MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_003198	GGC	2	6	1173882	1173887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760057
21003	NC_003198	CGT	2	6	1173902	1173907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760057
21004	NC_003198	CGAT	2	8	1173935	1173942	25 %	25 %	25 %	25 %	16760057
21005	NC_003198	GTC	2	6	1173943	1173948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760057
21006	NC_003198	TTA	2	6	1173991	1173996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760057
21007	NC_003198	CGG	2	6	1174059	1174064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760057
21008	NC_003198	GGC	2	6	1174081	1174086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760057
21009	NC_003198	GGCG	2	8	1174114	1174121	0 %	0 %	75 %	25 %	16760057
21010	NC_003198	ACG	2	6	1174199	1174204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760057
21011	NC_003198	GCA	2	6	1174221	1174226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760057
21012	NC_003198	CGC	2	6	1174370	1174375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760057
21013	NC_003198	GGT	2	6	1174413	1174418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760057
21014	NC_003198	GGC	2	6	1174522	1174527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760057
21015	NC_003198	GTG	2	6	1174537	1174542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760057
21016	NC_003198	AGAT	2	8	1174556	1174563	50 %	25 %	25 %	0 %	16760057
21017	NC_003198	GCG	2	6	1174574	1174579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760057
21018	NC_003198	GCGT	2	8	1174592	1174599	0 %	25 %	50 %	25 %	16760057
21019	NC_003198	GC	4	8	1174626	1174633	0 %	0 %	50 %	50 %	16760057
21020	NC_003198	ATC	2	6	1174720	1174725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760057
21021	NC_003198	TGA	2	6	1174726	1174731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760057
21022	NC_003198	GAAC	2	8	1174781	1174788	50 %	0 %	25 %	25 %	16760058
21023	NC_003198	GAAAGC	2	12	1174790	1174801	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16760058
21024	NC_003198	CGG	2	6	1174813	1174818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760058
21025	NC_003198	GAT	2	6	1174865	1174870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760058
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21028	NC_003198	CAG	2	6	1174965	1174970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760058
21029	NC_003198	CCG	2	6	1174975	1174980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760058
21030	NC_003198	ATG	2	6	1175004	1175009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760058
21031	NC_003198	CGGG	2	8	1175023	1175030	0 %	0 %	75 %	25 %	16760058
21032	NC_003198	GAT	2	6	1175046	1175051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760058
21033	NC_003198	CAG	2	6	1175153	1175158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760058
21034	NC_003198	CAT	2	6	1175247	1175252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760058
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21038	NC_003198	A	6	6	1175415	1175420	100 %	0 %	0 %	0 %	16760058
21039	NC_003198	ACGCT	2	10	1175498	1175507	20 %	20 %	20 %	40 %	16760058
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21042	NC_003198	CAG	2	6	1175610	1175615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760058
21043	NC_003198	CAT	2	6	1175739	1175744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760059
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21052	NC_003198	T	7	7	1176078	1176084	0 %	100 %	0 %	0 %	16760059
21053	NC_003198	GCG	2	6	1176124	1176129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
21054	NC_003198	ACC	2	6	1176178	1176183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760059
21055	NC_003198	CAA	2	6	1176249	1176254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760059
21056	NC_003198	CGG	2	6	1176405	1176410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760059
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21084	NC_003198	GAC	2	6	1177667	1177672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760060
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21086	NC_003198	CGA	2	6	1177727	1177732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760060
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21088	NC_003198	TGA	2	6	1177780	1177785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16760060
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21093	NC_003198	CGCA	2	8	1177916	1177923	25 %	0 %	25 %	50 %	16760060
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21096	NC_003198	A	6	6	1178126	1178131	100 %	0 %	0 %	0 %	16760060
21097	NC_003198	TAA	2	6	1178138	1178143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16760060
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21100	NC_003198	GA	3	6	1178685	1178690	50 %	0 %	50 %	0 %	16760061
21101	NC_003198	GCA	2	6	1178706	1178711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760061
