MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 33753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32118	NC_004070	GCA	2	6	1811706	1811711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911320
32119	NC_004070	TCT	2	6	1811715	1811720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911320
32120	NC_004070	CCA	2	6	1811726	1811731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911320
32121	NC_004070	TCA	2	6	1811751	1811756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32122	NC_004070	TCC	2	6	1811816	1811821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21911320
32123	NC_004070	GAA	2	6	1811832	1811837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911320
32124	NC_004070	ATA	2	6	1811909	1811914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911320
32125	NC_004070	CACT	2	8	1811943	1811950	25 %	25 %	0 %	50 %	21911320
32126	NC_004070	TCA	2	6	1812039	1812044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32127	NC_004070	T	6	6	1812050	1812055	0 %	100 %	0 %	0 %	21911320
32128	NC_004070	ATTTA	2	10	1812107	1812116	40 %	60 %	0 %	0 %	21911320
32129	NC_004070	CAAGC	2	10	1812254	1812263	40 %	0 %	20 %	40 %	21911320
32130	NC_004070	GCT	2	6	1812297	1812302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911320
32131	NC_004070	TTTG	2	8	1812304	1812311	0 %	75 %	25 %	0 %	21911320
32132	NC_004070	GC	3	6	1812339	1812344	0 %	0 %	50 %	50 %	21911320
32133	NC_004070	ATC	2	6	1812371	1812376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32134	NC_004070	TAA	2	6	1812453	1812458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911320
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32136	NC_004070	CA	3	6	1812582	1812587	50 %	0 %	0 %	50 %	21911320
32137	NC_004070	TCT	2	6	1812693	1812698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911320
32138	NC_004070	CTT	2	6	1812778	1812783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911320
32139	NC_004070	GTA	2	6	1812785	1812790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911320
32140	NC_004070	TGT	2	6	1812791	1812796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911320
32141	NC_004070	CAA	2	6	1812922	1812927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911320
32142	NC_004070	TTC	2	6	1812956	1812961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911320
32143	NC_004070	TCA	2	6	1812993	1812998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32144	NC_004070	CCA	2	6	1813015	1813020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911320
32145	NC_004070	CAT	2	6	1813054	1813059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32146	NC_004070	GTC	2	6	1813157	1813162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911320
32147	NC_004070	CTG	2	6	1813171	1813176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911320
32148	NC_004070	ATC	2	6	1813211	1813216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911320
32149	NC_004070	TAGT	2	8	1813436	1813443	25 %	50 %	25 %	0 %	21911321
32150	NC_004070	TCA	2	6	1813569	1813574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911321
32151	NC_004070	AGC	2	6	1813655	1813660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911321
32152	NC_004070	AAT	2	6	1813679	1813684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911321
32153	NC_004070	CTT	2	6	1813738	1813743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911321
32154	NC_004070	CATTG	2	10	1813833	1813842	20 %	40 %	20 %	20 %	21911321
32155	NC_004070	CTT	2	6	1813888	1813893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911321
32156	NC_004070	TCCACA	2	12	1813941	1813952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	21911321
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32158	NC_004070	ATGG	2	8	1814033	1814040	25 %	25 %	50 %	0 %	21911321
32159	NC_004070	TCG	2	6	1814053	1814058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911321
32160	NC_004070	ATA	2	6	1814214	1814219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911321
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32162	NC_004070	CTC	2	6	1814282	1814287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21911321
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32173	NC_004070	CAT	2	6	1814881	1814886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911321
32174	NC_004070	GTAA	2	8	1814953	1814960	50 %	25 %	25 %	0 %	21911321
32175	NC_004070	GAC	2	6	1815041	1815046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911321
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32181	NC_004070	CAAA	2	8	1815410	1815417	75 %	0 %	0 %	25 %	21911322
32182	NC_004070	CTA	2	6	1815466	1815471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911322
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32184	NC_004070	TGC	2	6	1815623	1815628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911322
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32188	NC_004070	GAA	2	6	1815752	1815757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911322
32189	NC_004070	CCA	2	6	1815801	1815806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911322
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32200	NC_004070	C	6	6	1816787	1816792	0 %	0 %	0 %	100 %	21911322
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32209	NC_004070	TTA	3	9	1817040	1817048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911322
32210	NC_004070	CAAAA	2	10	1817054	1817063	80 %	0 %	0 %	20 %	21911322
32211	NC_004070	GT	3	6	1817081	1817086	0 %	50 %	50 %	0 %	21911322
32212	NC_004070	ACC	2	6	1817108	1817113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911322
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32214	NC_004070	AAG	2	6	1817430	1817435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911323
