MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003198	CAT	2	6	554733	554738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759479
10002	NC_003198	GCCGA	2	10	554758	554767	20 %	0 %	40 %	40 %	16759479
10003	NC_003198	AGT	2	6	554804	554809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759479
10004	NC_003198	CGG	2	6	554828	554833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759479
10005	NC_003198	CGG	2	6	554876	554881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759479
10006	NC_003198	CG	3	6	554888	554893	0 %	0 %	50 %	50 %	16759479
10007	NC_003198	GAG	2	6	555052	555057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759479
10008	NC_003198	CGGA	2	8	555072	555079	25 %	0 %	50 %	25 %	16759479
10009	NC_003198	TGG	2	6	555122	555127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759479
10010	NC_003198	GCA	2	6	555143	555148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759479
10011	NC_003198	CG	3	6	555151	555156	0 %	0 %	50 %	50 %	16759479
10012	NC_003198	TGGTCA	2	12	555221	555232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16759479
10013	NC_003198	GCG	2	6	555271	555276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759479
10014	NC_003198	CG	3	6	555275	555280	0 %	0 %	50 %	50 %	16759479
10015	NC_003198	CCT	2	6	555347	555352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759479
10016	NC_003198	CAT	2	6	555378	555383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759479
10017	NC_003198	ACA	2	6	555418	555423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759479
10018	NC_003198	CGA	2	6	555515	555520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759479
10019	NC_003198	CGA	2	6	555530	555535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759479
10020	NC_003198	CGA	2	6	555762	555767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759480
10021	NC_003198	GTT	2	6	555853	555858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759480
10022	NC_003198	TGG	2	6	555864	555869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759480
10023	NC_003198	TAA	2	6	555876	555881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759480
10024	NC_003198	TAC	2	6	555922	555927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759480
10025	NC_003198	CAG	2	6	555950	555955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759480
10026	NC_003198	CGG	2	6	556126	556131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759480
10027	NC_003198	CGA	2	6	556192	556197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759480
10028	NC_003198	GC	3	6	556206	556211	0 %	0 %	50 %	50 %	16759480
10029	NC_003198	ATT	2	6	556244	556249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759480
10030	NC_003198	GA	3	6	556353	556358	50 %	0 %	50 %	0 %	16759480
10031	NC_003198	AGG	2	6	556362	556367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759480
10032	NC_003198	ATA	2	6	556384	556389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759480
10033	NC_003198	TGC	2	6	556417	556422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759481
10034	NC_003198	TGG	3	9	556423	556431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759481
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10039	NC_003198	AT	3	6	556631	556636	50 %	50 %	0 %	0 %	16759481
10040	NC_003198	TC	3	6	556649	556654	0 %	50 %	0 %	50 %	16759481
10041	NC_003198	TGG	2	6	556777	556782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759481
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10044	NC_003198	CCG	2	6	556882	556887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759481
10045	NC_003198	CGA	2	6	556924	556929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759481
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10048	NC_003198	CAGC	2	8	557056	557063	25 %	0 %	25 %	50 %	16759481
10049	NC_003198	CAT	2	6	557072	557077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759481
10050	NC_003198	TCA	2	6	557117	557122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759481
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10052	NC_003198	CGG	3	9	557343	557351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759482
10053	NC_003198	CTT	2	6	557391	557396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759482
10054	NC_003198	TGCAAC	2	12	557414	557425	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16759482
10055	NC_003198	GTTGC	2	10	557430	557439	0 %	40 %	40 %	20 %	16759482
10056	NC_003198	TGC	2	6	557471	557476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759482
10057	NC_003198	CCG	2	6	557502	557507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759482
10058	NC_003198	ATCCTG	2	12	557554	557565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759482
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10060	NC_003198	CCT	2	6	557712	557717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759482
10061	NC_003198	TTG	2	6	557734	557739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759482
10062	NC_003198	CTT	2	6	557751	557756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759482
10063	NC_003198	CAG	2	6	557776	557781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759482
10064	NC_003198	GCG	2	6	557882	557887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759482
10065	NC_003198	ATC	2	6	557888	557893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759482
10066	NC_003198	CTG	2	6	558046	558051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759482
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10068	NC_003198	CTA	2	6	558284	558289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759483
10069	NC_003198	CG	3	6	558313	558318	0 %	0 %	50 %	50 %	16759483
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10071	NC_003198	GGC	2	6	558480	558485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759483
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10081	NC_003198	TTA	2	6	558902	558907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759483
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10083	NC_003198	A	6	6	559198	559203	100 %	0 %	0 %	0 %	16759484
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10087	NC_003198	CTG	2	6	559471	559476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759484
10088	NC_003198	CGAC	2	8	559506	559513	25 %	0 %	25 %	50 %	16759484
10089	NC_003198	GTTTT	2	10	559514	559523	0 %	80 %	20 %	0 %	16759484
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10094	NC_003198	GTTTT	2	10	559934	559943	0 %	80 %	20 %	0 %	16759485
10095	NC_003198	GCT	2	6	560049	560054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759485
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10100	NC_003198	GC	4	8	560134	560141	0 %	0 %	50 %	50 %	16759485
10101	NC_003198	GGC	2	6	560289	560294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759485
10102	NC_003198	GC	3	6	560293	560298	0 %	0 %	50 %	50 %	16759485
10103	NC_003198	CGG	2	6	560305	560310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759485
10104	NC_003198	AGG	3	9	560336	560344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759485
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10106	NC_003198	CTGG	2	8	560399	560406	0 %	25 %	50 %	25 %	16759486
10107	NC_003198	CGC	2	6	560623	560628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759486
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10109	NC_003198	GCT	2	6	560747	560752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759486
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10112	NC_003198	CGG	2	6	560942	560947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759486
10113	NC_003198	CGC	2	6	560950	560955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759486
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10115	NC_003198	GCA	2	6	561065	561070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759486
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10119	NC_003198	TGG	2	6	561163	561168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759486
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10121	NC_003198	ATC	2	6	561216	561221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759486
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10487	NC_003198	ATC	2	6	583274	583279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759503
10488	NC_003198	ATCCTG	2	12	583322	583333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759503
10489	NC_003198	ATA	2	6	583340	583345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759503
10490	NC_003198	AAT	2	6	583416	583421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759503
10491	NC_003198	GAA	2	6	583428	583433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759503
10492	NC_003198	CAG	2	6	583532	583537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759503
10493	NC_003198	ATC	4	12	583557	583568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759503
10494	NC_003198	GCG	2	6	583590	583595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759503
10495	NC_003198	TAA	2	6	583598	583603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759503
10496	NC_003198	GC	3	6	583633	583638	0 %	0 %	50 %	50 %	16759503
10497	NC_003198	GGT	2	6	583718	583723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759503
10498	NC_003198	ATG	2	6	583740	583745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759503
10499	NC_003198	CCGCC	2	10	583801	583810	0 %	0 %	20 %	80 %	16759503
10500	NC_003198	AGAC	2	8	583844	583851	50 %	0 %	25 %	25 %	16759503

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