MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 3210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003384	GAA	2	6	206382	206387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32765051
3002	NC_003384	GATG	2	8	206412	206419	25 %	25 %	50 %	0 %	32765051
3003	NC_003384	CCCAG	2	10	206457	206466	20 %	0 %	20 %	60 %	32765051
3004	NC_003384	GT	3	6	206479	206484	0 %	50 %	50 %	0 %	32765051
3005	NC_003384	ACCTC	2	10	206519	206528	20 %	20 %	0 %	60 %	32765051
3006	NC_003384	CTT	2	6	206533	206538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32765051
3007	NC_003384	GTCT	2	8	206615	206622	0 %	50 %	25 %	25 %	32765051
3008	NC_003384	A	6	6	206632	206637	100 %	0 %	0 %	0 %	32765051
3009	NC_003384	AT	3	6	206644	206649	50 %	50 %	0 %	0 %	32765051
3010	NC_003384	TGT	2	6	206682	206687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32765051
3011	NC_003384	TGC	2	6	206713	206718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765051
3012	NC_003384	TGGA	2	8	206746	206753	25 %	25 %	50 %	0 %	32765051
3013	NC_003384	GTCG	2	8	206872	206879	0 %	25 %	50 %	25 %	32765051
3014	NC_003384	CGG	2	6	206927	206932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765051
3015	NC_003384	TAT	2	6	206934	206939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32765051
3016	NC_003384	GACT	2	8	206954	206961	25 %	25 %	25 %	25 %	32765051
3017	NC_003384	AAC	2	6	206963	206968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32765051
3018	NC_003384	TGAA	2	8	206972	206979	50 %	25 %	25 %	0 %	32765051
3019	NC_003384	CGG	2	6	207048	207053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32765051
3020	NC_003384	TCG	2	6	207203	207208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765051
3021	NC_003384	ATT	2	6	207279	207284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32765051
3022	NC_003384	GCA	2	6	207316	207321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765051
3023	NC_003384	AAC	2	6	207361	207366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32765051
3024	NC_003384	AC	3	6	207389	207394	50 %	0 %	0 %	50 %	32765051
3025	NC_003384	ATA	2	6	207488	207493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32765051
3026	NC_003384	AGAA	2	8	207513	207520	75 %	0 %	25 %	0 %	32765051
3027	NC_003384	AAC	2	6	207525	207530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32765051
3028	NC_003384	GAA	2	6	207535	207540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32765051
3029	NC_003384	ACG	2	6	207664	207669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32765051
3030	NC_003384	CCG	2	6	207692	207697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32765051
3031	NC_003384	TAAA	2	8	207737	207744	75 %	25 %	0 %	0 %	32765051
3032	NC_003384	GATG	2	8	207764	207771	25 %	25 %	50 %	0 %	32765051
3033	NC_003384	AGTA	2	8	207818	207825	50 %	25 %	25 %	0 %	18466648
3034	NC_003384	CGCT	2	8	207831	207838	0 %	25 %	25 %	50 %	18466648
3035	NC_003384	GCG	2	6	207845	207850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466648
3036	NC_003384	TG	3	6	207933	207938	0 %	50 %	50 %	0 %	18466648
3037	NC_003384	ATC	2	6	207987	207992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466648
3038	NC_003384	CTG	2	6	208008	208013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3039	NC_003384	CCA	2	6	208027	208032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466648
3040	NC_003384	TGA	2	6	208088	208093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466648
3041	NC_003384	CTG	2	6	208107	208112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3042	NC_003384	GCGA	2	8	208113	208120	25 %	0 %	50 %	25 %	18466648
3043	NC_003384	CGC	2	6	208176	208181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466648
3044	NC_003384	TCG	2	6	208186	208191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3045	NC_003384	A	7	7	208192	208198	100 %	0 %	0 %	0 %	18466648
3046	NC_003384	TTAT	2	8	208217	208224	25 %	75 %	0 %	0 %	18466648
3047	NC_003384	TGC	2	6	208250	208255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3048	NC_003384	TTA	2	6	208264	208269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466648
3049	NC_003384	GCAAC	2	10	208301	208310	40 %	0 %	20 %	40 %	18466648
3050	NC_003384	AGA	2	6	208358	208363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466648
3051	NC_003384	TC	4	8	208373	208380	0 %	50 %	0 %	50 %	18466648
3052	NC_003384	CAT	2	6	208457	208462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466648
