MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_003198	T	6	6	638455	638460	0 %	100 %	0 %	0 %	16759552
11502	NC_003198	CGG	2	6	638479	638484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11503	NC_003198	GCT	2	6	638491	638496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11504	NC_003198	GGC	2	6	638498	638503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11505	NC_003198	CGG	2	6	638568	638573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11506	NC_003198	GGC	2	6	638611	638616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11507	NC_003198	GC	3	6	638622	638627	0 %	0 %	50 %	50 %	16759552
11508	NC_003198	CAT	2	6	638719	638724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759552
11509	NC_003198	TCTG	2	8	638748	638755	0 %	50 %	25 %	25 %	16759552
11510	NC_003198	TGGC	2	8	638764	638771	0 %	25 %	50 %	25 %	16759552
11511	NC_003198	TTA	2	6	638789	638794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759552
11512	NC_003198	CTG	2	6	638804	638809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11513	NC_003198	CGGCG	2	10	638887	638896	0 %	0 %	60 %	40 %	16759552
11514	NC_003198	ATG	2	6	638918	638923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759552
11515	NC_003198	TGC	3	9	638976	638984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11516	NC_003198	CGC	2	6	639021	639026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759552
11517	NC_003198	GCTG	2	8	639038	639045	0 %	25 %	50 %	25 %	16759552
11518	NC_003198	GGC	2	6	639118	639123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759553
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11520	NC_003198	TAA	2	6	639152	639157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759553
11521	NC_003198	CAG	2	6	639223	639228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11522	NC_003198	GTT	2	6	639256	639261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759553
11523	NC_003198	CGG	2	6	639300	639305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759553
11524	NC_003198	GC	3	6	639477	639482	0 %	0 %	50 %	50 %	16759553
11525	NC_003198	GCG	2	6	639492	639497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759553
11526	NC_003198	CGT	2	6	639520	639525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11527	NC_003198	CG	3	6	639551	639556	0 %	0 %	50 %	50 %	16759553
11528	NC_003198	TGA	2	6	639630	639635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759553
11529	NC_003198	CGC	2	6	639687	639692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759553
11530	NC_003198	GCG	2	6	639728	639733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759553
11531	NC_003198	TCG	2	6	639821	639826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11532	NC_003198	CGA	2	6	639861	639866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11533	NC_003198	CAG	2	6	639883	639888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11534	NC_003198	CG	3	6	639923	639928	0 %	0 %	50 %	50 %	16759553
11535	NC_003198	ACCA	2	8	640021	640028	50 %	0 %	0 %	50 %	16759553
11536	NC_003198	AGC	2	6	640034	640039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759553
11537	NC_003198	GATATG	2	12	640370	640381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541470383
11538	NC_003198	TTC	2	6	640436	640441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541470383
11539	NC_003198	CAG	2	6	640532	640537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11540	NC_003198	CAG	2	6	640547	640552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11541	NC_003198	TGG	2	6	640593	640598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541470383
11542	NC_003198	CGT	2	6	640626	640631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470383
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11544	NC_003198	TGACGG	2	12	640716	640727	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	541470383
11545	NC_003198	CG	3	6	640775	640780	0 %	0 %	50 %	50 %	541470383
11546	NC_003198	CGCCA	2	10	640792	640801	20 %	0 %	20 %	60 %	541470383
11547	NC_003198	GTG	2	6	640814	640819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541470383
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11549	NC_003198	CAC	2	6	640840	640845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541470383
11550	NC_003198	AGTT	2	8	640900	640907	25 %	50 %	25 %	0 %	541470383
11551	NC_003198	GGC	2	6	640934	640939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541470383
11552	NC_003198	CTG	2	6	640943	640948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11553	NC_003198	TGC	2	6	640965	640970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11554	NC_003198	AGG	2	6	640977	640982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541470383
11555	NC_003198	CTG	2	6	641066	641071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11556	NC_003198	GCA	2	6	641139	641144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11557	NC_003198	CAC	2	6	641179	641184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541470383
11558	NC_003198	CTG	2	6	641261	641266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470383
11559	NC_003198	GGC	2	6	641354	641359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541470383
11560	NC_003198	CGCCGG	2	12	641449	641460	0 %	0 %	50 %	50 %	541470383
11561	NC_003198	CT	3	6	641513	641518	0 %	50 %	0 %	50 %	541470383
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11565	NC_003198	GC	3	6	641695	641700	0 %	0 %	50 %	50 %	16759555
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11568	NC_003198	ACG	3	9	642024	642032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759555
11569	NC_003198	GGC	2	6	642064	642069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759555
11570	NC_003198	CGCCA	2	10	642082	642091	20 %	0 %	20 %	60 %	16759555
11571	NC_003198	CTG	2	6	642096	642101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759555
11572	NC_003198	CGG	2	6	642127	642132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759555
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11574	NC_003198	TAC	2	6	642179	642184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759555
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11582	NC_003198	GC	3	6	642483	642488	0 %	0 %	50 %	50 %	16759555
11583	NC_003198	GCC	2	6	642506	642511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759555
11584	NC_003198	GCA	2	6	642541	642546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759555
11585	NC_003198	GAC	2	6	642641	642646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759555
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11587	NC_003198	GCC	2	6	642682	642687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759555
11588	NC_003198	GTC	2	6	642699	642704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759555
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11591	NC_003198	GATCT	2	10	642800	642809	20 %	40 %	20 %	20 %	16759555
11592	NC_003198	AGATC	2	10	642853	642862	40 %	20 %	20 %	20 %	16759555
11593	NC_003198	GCG	2	6	642870	642875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759555
11594	NC_003198	AGA	2	6	642876	642881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759555
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11596	NC_003198	CGG	2	6	642921	642926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759555
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11598	NC_003198	CTG	2	6	642962	642967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759555
11599	NC_003198	A	6	6	642972	642977	100 %	0 %	0 %	0 %	16759555
11600	NC_003198	TGG	2	6	642990	642995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759555
11601	NC_003198	TGCGT	2	10	643082	643091	0 %	40 %	40 %	20 %	16759555
11602	NC_003198	A	6	6	643124	643129	100 %	0 %	0 %	0 %	16759555
11603	NC_003198	CAA	2	6	643238	643243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759556
11604	NC_003198	GC	3	6	643268	643273	0 %	0 %	50 %	50 %	16759556
11605	NC_003198	GCT	2	6	643277	643282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759556
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11607	NC_003198	CGC	2	6	643361	643366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759556
11608	NC_003198	CAT	2	6	643389	643394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759556
11609	NC_003198	TTA	2	6	643403	643408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759556
11610	NC_003198	CG	3	6	643443	643448	0 %	0 %	50 %	50 %	16759556
11611	NC_003198	CAG	2	6	643494	643499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759556
11612	NC_003198	GGT	2	6	643502	643507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759556
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11616	NC_003198	TGG	2	6	643699	643704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759556
11617	NC_003198	CGT	2	6	643778	643783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759556
11618	NC_003198	GCT	2	6	643796	643801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759556
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