3602	NC_004116	A	6	6	203920	203925	100 %	0 %	0 %	0 %	22536370
3603	NC_004116	ATT	2	6	203938	203943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536370
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3607	NC_004116	AAC	2	6	204076	204081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536371
3608	NC_004116	GTT	2	6	204099	204104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536371
3609	NC_004116	A	6	6	204234	204239	100 %	0 %	0 %	0 %	22536371
3610	NC_004116	ATG	2	6	204283	204288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536371
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3612	NC_004116	TTA	2	6	204385	204390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536371
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3614	NC_004116	A	6	6	204489	204494	100 %	0 %	0 %	0 %	22536371
3615	NC_004116	TTCG	2	8	204579	204586	0 %	50 %	25 %	25 %	22536371
3616	NC_004116	TGA	2	6	204644	204649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536371
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3622	NC_004116	ATT	2	6	204945	204950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536371
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3624	NC_004116	AGCTAA	2	12	205001	205012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536371
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3863	NC_004116	T	7	7	218583	218589	0 %	100 %	0 %	0 %	22536383
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3869	NC_004116	TTG	2	6	218918	218923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536383
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3871	NC_004116	ATC	2	6	219095	219100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536383
3872	NC_004116	ACA	2	6	219117	219122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536383
3873	NC_004116	A	6	6	219122	219127	100 %	0 %	0 %	0 %	22536383
3874	NC_004116	AGCG	2	8	219137	219144	25 %	0 %	50 %	25 %	22536383
3875	NC_004116	GA	3	6	219156	219161	50 %	0 %	50 %	0 %	22536383
3876	NC_004116	GGT	2	6	219171	219176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536383
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3880	NC_004116	GCA	2	6	219369	219374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536384
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3883	NC_004116	CTA	2	6	219561	219566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536384
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3886	NC_004116	TAT	2	6	219773	219778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536384
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3892	NC_004116	TTA	2	6	220041	220046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536384
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3897	NC_004116	T	6	6	220565	220570	0 %	100 %	0 %	0 %	22536385
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3905	NC_004116	AAGA	2	8	221061	221068	75 %	0 %	25 %	0 %	22536385
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3993	NC_004116	GCT	2	6	225155	225160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536389
3994	NC_004116	T	6	6	225229	225234	0 %	100 %	0 %	0 %	22536389
3995	NC_004116	CGA	2	6	225318	225323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536389
3996	NC_004116	TGCTA	2	10	225394	225403	20 %	40 %	20 %	20 %	22536389
3997	NC_004116	TGC	2	6	225538	225543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536389
3998	NC_004116	CAG	2	6	225567	225572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536389
3999	NC_004116	AGT	2	6	225580	225585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536389
4000	NC_004116	GAT	2	6	225626	225631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536389

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