MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_003198	TAT	2	6	501578	501583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759432
9003	NC_003198	ATT	2	6	501632	501637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759432
9004	NC_003198	GAT	2	6	501653	501658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759432
9005	NC_003198	ATC	2	6	501731	501736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759432
9006	NC_003198	GGC	2	6	501749	501754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759432
9007	NC_003198	GCTG	2	8	501762	501769	0 %	25 %	50 %	25 %	16759432
9008	NC_003198	GTC	2	6	501844	501849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9009	NC_003198	TGG	2	6	501861	501866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759432
9010	NC_003198	GAT	2	6	501875	501880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759432
9011	NC_003198	CGA	2	6	501919	501924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9012	NC_003198	GCA	2	6	501976	501981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9013	NC_003198	GCAA	2	8	501998	502005	50 %	0 %	25 %	25 %	16759432
9014	NC_003198	TGT	2	6	502207	502212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759432
9015	NC_003198	AAC	2	6	502302	502307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759432
9016	NC_003198	CTG	2	6	502331	502336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9017	NC_003198	GCG	2	6	502376	502381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759432
9018	NC_003198	GGC	2	6	502441	502446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759432
9019	NC_003198	CGA	2	6	502464	502469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9020	NC_003198	TGGCG	2	10	502486	502495	0 %	20 %	60 %	20 %	16759432
9021	NC_003198	CGT	2	6	502513	502518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9022	NC_003198	CTG	2	6	502520	502525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9023	NC_003198	A	6	6	502568	502573	100 %	0 %	0 %	0 %	16759432
9024	NC_003198	TGA	2	6	502626	502631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759432
9025	NC_003198	AAAATC	2	12	502652	502663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16759432
9026	NC_003198	CAG	2	6	502679	502684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759432
9027	NC_003198	TTA	2	6	502862	502867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759433
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9029	NC_003198	GC	3	6	502901	502906	0 %	0 %	50 %	50 %	16759433
9030	NC_003198	GGC	2	6	502908	502913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759433
9031	NC_003198	A	6	6	502926	502931	100 %	0 %	0 %	0 %	16759433
9032	NC_003198	CTT	2	6	502961	502966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759433
9033	NC_003198	TCC	2	6	502969	502974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759433
9034	NC_003198	GAT	2	6	503005	503010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759433
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9036	NC_003198	TGA	2	6	503063	503068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759433
9037	NC_003198	A	6	6	503083	503088	100 %	0 %	0 %	0 %	16759433
9038	NC_003198	GAG	2	6	503113	503118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759433
9039	NC_003198	GAT	2	6	503140	503145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759433
9040	NC_003198	GC	3	6	503171	503176	0 %	0 %	50 %	50 %	16759433
9041	NC_003198	TGG	2	6	503177	503182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759433
9042	NC_003198	ATC	2	6	503343	503348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759434
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9044	NC_003198	TGG	2	6	503469	503474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759434
9045	NC_003198	CGG	2	6	503502	503507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759434
9046	NC_003198	CCAG	2	8	503532	503539	25 %	0 %	25 %	50 %	16759434
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9048	NC_003198	GCG	2	6	503562	503567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759434
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9050	NC_003198	TCA	2	6	503622	503627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759434
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9052	NC_003198	T	6	6	503834	503839	0 %	100 %	0 %	0 %	16759435
9053	NC_003198	GCC	2	6	503848	503853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759435
9054	NC_003198	CCG	2	6	503858	503863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759435
9055	NC_003198	GC	3	6	503896	503901	0 %	0 %	50 %	50 %	16759435
9056	NC_003198	AAT	2	6	503993	503998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759435
9057	NC_003198	CGC	2	6	504192	504197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759435
9058	NC_003198	GCT	2	6	504297	504302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759435
9059	NC_003198	GTTC	2	8	504311	504318	0 %	50 %	25 %	25 %	16759435
9060	NC_003198	GC	3	6	504344	504349	0 %	0 %	50 %	50 %	16759435
9061	NC_003198	GC	4	8	504373	504380	0 %	0 %	50 %	50 %	16759435
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9067	NC_003198	GCG	2	6	504693	504698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759436
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9069	NC_003198	TTG	2	6	504733	504738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759436
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9071	NC_003198	CAT	2	6	504904	504909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759436
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9089	NC_003198	CG	3	6	505852	505857	0 %	0 %	50 %	50 %	16759436
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9093	NC_003198	CAT	2	6	506038	506043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759436
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9102	NC_003198	TGC	2	6	506609	506614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759437
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9106	NC_003198	CGGG	2	8	507048	507055	0 %	0 %	75 %	25 %	16759437
9107	NC_003198	ATGCC	2	10	507071	507080	20 %	20 %	20 %	40 %	16759437
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9241	NC_003198	CGA	2	6	513582	513587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759443
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9491	NC_003198	CG	3	6	526746	526751	0 %	0 %	50 %	50 %	16759457
9492	NC_003198	CGA	2	6	526861	526866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759457
9493	NC_003198	AGA	2	6	526921	526926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759457
9494	NC_003198	ACG	2	6	526927	526932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759457
9495	NC_003198	TGC	2	6	527073	527078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759457
9496	NC_003198	CTG	2	6	527087	527092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759457
9497	NC_003198	CGT	2	6	527096	527101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759457
9498	NC_003198	GCG	2	6	527102	527107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759457
9499	NC_003198	A	7	7	527176	527182	100 %	0 %	0 %	0 %	16759457
9500	NC_003198	CTG	2	6	527207	527212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759457

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