3053	NC_003384	GCT	2	6	208472	208477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3054	NC_003384	TG	4	8	208512	208519	0 %	50 %	50 %	0 %	18466648
3055	NC_003384	ACG	2	6	208575	208580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3056	NC_003384	GTC	2	6	208636	208641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3057	NC_003384	GCA	2	6	208754	208759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466648
3058	NC_003384	TCA	2	6	208886	208891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466649
3059	NC_003384	GAT	2	6	208911	208916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466649
3060	NC_003384	TTAT	2	8	208925	208932	25 %	75 %	0 %	0 %	18466649
3061	NC_003384	CGA	2	6	208953	208958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466649
3062	NC_003384	CAA	2	6	208966	208971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466649
3063	NC_003384	AGG	2	6	208979	208984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466649
3064	NC_003384	GGT	2	6	209018	209023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466649
3065	NC_003384	GAAT	2	8	209135	209142	50 %	25 %	25 %	0 %	18466649
3066	NC_003384	A	6	6	209184	209189	100 %	0 %	0 %	0 %	18466649
3067	NC_003384	CTG	2	6	209197	209202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466649
3068	NC_003384	ACGTT	2	10	209310	209319	20 %	40 %	20 %	20 %	18466649
3069	NC_003384	TA	3	6	209391	209396	50 %	50 %	0 %	0 %	18466649
3070	NC_003384	C	6	6	209445	209450	0 %	0 %	0 %	100 %	18466649
3071	NC_003384	TTG	2	6	209458	209463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466649
3072	NC_003384	TAA	2	6	209515	209520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466649
3073	NC_003384	TAA	3	9	209541	209549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466650
3074	NC_003384	TGA	2	6	209580	209585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466650
3075	NC_003384	CTG	2	6	209647	209652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466650
3076	NC_003384	GCC	2	6	209659	209664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466650
3077	NC_003384	CGT	2	6	209733	209738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466650
3078	NC_003384	ACA	2	6	209816	209821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466650
3079	NC_003384	ATT	2	6	209842	209847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466650
3080	NC_003384	GGC	2	6	209863	209868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466650
3081	NC_003384	ATT	3	9	209884	209892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466650
3082	NC_003384	CCA	2	6	209919	209924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466650
3083	NC_003384	AGA	2	6	209927	209932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466650
3084	NC_003384	CAAG	2	8	209960	209967	50 %	0 %	25 %	25 %	18466650
3085	NC_003384	TC	3	6	210051	210056	0 %	50 %	0 %	50 %	18466650
3086	NC_003384	CATTT	2	10	210070	210079	20 %	60 %	0 %	20 %	18466650
3087	NC_003384	TAT	2	6	210105	210110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466650
3088	NC_003384	CTA	2	6	210144	210149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466650
3089	NC_003384	CTG	2	6	210161	210166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466650
3090	NC_003384	CCG	2	6	210278	210283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466650
3091	NC_003384	ATC	2	6	210311	210316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466650
3092	NC_003384	ATGCA	2	10	210362	210371	40 %	20 %	20 %	20 %	18466650
3093	NC_003384	ATT	2	6	210414	210419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466650
3094	NC_003384	GCA	2	6	210474	210479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466650
3095	NC_003384	TCGCT	2	10	210592	210601	0 %	40 %	20 %	40 %	18466650
3096	NC_003384	AAC	2	6	210654	210659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466650
3097	NC_003384	CCA	2	6	210686	210691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466650
3098	NC_003384	ATT	2	6	210755	210760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466651
3099	NC_003384	TCG	2	6	210803	210808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466651
3100	NC_003384	CAGA	2	8	210832	210839	50 %	0 %	25 %	25 %	18466651
3101	NC_003384	CCTG	2	8	210850	210857	0 %	25 %	25 %	50 %	18466651
3102	NC_003384	ATG	2	6	210858	210863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466651
3103	NC_003384	CAC	2	6	210910	210915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466651