32215	NC_004070	T	6	6	1817440	1817445	0 %	100 %	0 %	0 %	21911323
32216	NC_004070	CAA	2	6	1817468	1817473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911323
32217	NC_004070	CT	3	6	1817505	1817510	0 %	50 %	0 %	50 %	21911323
32218	NC_004070	A	6	6	1817540	1817545	100 %	0 %	0 %	0 %	21911323
32219	NC_004070	CAT	2	6	1817573	1817578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911323
32220	NC_004070	AACT	2	8	1817601	1817608	50 %	25 %	0 %	25 %	21911323
32221	NC_004070	GTT	2	6	1817753	1817758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911323
32222	NC_004070	AAT	2	6	1817812	1817817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911323
32223	NC_004070	TGT	2	6	1817962	1817967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911323
32224	NC_004070	AAT	2	6	1817996	1818001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911323
32225	NC_004070	CCAATT	2	12	1818004	1818015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911323
32226	NC_004070	AAATTT	2	12	1818041	1818052	50 %	50 %	0 %	0 %	21911323
32227	NC_004070	CTT	2	6	1818365	1818370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911324
32228	NC_004070	AAAT	2	8	1818372	1818379	75 %	25 %	0 %	0 %	21911324
32229	NC_004070	TGAC	2	8	1818556	1818563	25 %	25 %	25 %	25 %	21911324
32230	NC_004070	TC	3	6	1818909	1818914	0 %	50 %	0 %	50 %	21911325
32231	NC_004070	TC	3	6	1818926	1818931	0 %	50 %	0 %	50 %	21911325
32232	NC_004070	TAT	2	6	1818973	1818978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911325
32233	NC_004070	TC	3	6	1818991	1818996	0 %	50 %	0 %	50 %	21911325
32234	NC_004070	CA	3	6	1819097	1819102	50 %	0 %	0 %	50 %	21911325
32235	NC_004070	AGC	2	6	1819180	1819185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911325
32236	NC_004070	ATT	2	6	1819295	1819300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911325
32237	NC_004070	AC	3	6	1819380	1819385	50 %	0 %	0 %	50 %	21911325
32238	NC_004070	CTT	2	6	1819425	1819430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911325
32239	NC_004070	CAT	2	6	1819511	1819516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911325
32240	NC_004070	A	6	6	1819553	1819558	100 %	0 %	0 %	0 %	21911325
32241	NC_004070	AAG	2	6	1819563	1819568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911325
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32243	NC_004070	T	6	6	1819617	1819622	0 %	100 %	0 %	0 %	21911325
32244	NC_004070	A	6	6	1819634	1819639	100 %	0 %	0 %	0 %	21911325
32245	NC_004070	GAT	2	6	1819644	1819649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911325
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32251	NC_004070	A	6	6	1819979	1819984	100 %	0 %	0 %	0 %	21911326
32252	NC_004070	CAG	2	6	1820080	1820085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911326
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32260	NC_004070	AGGCCT	2	12	1820507	1820518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21911326
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32275	NC_004070	ATT	2	6	1821279	1821284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911327
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32349	NC_004070	ATC	2	6	1826174	1826179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911331
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32351	NC_004070	CTG	2	6	1826229	1826234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911331
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32353	NC_004070	TTATA	2	10	1826307	1826316	40 %	60 %	0 %	0 %	21911331
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32473	NC_004070	T	7	7	1832561	1832567	0 %	100 %	0 %	0 %	21911339
32474	NC_004070	ATC	2	6	1832637	1832642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911339
32475	NC_004070	TGT	2	6	1832664	1832669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911339
32476	NC_004070	AATT	2	8	1832691	1832698	50 %	50 %	0 %	0 %	21911339
32477	NC_004070	ACA	2	6	1832738	1832743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911339
32478	NC_004070	AAC	2	6	1832941	1832946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911340
32479	NC_004070	AAAT	2	8	1832951	1832958	75 %	25 %	0 %	0 %	21911340
32480	NC_004070	AGCAA	2	10	1832963	1832972	60 %	0 %	20 %	20 %	21911340
32481	NC_004070	CAT	2	6	1833106	1833111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911340
32482	NC_004070	AACAA	2	10	1833164	1833173	80 %	0 %	0 %	20 %	21911340
32483	NC_004070	AACC	2	8	1833243	1833250	50 %	0 %	0 %	50 %	21911340
32484	NC_004070	ATTT	2	8	1833285	1833292	25 %	75 %	0 %	0 %	21911340
32485	NC_004070	ACT	2	6	1833293	1833298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911340
32486	NC_004070	TAC	2	6	1833444	1833449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911340
32487	NC_004070	TCA	2	6	1833572	1833577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911340
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32490	NC_004070	CTA	2	6	1833627	1833632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911340
32491	NC_004070	A	6	6	1833641	1833646	100 %	0 %	0 %	0 %	21911340
32492	NC_004070	TGA	2	6	1833647	1833652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911340
32493	NC_004070	A	6	6	1833657	1833662	100 %	0 %	0 %	0 %	21911340
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32495	NC_004070	CGA	2	6	1833731	1833736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911340
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32497	NC_004070	ATCA	2	8	1833754	1833761	50 %	25 %	0 %	25 %	21911340
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32499	NC_004070	T	6	6	1833916	1833921	0 %	100 %	0 %	0 %	21911340
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