MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 33541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003485	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	19745202
2	NC_003485	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	19745202
3	NC_003485	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
4	NC_003485	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
5	NC_003485	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
6	NC_003485	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
7	NC_003485	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	19745202
8	NC_003485	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745202
9	NC_003485	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
10	NC_003485	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
11	NC_003485	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	19745202
12	NC_003485	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745202
13	NC_003485	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	19745202
14	NC_003485	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745202
15	NC_003485	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
16	NC_003485	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	19745202
17	NC_003485	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
18	NC_003485	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
19	NC_003485	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	19745202
20	NC_003485	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
21	NC_003485	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
22	NC_003485	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745202
23	NC_003485	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	19745202
24	NC_003485	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745202
25	NC_003485	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745202
26	NC_003485	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745202
27	NC_003485	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745202
28	NC_003485	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745202
29	NC_003485	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	19745202
30	NC_003485	ATT	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
31	NC_003485	CTATTC	2	12	1788	1799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	19745203
32	NC_003485	TCA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745203
33	NC_003485	GTAA	2	8	1886	1893	50 %	25 %	25 %	0 %	19745203
34	NC_003485	TTA	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
35	NC_003485	T	7	7	1948	1954	0 %	100 %	0 %	0 %	19745203
36	NC_003485	ATT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
37	NC_003485	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745203
38	NC_003485	GTT	2	6	2018	2023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
39	NC_003485	AAG	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
40	NC_003485	ATT	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
41	NC_003485	TAT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
42	NC_003485	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745203
43	NC_003485	GACT	2	8	2245	2252	25 %	25 %	25 %	25 %	19745203
44	NC_003485	CAG	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
45	NC_003485	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	19745203
46	NC_003485	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745203
47	NC_003485	GAT	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745203
48	NC_003485	TTA	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745203
49	NC_003485	GTT	2	6	2498	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745203
50	NC_003485	CTT	2	6	2542	2547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745203
51	NC_003485	GGTAA	2	10	2633	2642	40 %	20 %	40 %	0 %	19745203
52	NC_003485	AGTC	2	8	2663	2670	25 %	25 %	25 %	25 %	19745203
53	NC_003485	GAA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745203
54	NC_003485	AATT	2	8	2817	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	19745203
55	NC_003485	TAAG	2	8	2843	2850	50 %	25 %	25 %	0 %	19745203
56	NC_003485	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
57	NC_003485	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
58	NC_003485	TGGTA	2	10	3569	3578	20 %	40 %	40 %	0 %	19745204
59	NC_003485	A	7	7	3627	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	19745204
60	NC_003485	AAAT	2	8	3707	3714	75 %	25 %	0 %	0 %	19745204
61	NC_003485	TGA	3	9	3767	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
62	NC_003485	TCAA	2	8	3873	3880	50 %	25 %	0 %	25 %	19745204
63	NC_003485	A	6	6	3901	3906	100 %	0 %	0 %	0 %	19745204
64	NC_003485	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
65	NC_003485	GTT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
66	NC_003485	AAC	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745204
67	NC_003485	CAAA	2	8	4127	4134	75 %	0 %	0 %	25 %	19745204
68	NC_003485	AGT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
69	NC_003485	AGA	3	9	4190	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
70	NC_003485	AGA	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
71	NC_003485	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
72	NC_003485	ATC	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
73	NC_003485	CAG	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745204
74	NC_003485	GCT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745204
75	NC_003485	TAT	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745204
76	NC_003485	ATG	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745204
77	NC_003485	AAG	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
78	NC_003485	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745204
79	NC_003485	GTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745204
80	NC_003485	CAT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745204
81	NC_003485	TTG	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745205
82	NC_003485	A	6	6	4678	4683	100 %	0 %	0 %	0 %	19745205
83	NC_003485	GAT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
84	NC_003485	TTA	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
85	NC_003485	CTA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
86	NC_003485	AAT	2	6	4833	4838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
87	NC_003485	CTA	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745205
88	NC_003485	ATG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745205
89	NC_003485	TTACGT	2	12	4935	4946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745205
90	NC_003485	CAG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
91	NC_003485	GAC	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745205
92	NC_003485	TTA	2	6	5062	5067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745205
93	NC_003485	ATA	2	6	5098	5103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745205
94	NC_003485	TTTA	2	8	5149	5156	25 %	75 %	0 %	0 %	19745205
95	NC_003485	A	6	6	5173	5178	100 %	0 %	0 %	0 %	19745205
96	NC_003485	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
97	NC_003485	ACC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745206
98	NC_003485	GAT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
99	NC_003485	A	9	9	5346	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
100	NC_003485	TGA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
101	NC_003485	T	6	6	5441	5446	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
102	NC_003485	TGA	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
103	NC_003485	TTA	2	6	5703	5708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
104	NC_003485	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
105	NC_003485	GAT	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
106	NC_003485	AAC	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
107	NC_003485	TTA	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
108	NC_003485	ATA	2	6	5955	5960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
109	NC_003485	A	6	6	5960	5965	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
110	NC_003485	AGA	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
111	NC_003485	A	6	6	5995	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
112	NC_003485	ATT	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
113	NC_003485	ATT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745206
114	NC_003485	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
115	NC_003485	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
116	NC_003485	GATTT	2	10	6135	6144	20 %	60 %	20 %	0 %	19745206
117	NC_003485	AGA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
118	NC_003485	ACT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745206
119	NC_003485	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	19745206
120	NC_003485	TTGA	2	8	6356	6363	25 %	50 %	25 %	0 %	19745206
121	NC_003485	A	7	7	6381	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	19745206
122	NC_003485	AAC	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745206
123	NC_003485	ACGA	2	8	6429	6436	50 %	0 %	25 %	25 %	19745206
124	NC_003485	CCTT	2	8	6469	6476	0 %	50 %	0 %	50 %	19745206
125	NC_003485	AGTG	2	8	6478	6485	25 %	25 %	50 %	0 %	19745206
126	NC_003485	TGA	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
127	NC_003485	ACG	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745206
128	NC_003485	GATTCA	2	12	6730	6741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745206
129	NC_003485	CTG	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745206
130	NC_003485	TAA	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745206
131	NC_003485	ATG	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
132	NC_003485	TGA	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
133	NC_003485	AAG	2	6	6958	6963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745206
134	NC_003485	ATTTTC	2	12	6976	6987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	19745206
135	NC_003485	GAT	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
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137	NC_003485	TGA	3	9	7015	7023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745206
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272	NC_003485	TGTT	2	8	12636	12643	0 %	75 %	25 %	0 %	19745211
273	NC_003485	AGA	2	6	12729	12734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745211
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