MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_003198	GAA	2	6	612988	612993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759530
11002	NC_003198	GCG	2	6	613007	613012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
11003	NC_003198	GGT	2	6	613023	613028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759530
11004	NC_003198	GGC	2	6	613041	613046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
11005	NC_003198	ATGA	2	8	613066	613073	50 %	25 %	25 %	0 %	16759530
11006	NC_003198	TGAG	2	8	613241	613248	25 %	25 %	50 %	0 %	16759530
11007	NC_003198	TCTCT	2	10	613260	613269	0 %	60 %	0 %	40 %	16759530
11008	NC_003198	ATT	2	6	613467	613472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759531
11009	NC_003198	TCCGCC	2	12	613492	613503	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	16759531
11010	NC_003198	AT	3	6	613524	613529	50 %	50 %	0 %	0 %	16759531
11011	NC_003198	CGT	2	6	613604	613609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759531
11012	NC_003198	ATA	2	6	613637	613642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759531
11013	NC_003198	TA	3	6	613664	613669	50 %	50 %	0 %	0 %	16759531
11014	NC_003198	ACT	2	6	613779	613784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759532
11015	NC_003198	T	6	6	613848	613853	0 %	100 %	0 %	0 %	16759532
11016	NC_003198	GAA	2	6	613867	613872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759532
11017	NC_003198	GGA	2	6	613911	613916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759532
11018	NC_003198	AAT	2	6	613936	613941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759532
11019	NC_003198	GTG	2	6	613969	613974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759532
11020	NC_003198	GGCG	2	8	614031	614038	0 %	0 %	75 %	25 %	16759532
11021	NC_003198	CAC	2	6	614085	614090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759532
11022	NC_003198	GGC	2	6	614156	614161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759532
11023	NC_003198	TGA	2	6	614198	614203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759532
11024	NC_003198	CGTT	2	8	614221	614228	0 %	50 %	25 %	25 %	16759532
11025	NC_003198	GCC	2	6	614448	614453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759533
11026	NC_003198	TGCG	2	8	614504	614511	0 %	25 %	50 %	25 %	16759533
11027	NC_003198	CAT	2	6	614566	614571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759533
11028	NC_003198	CG	3	6	614605	614610	0 %	0 %	50 %	50 %	16759533
11029	NC_003198	GCC	2	6	614615	614620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759533
11030	NC_003198	CAT	2	6	614656	614661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759533
11031	NC_003198	TTTC	2	8	614673	614680	0 %	75 %	0 %	25 %	16759533
11032	NC_003198	GGC	2	6	614712	614717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759533
11033	NC_003198	CTG	3	9	614800	614808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11034	NC_003198	GTC	2	6	614866	614871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11035	NC_003198	CTG	3	9	614935	614943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11036	NC_003198	CG	3	6	614970	614975	0 %	0 %	50 %	50 %	16759534
11037	NC_003198	GGC	2	6	614977	614982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
11038	NC_003198	CTG	2	6	614998	615003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11039	NC_003198	AAAT	2	8	615036	615043	75 %	25 %	0 %	0 %	16759534
11040	NC_003198	GCAG	2	8	615045	615052	25 %	0 %	50 %	25 %	16759534
11041	NC_003198	TCA	2	6	615144	615149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759534
11042	NC_003198	GAT	2	6	615165	615170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759534
11043	NC_003198	TCG	2	6	615185	615190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11044	NC_003198	GGC	2	6	615268	615273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
11045	NC_003198	GGC	2	6	615322	615327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
11046	NC_003198	CGA	2	6	615353	615358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11047	NC_003198	GCT	2	6	615423	615428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
11048	NC_003198	TGA	2	6	615486	615491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759534
11049	NC_003198	GAA	2	6	615877	615882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759535
11050	NC_003198	GCG	2	6	615939	615944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11051	NC_003198	TTG	2	6	616007	616012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759535
11052	NC_003198	CGG	2	6	616200	616205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11053	NC_003198	GCG	2	6	616253	616258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11054	NC_003198	T	6	6	616262	616267	0 %	100 %	0 %	0 %	16759535
11055	NC_003198	GCT	2	6	616381	616386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
11056	NC_003198	CGG	2	6	616399	616404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11057	NC_003198	TTC	2	6	616445	616450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759535
11058	NC_003198	GCG	2	6	616532	616537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11059	NC_003198	GC	3	6	616541	616546	0 %	0 %	50 %	50 %	16759535
11060	NC_003198	A	6	6	616554	616559	100 %	0 %	0 %	0 %	16759535
11061	NC_003198	GGT	2	6	616582	616587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
11062	NC_003198	TGG	2	6	616620	616625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
11063	NC_003198	AGC	2	6	616667	616672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759535
11064	NC_003198	TGA	2	6	616680	616685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759535
11065	NC_003198	TGG	2	6	616710	616715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
11066	NC_003198	GTCGC	2	10	616742	616751	0 %	20 %	40 %	40 %	16759535
11067	NC_003198	GCG	2	6	616767	616772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
11068	NC_003198	TGG	2	6	616899	616904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
11069	NC_003198	CG	3	6	617015	617020	0 %	0 %	50 %	50 %	16759535
11070	NC_003198	CGT	2	6	617027	617032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
11071	NC_003198	CCG	2	6	617070	617075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759535
11072	NC_003198	TGC	2	6	617157	617162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
11073	NC_003198	GC	3	6	617286	617291	0 %	0 %	50 %	50 %	16759536
11074	NC_003198	TGA	2	6	617315	617320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759536
11075	NC_003198	CCA	2	6	617340	617345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759536
11076	NC_003198	ACG	2	6	617399	617404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11077	NC_003198	TGG	2	6	617498	617503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759536
11078	NC_003198	CGG	2	6	617552	617557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759536
11079	NC_003198	GTT	2	6	617586	617591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759536
11080	NC_003198	TGA	2	6	617612	617617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759536