21102	NC_003198	TG	3	6	1178724	1178729	0 %	50 %	50 %	0 %	16760061
21103	NC_003198	TGT	2	6	1178762	1178767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16760061
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21108	NC_003198	CAT	2	6	1179340	1179345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
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21111	NC_003198	GC	3	6	1179503	1179508	0 %	0 %	50 %	50 %	16760062
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21115	NC_003198	TCT	3	9	1179625	1179633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16760062
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21117	NC_003198	CGG	2	6	1179686	1179691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760062
21118	NC_003198	TCA	2	6	1179769	1179774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760062
21119	NC_003198	GAC	2	6	1179816	1179821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760062
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21219	NC_003198	CA	3	6	1185195	1185200	50 %	0 %	0 %	50 %	16760066
21220	NC_003198	CGA	2	6	1185227	1185232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760066
21221	NC_003198	CTG	2	6	1185297	1185302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760066
21222	NC_003198	ATC	2	6	1185321	1185326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760066
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21225	NC_003198	ACA	2	6	1185524	1185529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760067
21226	NC_003198	AACC	2	8	1185535	1185542	50 %	0 %	0 %	50 %	16760067
21227	NC_003198	CGT	2	6	1185561	1185566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760067
21228	NC_003198	CTGT	2	8	1185597	1185604	0 %	50 %	25 %	25 %	16760067
21229	NC_003198	CAC	2	6	1185636	1185641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760067
21230	NC_003198	TAC	2	6	1185657	1185662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760067
21231	NC_003198	G	6	6	1185855	1185860	0 %	0 %	100 %	0 %	16760068
21232	NC_003198	GCA	2	6	1185889	1185894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760068
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21470	NC_003198	TC	3	6	1200865	1200870	0 %	50 %	0 %	50 %	16760082
21471	NC_003198	AAC	2	6	1200927	1200932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760082
21472	NC_003198	GCC	2	6	1200940	1200945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760082
21473	NC_003198	CCT	2	6	1200950	1200955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16760082
21474	NC_003198	CAA	2	6	1200983	1200988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760082
21475	NC_003198	GCCA	2	8	1201020	1201027	25 %	0 %	25 %	50 %	16760082
21476	NC_003198	AAC	2	6	1201205	1201210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760082
21477	NC_003198	CAG	2	6	1201256	1201261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760082
21478	NC_003198	GC	3	6	1201316	1201321	0 %	0 %	50 %	50 %	16760082
21479	NC_003198	CAA	3	9	1201445	1201453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760082
21480	NC_003198	CG	3	6	1201465	1201470	0 %	0 %	50 %	50 %	16760083
21481	NC_003198	CGC	2	6	1201514	1201519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16760083
21482	NC_003198	GCG	2	6	1201534	1201539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760083
21483	NC_003198	TAT	2	6	1201547	1201552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16760083
21484	NC_003198	TGC	2	6	1201576	1201581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16760083
21485	NC_003198	TCA	2	6	1201586	1201591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760083
21486	NC_003198	CCA	2	6	1201605	1201610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16760083
21487	NC_003198	T	6	6	1201616	1201621	0 %	100 %	0 %	0 %	16760083
21488	NC_003198	TCA	2	6	1201625	1201630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16760083
21489	NC_003198	T	6	6	1201675	1201680	0 %	100 %	0 %	0 %	16760083
21490	NC_003198	CGA	2	6	1201745	1201750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16760083
21491	NC_003198	GGC	2	6	1201754	1201759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760083
21492	NC_003198	TGGC	2	8	1201793	1201800	0 %	25 %	50 %	25 %	16760083
21493	NC_003198	GCG	2	6	1201874	1201879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760083
21494	NC_003198	A	7	7	1201894	1201900	100 %	0 %	0 %	0 %	16760083
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21496	NC_003198	CGGCGA	2	12	1202006	1202017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16760083
21497	NC_003198	GGC	2	6	1202033	1202038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16760083
21498	NC_003198	CG	6	12	1202090	1202101	0 %	0 %	50 %	50 %	16760083
21499	NC_003198	GGT	2	6	1202170	1202175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16760083
21500	NC_003198	CAA	2	6	1202205	1202210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16760083

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