3104	NC_003384	AGA	2	6	210966	210971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466651
3105	NC_003384	GGA	2	6	211000	211005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466651
3106	NC_003384	TGT	2	6	211129	211134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466651
3107	NC_003384	CAT	2	6	211135	211140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466651
3108	NC_003384	GGA	2	6	211195	211200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466651
3109	NC_003384	GTTC	2	8	211201	211208	0 %	50 %	25 %	25 %	18466651
3110	NC_003384	AAC	2	6	211351	211356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466651
3111	NC_003384	AGC	2	6	211368	211373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466651
3112	NC_003384	A	8	8	211440	211447	100 %	0 %	0 %	0 %	18466651
3113	NC_003384	T	6	6	211464	211469	0 %	100 %	0 %	0 %	18466652
3114	NC_003384	GCG	2	6	211550	211555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466652
3115	NC_003384	AAC	2	6	211606	211611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466652
3116	NC_003384	CTGT	2	8	211651	211658	0 %	50 %	25 %	25 %	18466652
3117	NC_003384	CGA	2	6	211763	211768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466652
3118	NC_003384	AGT	2	6	211795	211800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466652
3119	NC_003384	GGT	2	6	211801	211806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466652
3120	NC_003384	TTG	2	6	211929	211934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466653
3121	NC_003384	GTA	2	6	211977	211982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466653
3122	NC_003384	ATC	2	6	211998	212003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466653
3123	NC_003384	GGC	2	6	212025	212030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466653
3124	NC_003384	TAT	2	6	212063	212068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466653
3125	NC_003384	CTT	2	6	212096	212101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466653
3126	NC_003384	TTA	2	6	212167	212172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466653
3127	NC_003384	CCA	2	6	212198	212203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466653
3128	NC_003384	ATCA	2	8	212539	212546	50 %	25 %	0 %	25 %	18466654
3129	NC_003384	CCA	2	6	212565	212570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466654
3130	NC_003384	AAG	2	6	212619	212624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466654
3131	NC_003384	TTA	2	6	212709	212714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466654
3132	NC_003384	CAT	2	6	213193	213198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466655
3133	NC_003384	GCTG	2	8	213235	213242	0 %	25 %	50 %	25 %	18466655
3134	NC_003384	GAT	2	6	213253	213258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466655
3135	NC_003384	CTG	2	6	213283	213288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466655
3136	NC_003384	GCG	2	6	213324	213329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466655
3137	NC_003384	GTGC	2	8	213333	213340	0 %	25 %	50 %	25 %	18466655
3138	NC_003384	GCT	2	6	213365	213370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466655
3139	NC_003384	GTT	2	6	213473	213478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466656
3140	NC_003384	ATC	2	6	213581	213586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466656
3141	NC_003384	ACA	2	6	213663	213668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466656
3142	NC_003384	AAG	2	6	213699	213704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466656
3143	NC_003384	GCTG	2	8	213745	213752	0 %	25 %	50 %	25 %	18466656
3144	NC_003384	ATC	2	6	213872	213877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466656
3145	NC_003384	GCG	2	6	213894	213899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466656
3146	NC_003384	ATA	2	6	213900	213905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466656
3147	NC_003384	GCC	2	6	213920	213925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466656
3148	NC_003384	TGC	2	6	213938	213943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466656
3149	NC_003384	TCA	2	6	214054	214059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466657
3150	NC_003384	ACAAAC	2	12	214065	214076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466657
3151	NC_003384	ATT	2	6	214147	214152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466657