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11082	NC_003198	TGC	2	6	617712	617717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11083	NC_003198	CCG	2	6	617732	617737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759536
11084	NC_003198	TGG	2	6	617796	617801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759536
11085	NC_003198	TAT	2	6	617808	617813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759536
11086	NC_003198	CCAG	2	8	617886	617893	25 %	0 %	25 %	50 %	16759536
11087	NC_003198	CAG	2	6	618031	618036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11088	NC_003198	ATC	2	6	618041	618046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759536
11089	NC_003198	CGA	2	6	618054	618059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11090	NC_003198	GGC	2	6	618115	618120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759536
11091	NC_003198	CAG	2	6	618154	618159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11092	NC_003198	CAG	2	6	618172	618177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11093	NC_003198	GC	3	6	618201	618206	0 %	0 %	50 %	50 %	16759536
11094	NC_003198	GTC	2	6	618209	618214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11095	NC_003198	ATG	2	6	618272	618277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759536
11096	NC_003198	AAT	2	6	618305	618310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759536
11097	NC_003198	TAA	2	6	618321	618326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759536
11098	NC_003198	GC	3	6	618371	618376	0 %	0 %	50 %	50 %	16759536
11099	NC_003198	ATA	2	6	618395	618400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759536
11100	NC_003198	CTG	2	6	618411	618416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759536
11101	NC_003198	ATA	2	6	618425	618430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759536
11102	NC_003198	CAC	2	6	618439	618444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759536
11103	NC_003198	GTG	2	6	618452	618457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759536
11104	NC_003198	TCT	2	6	618482	618487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759536
11105	NC_003198	CGCTGG	2	12	618861	618872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16759537
11106	NC_003198	CT	3	6	618901	618906	0 %	50 %	0 %	50 %	16759537
11107	NC_003198	ACG	2	6	618984	618989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759537
11108	NC_003198	GGC	2	6	619058	619063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
11109	NC_003198	ATA	2	6	619095	619100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759537
11110	NC_003198	G	6	6	619135	619140	0 %	0 %	100 %	0 %	16759537
11111	NC_003198	CGG	2	6	619177	619182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
11112	NC_003198	GGC	3	9	619192	619200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
11113	NC_003198	CG	3	6	619204	619209	0 %	0 %	50 %	50 %	16759537
11114	NC_003198	GCG	3	9	619253	619261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
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11117	NC_003198	GCG	2	6	619376	619381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
11118	NC_003198	GCG	2	6	619397	619402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759537
11119	NC_003198	GGAG	2	8	619417	619424	25 %	0 %	75 %	0 %	16759537
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11121	NC_003198	AGC	2	6	619493	619498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759537
11122	NC_003198	CTG	2	6	619532	619537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759537
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11153	NC_003198	CTGTA	2	10	621690	621699	20 %	40 %	20 %	20 %	16759538
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11228	NC_003198	ACGT	2	8	625706	625713	25 %	25 %	25 %	25 %	16759545
11229	NC_003198	CAA	2	6	625880	625885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759545
11230	NC_003198	GCTT	2	8	625903	625910	0 %	50 %	25 %	25 %	16759545
11231	NC_003198	TTC	2	6	625948	625953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759545
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11234	NC_003198	GCCA	3	12	626287	626298	25 %	0 %	25 %	50 %	16759545
11235	NC_003198	ATC	2	6	626352	626357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759545
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11238	NC_003198	TGA	2	6	626563	626568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759545
11239	NC_003198	TGT	2	6	626615	626620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759545
11240	NC_003198	AG	3	6	626632	626637	50 %	0 %	50 %	0 %	16759545
11241	NC_003198	CTG	2	6	626674	626679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759545
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11364	NC_003198	GGC	3	9	632262	632270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759548
11365	NC_003198	CGGG	2	8	632273	632280	0 %	0 %	75 %	25 %	16759548
11366	NC_003198	CTGCCG	2	12	632452	632463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16759548
11367	NC_003198	CGC	2	6	632471	632476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759548
11368	NC_003198	CGC	2	6	632520	632525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759548
11369	NC_003198	CTG	2	6	632539	632544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759548
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11373	NC_003198	GCT	2	6	632700	632705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759548
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11392	NC_003198	ATT	2	6	633403	633408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759548
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11483	NC_003198	GCT	2	6	637903	637908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11484	NC_003198	TGGCG	2	10	637909	637918	0 %	20 %	60 %	20 %	16759552
11485	NC_003198	ATG	2	6	637937	637942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759552
11486	NC_003198	CGG	2	6	637984	637989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11487	NC_003198	TGG	2	6	638010	638015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759552
11488	NC_003198	GCG	2	6	638016	638021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11489	NC_003198	CTG	2	6	638057	638062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11490	NC_003198	GC	3	6	638063	638068	0 %	0 %	50 %	50 %	16759552
11491	NC_003198	GCT	2	6	638110	638115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759552
11492	NC_003198	AT	3	6	638138	638143	50 %	50 %	0 %	0 %	16759552
11493	NC_003198	GGC	2	6	638197	638202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11494	NC_003198	G	6	6	638296	638301	0 %	0 %	100 %	0 %	16759552
11495	NC_003198	TTGC	2	8	638306	638313	0 %	50 %	25 %	25 %	16759552
11496	NC_003198	GCG	3	9	638316	638324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11497	NC_003198	GGC	2	6	638344	638349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552
11498	NC_003198	TTA	2	6	638361	638366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759552
11499	NC_003198	TCC	2	6	638404	638409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759552
11500	NC_003198	GGC	2	6	638443	638448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759552

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