MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 33753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_004070	ATC	2	6	1688238	1688243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911214
30003	NC_004070	CGA	2	6	1688250	1688255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911214
30004	NC_004070	CTG	2	6	1688281	1688286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911214
30005	NC_004070	AGA	2	6	1688296	1688301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911214
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30008	NC_004070	GAT	2	6	1688396	1688401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911214
30009	NC_004070	GAA	2	6	1688423	1688428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911214
30010	NC_004070	AATT	2	8	1688462	1688469	50 %	50 %	0 %	0 %	21911214
30011	NC_004070	CTG	2	6	1688596	1688601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911214
30012	NC_004070	TTC	2	6	1688606	1688611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911214
30013	NC_004070	CCA	2	6	1688650	1688655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911214
30014	NC_004070	TGG	2	6	1688689	1688694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21911214
30015	NC_004070	GTCA	2	8	1688831	1688838	25 %	25 %	25 %	25 %	21911214
30016	NC_004070	TGGC	2	8	1688863	1688870	0 %	25 %	50 %	25 %	21911214
30017	NC_004070	AAG	2	6	1688973	1688978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21911214
30018	NC_004070	ACC	2	6	1689051	1689056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911214
30019	NC_004070	GCA	2	6	1689201	1689206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911214
30020	NC_004070	CCA	2	6	1689274	1689279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911214
30021	NC_004070	ATA	2	6	1689343	1689348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911214
30022	NC_004070	TCT	2	6	1689425	1689430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911215
30023	NC_004070	T	7	7	1689435	1689441	0 %	100 %	0 %	0 %	21911215
30024	NC_004070	AAAT	2	8	1689517	1689524	75 %	25 %	0 %	0 %	21911215
30025	NC_004070	CTA	2	6	1689626	1689631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911215
30026	NC_004070	ATT	2	6	1689711	1689716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911216
30027	NC_004070	AATT	2	8	1689737	1689744	50 %	50 %	0 %	0 %	21911216
30028	NC_004070	CAG	2	6	1689817	1689822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911216
30029	NC_004070	ACAAA	2	10	1689823	1689832	80 %	0 %	0 %	20 %	21911216
30030	NC_004070	CTTG	2	8	1689844	1689851	0 %	50 %	25 %	25 %	21911216
30031	NC_004070	CTT	2	6	1689862	1689867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911216
30032	NC_004070	TCAAA	2	10	1689871	1689880	60 %	20 %	0 %	20 %	21911216
30033	NC_004070	AG	3	6	1689904	1689909	50 %	0 %	50 %	0 %	21911216
30034	NC_004070	AATC	2	8	1690003	1690010	50 %	25 %	0 %	25 %	21911216
30035	NC_004070	ATC	2	6	1690035	1690040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911216
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30037	NC_004070	GCCT	2	8	1690104	1690111	0 %	25 %	25 %	50 %	21911216
30038	NC_004070	CTG	2	6	1690120	1690125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911216
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30040	NC_004070	CTT	2	6	1690210	1690215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911216
30041	NC_004070	GTG	2	6	1690227	1690232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21911216
30042	NC_004070	AAT	2	6	1690241	1690246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911216
30043	NC_004070	ATC	2	6	1690256	1690261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911216
30044	NC_004070	TCA	2	6	1690296	1690301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911216
30045	NC_004070	CAT	2	6	1690319	1690324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911216
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30048	NC_004070	TCAAA	2	10	1690399	1690408	60 %	20 %	0 %	20 %	21911216
30049	NC_004070	CAA	2	6	1690421	1690426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911216
30050	NC_004070	TAA	2	6	1690453	1690458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911216
30051	NC_004070	CTT	2	6	1690562	1690567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911216
30052	NC_004070	AATG	2	8	1690591	1690598	50 %	25 %	25 %	0 %	21911216
30053	NC_004070	AG	3	6	1690681	1690686	50 %	0 %	50 %	0 %	21911216
30054	NC_004070	AGTCA	2	10	1690724	1690733	40 %	20 %	20 %	20 %	21911216
30055	NC_004070	GTA	2	6	1690739	1690744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911216
30056	NC_004070	TAA	2	6	1690752	1690757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911216
30057	NC_004070	TGA	2	6	1690840	1690845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911216
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30059	NC_004070	TTC	2	6	1690937	1690942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911216
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30062	NC_004070	AAATC	2	10	1691077	1691086	60 %	20 %	0 %	20 %	21911216
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30064	NC_004070	TGC	2	6	1691144	1691149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911216
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30066	NC_004070	A	7	7	1691282	1691288	100 %	0 %	0 %	0 %	21911216
30067	NC_004070	CTG	2	6	1691376	1691381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911216
30068	NC_004070	CAT	2	6	1691429	1691434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911216
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30117	NC_004070	TGAT	2	8	1694794	1694801	25 %	50 %	25 %	0 %	21911222