3152	NC_003384	TAT	2	6	214191	214196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466657
3153	NC_003384	GGAA	2	8	214212	214219	50 %	0 %	50 %	0 %	18466657
3154	NC_003384	TCA	2	6	214274	214279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466657
3155	NC_003384	AGATC	2	10	214365	214374	40 %	20 %	20 %	20 %	18466657
3156	NC_003384	CAAA	2	8	214407	214414	75 %	0 %	0 %	25 %	18466657
3157	NC_003384	CCA	2	6	214418	214423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466657
3158	NC_003384	TTG	2	6	214424	214429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466657
3159	NC_003384	CTG	2	6	214592	214597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466658
3160	NC_003384	GTA	2	6	214676	214681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466658
3161	NC_003384	CATTTT	2	12	214688	214699	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	18466658
3162	NC_003384	T	6	6	214696	214701	0 %	100 %	0 %	0 %	18466658
3163	NC_003384	CTG	2	6	214730	214735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466658
3164	NC_003384	GTT	2	6	214765	214770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466658
3165	NC_003384	ATAA	2	8	214781	214788	75 %	25 %	0 %	0 %	18466658
3166	NC_003384	AG	3	6	214797	214802	50 %	0 %	50 %	0 %	18466658
3167	NC_003384	ATA	2	6	214839	214844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466658
3168	NC_003384	CCT	2	6	214845	214850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466658
3169	NC_003384	TAT	2	6	214861	214866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466658
3170	NC_003384	TTC	2	6	215191	215196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466660
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3172	NC_003384	GCA	2	6	215211	215216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466660
3173	NC_003384	CTG	2	6	215228	215233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466660
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3181	NC_003384	TCG	2	6	215699	215704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466661
3182	NC_003384	CCA	2	6	215834	215839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466661
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3184	NC_003384	GGT	2	6	215895	215900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466661
3185	NC_003384	G	7	7	215905	215911	0 %	0 %	100 %	0 %	18466661
3186	NC_003384	GCT	2	6	215935	215940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466661
3187	NC_003384	TGT	2	6	216032	216037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466661
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3189	NC_003384	ACAT	2	8	216079	216086	50 %	25 %	0 %	25 %	18466661
3190	NC_003384	TTC	2	6	216210	216215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466661
3191	NC_003384	GACA	2	8	216258	216265	50 %	0 %	25 %	25 %	18466661
3192	NC_003384	CTC	2	6	216327	216332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466661
3193	NC_003384	GATC	2	8	216476	216483	25 %	25 %	25 %	25 %	18466661
3194	NC_003384	AGT	2	6	216533	216538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466661
3195	NC_003384	CAG	2	6	216554	216559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466661
3196	NC_003384	CTCTTC	2	12	216576	216587	0 %	50 %	0 %	50 %	18466661
3197	NC_003384	TGCG	2	8	216623	216630	0 %	25 %	50 %	25 %	18466661
3198	NC_003384	AGGT	2	8	216649	216656	25 %	25 %	50 %	0 %	18466661
3199	NC_003384	GTT	2	6	216672	216677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466661
3200	NC_003384	CAT	2	6	216689	216694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466661
3201	NC_003384	GAA	2	6	217251	217256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32765052
3202	NC_003384	GAT	2	6	217296	217301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32765052
3203	NC_003384	CT	3	6	217333	217338	0 %	50 %	0 %	50 %	32765052
3204	NC_003384	GCCA	2	8	217344	217351	25 %	0 %	25 %	50 %	32765052
3205	NC_003384	GTC	2	6	217371	217376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32765052
3206	NC_003384	GGC	2	6	217405	217410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466662
3207	NC_003384	CGA	2	6	217453	217458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466662
3208	NC_003384	A	6	6	217467	217472	100 %	0 %	0 %	0 %	18466662
3209	NC_003384	AAC	2	6	217698	217703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466663
3210	NC_003384	GGTT	2	8	217705	217712	0 %	50 %	50 %	0 %	18466663

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