MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_003198	ACC	2	6	1230427	1230432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760108
22003	NC_003198	TGCC	2	8	1230465	1230472	0 %	25 %	25 %	50 %	16760108
22004	NC_003198	GCT	2	6	1230757	1230762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760108
22005	NC_003198	GCC	2	6	1230817	1230822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760108
22006	NC_003198	GTT	2	6	1230915	1230920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760108
22007	NC_003198	ATA	2	6	1230970	1230975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760108
22008	NC_003198	AAT	2	6	1231069	1231074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760109
22009	NC_003198	GCT	2	6	1231094	1231099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760109
22010	NC_003198	GCC	3	9	1231107	1231115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760109
22011	NC_003198	CGG	2	6	1231163	1231168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760109
22012	NC_003198	GCT	2	6	1231307	1231312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760109
22013	NC_003198	CCA	2	6	1231394	1231399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760109
22014	NC_003198	GCC	2	6	1231431	1231436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760109
22015	NC_003198	GCAG	2	8	1231534	1231541	25 %	0 %	50 %	25 %	16760109
22016	NC_003198	T	6	6	1231602	1231607	0 %	100 %	0 %	0 %	16760109
22017	NC_003198	CAA	2	6	1231755	1231760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760109
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22021	NC_003198	TTC	2	6	1232065	1232070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760109
22022	NC_003198	TGT	2	6	1232098	1232103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760109
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22031	NC_003198	G	6	6	1232407	1232412	0 %	0 %	100 %	0 %	16760110
22032	NC_003198	CG	3	6	1232547	1232552	0 %	0 %	50 %	50 %	16760110
22033	NC_003198	CCA	3	9	1232632	1232640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760110
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22053	NC_003198	T	6	6	1233659	1233664	0 %	100 %	0 %	0 %	16760112
22054	NC_003198	TTA	2	6	1233683	1233688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760112
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22062	NC_003198	CGTT	2	8	1234259	1234266	0 %	50 %	25 %	25 %	16760113
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22099	NC_003198	GA	3	6	1236183	1236188	50 %	0 %	50 %	0 %	16760115
22100	NC_003198	CATT	2	8	1236265	1236272	25 %	50 %	0 %	25 %	16760115
22101	NC_003198	ATGA	2	8	1236299	1236306	50 %	25 %	25 %	0 %	16760115
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22103	NC_003198	TCA	2	6	1236366	1236371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760115
22104	NC_003198	CTTCAT	2	12	1236376	1236387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16760115
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22112	NC_003198	CGCC	2	8	1236606	1236613	0 %	0 %	25 %	75 %	16760115
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22119	NC_003198	AAG	2	6	1237331	1237336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760116
22120	NC_003198	ATAAAG	2	12	1237361	1237372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16760116
22121	NC_003198	TCG	2	6	1237377	1237382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760116
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22124	NC_003198	GCG	2	6	1237426	1237431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760116
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22230	NC_003198	CGT	2	6	1243645	1243650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760121
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22233	NC_003198	GGA	2	6	1244179	1244184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16760122
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22238	NC_003198	CAT	2	6	1244497	1244502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760122
22239	NC_003198	GGC	2	6	1244549	1244554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760122
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22343	NC_003198	GC	3	6	1250475	1250480	0 %	0 %	50 %	50 %	16760125
22344	NC_003198	CTG	2	6	1250486	1250491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760125
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22346	NC_003198	CAGT	2	8	1250555	1250562	25 %	25 %	25 %	25 %	16760125
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22349	NC_003198	AT	3	6	1251022	1251027	50 %	50 %	0 %	0 %	16760126
22350	NC_003198	GCT	2	6	1251048	1251053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760126
22351	NC_003198	GAG	2	6	1251060	1251065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16760126
22352	NC_003198	C	6	6	1251072	1251077	0 %	0 %	0 %	100 %	16760126
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22354	NC_003198	GC	3	6	1251139	1251144	0 %	0 %	50 %	50 %	16760126
22355	NC_003198	GGC	2	6	1251332	1251337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760126
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22473	NC_003198	T	6	6	1259902	1259907	0 %	100 %	0 %	0 %	16760134
22474	NC_003198	T	6	6	1259911	1259916	0 %	100 %	0 %	0 %	16760134
22475	NC_003198	ACG	2	6	1259936	1259941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22476	NC_003198	TCTT	2	8	1259942	1259949	0 %	75 %	0 %	25 %	16760134
22477	NC_003198	GTA	2	6	1259983	1259988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760134
22478	NC_003198	CAG	2	6	1259995	1260000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22479	NC_003198	CAGCT	2	10	1260145	1260154	20 %	20 %	20 %	40 %	16760134
22480	NC_003198	CAG	2	6	1260175	1260180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22481	NC_003198	GCG	2	6	1260194	1260199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760134
22482	NC_003198	GC	3	6	1260213	1260218	0 %	0 %	50 %	50 %	16760134
22483	NC_003198	GGT	2	6	1260228	1260233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760134
22484	NC_003198	ACG	2	6	1260250	1260255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22485	NC_003198	CAG	2	6	1260340	1260345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22486	NC_003198	CAG	2	6	1260526	1260531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760134
22487	NC_003198	ACC	2	6	1260619	1260624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760134
22488	NC_003198	CA	3	6	1260630	1260635	50 %	0 %	0 %	50 %	16760134
22489	NC_003198	CAGC	2	8	1260702	1260709	25 %	0 %	25 %	50 %	16760134
22490	NC_003198	GTG	3	9	1260779	1260787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760134
22491	NC_003198	AGCGC	2	10	1260855	1260864	20 %	0 %	40 %	40 %	16760134
22492	NC_003198	TTC	2	6	1260868	1260873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760134
22493	NC_003198	CCG	2	6	1260935	1260940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760134
22494	NC_003198	GAT	2	6	1260949	1260954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760134
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22496	NC_003198	GAA	2	6	1261030	1261035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16760134
22497	NC_003198	GTT	2	6	1261093	1261098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760134
22498	NC_003198	GTCA	2	8	1261111	1261118	25 %	25 %	25 %	25 %	16760134
22499	NC_003198	AG	3	6	1261172	1261177	50 %	0 %	50 %	0 %	16760134
22500	NC_003198	CGG	2	6	1261181	1261186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760134

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