30118	NC_004070	TA	3	6	1694819	1694824	50 %	50 %	0 %	0 %	21911222
30119	NC_004070	ACC	2	6	1694920	1694925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911222
30120	NC_004070	TCA	2	6	1695083	1695088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911223
30121	NC_004070	TCT	2	6	1695107	1695112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911223
30122	NC_004070	AG	3	6	1695196	1695201	50 %	0 %	50 %	0 %	21911223
30123	NC_004070	CTT	2	6	1695210	1695215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911223
30124	NC_004070	TGG	2	6	1695411	1695416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21911223
30125	NC_004070	ATT	2	6	1695421	1695426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21911223
30126	NC_004070	ACC	2	6	1695475	1695480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21911223
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30128	NC_004070	GTG	2	6	1695547	1695552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21911223
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30130	NC_004070	ATG	2	6	1695794	1695799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911223
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30133	NC_004070	ATC	2	6	1696066	1696071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911223
30134	NC_004070	ATC	2	6	1696132	1696137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911223
30135	NC_004070	TCA	2	6	1696169	1696174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911223
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30149	NC_004070	CCACTT	2	12	1696995	1697006	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21911223
30150	NC_004070	GTT	2	6	1697102	1697107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911223
30151	NC_004070	AAT	2	6	1697200	1697205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911223
30152	NC_004070	TCT	2	6	1697219	1697224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911223
30153	NC_004070	TGG	2	6	1697368	1697373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21911223
30154	NC_004070	ATA	2	6	1697392	1697397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21911223
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30157	NC_004070	ATAG	2	8	1697602	1697609	50 %	25 %	25 %	0 %	21911223
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30194	NC_004070	T	6	6	1699832	1699837	0 %	100 %	0 %	0 %	21911224
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30201	NC_004070	CTT	3	9	1700503	1700511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911224
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30205	NC_004070	AGCAA	2	10	1700586	1700595	60 %	0 %	20 %	20 %	21911224
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30209	NC_004070	CAG	2	6	1700722	1700727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911224
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30211	NC_004070	ATC	2	6	1700823	1700828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911224
30212	NC_004070	AGC	2	6	1700831	1700836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911224
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30214	NC_004070	ATC	2	6	1700876	1700881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911224
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30218	NC_004070	AAGC	2	8	1701131	1701138	50 %	0 %	25 %	25 %	21911224
30219	NC_004070	TCA	2	6	1701156	1701161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911224
30220	NC_004070	TTC	2	6	1701245	1701250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911224
30221	NC_004070	ATG	2	6	1701411	1701416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911224
30222	NC_004070	CAG	2	6	1701469	1701474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911224
30223	NC_004070	GCAC	2	8	1701495	1701502	25 %	0 %	25 %	50 %	21911224
30224	NC_004070	ATC	2	6	1701818	1701823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911225
30225	NC_004070	CTTG	2	8	1701873	1701880	0 %	50 %	25 %	25 %	21911225
30226	NC_004070	CGA	2	6	1701890	1701895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911225
30227	NC_004070	TCA	2	6	1701912	1701917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911225
30228	NC_004070	GGAATC	2	12	1701941	1701952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21911225
30229	NC_004070	GACT	2	8	1702000	1702007	25 %	25 %	25 %	25 %	21911225
30230	NC_004070	AGC	2	6	1702021	1702026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911225
30231	NC_004070	GCT	3	9	1702397	1702405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21911225
30232	NC_004070	CTA	2	6	1702433	1702438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21911225
30233	NC_004070	TAAAA	2	10	1702492	1702501	80 %	20 %	0 %	0 %	21911225
30234	NC_004070	TCT	2	6	1702598	1702603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911225
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30474	NC_004070	TATT	2	8	1716494	1716501	25 %	75 %	0 %	0 %	21911237
30475	NC_004070	CAA	2	6	1716535	1716540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21911237
30476	NC_004070	TTG	2	6	1716599	1716604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21911237
30477	NC_004070	TGA	2	6	1716669	1716674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21911237
30478	NC_004070	A	6	6	1716855	1716860	100 %	0 %	0 %	0 %	21911237
30479	NC_004070	TCT	2	6	1716863	1716868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21911237
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30482	NC_004070	AGC	2	6	1717006	1717011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21911237
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