MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

< Previous12...157158159160161162163164165166167168169Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84001	NC_003198	GGC	2	6	4796681	4796686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763379
84002	NC_003198	CGA	2	6	4796696	4796701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84003	NC_003198	GTT	2	6	4796846	4796851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763379
84004	NC_003198	ATT	2	6	4796881	4796886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763379
84005	NC_003198	GCA	2	6	4796935	4796940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84006	NC_003198	ATC	2	6	4797012	4797017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763379
84007	NC_003198	TGG	2	6	4797144	4797149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763379
84008	NC_003198	CCGC	2	8	4797203	4797210	0 %	0 %	25 %	75 %	16763379
84009	NC_003198	GCA	2	6	4797229	4797234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84010	NC_003198	GGC	2	6	4797347	4797352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763379
84011	NC_003198	CGCGG	2	10	4797357	4797366	0 %	0 %	60 %	40 %	16763379
84012	NC_003198	CCGC	2	8	4797387	4797394	0 %	0 %	25 %	75 %	16763379
84013	NC_003198	CTG	2	6	4797465	4797470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84014	NC_003198	TGA	2	6	4797524	4797529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763379
84015	NC_003198	GC	3	6	4797552	4797557	0 %	0 %	50 %	50 %	16763379
84016	NC_003198	GGC	2	6	4797569	4797574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763379
84017	NC_003198	A	6	6	4797575	4797580	100 %	0 %	0 %	0 %	16763379
84018	NC_003198	TCCT	2	8	4797599	4797606	0 %	50 %	0 %	50 %	16763379
84019	NC_003198	GTC	2	6	4797615	4797620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84020	NC_003198	GA	3	6	4797724	4797729	50 %	0 %	50 %	0 %	16763379
84021	NC_003198	AGC	2	6	4797834	4797839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763379
84022	NC_003198	GGC	2	6	4797866	4797871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763379
84023	NC_003198	CTC	2	6	4797876	4797881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763379
84024	NC_003198	GGTGA	2	10	4797885	4797894	20 %	20 %	60 %	0 %	16763379
84025	NC_003198	GGC	2	6	4797915	4797920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763379
84026	NC_003198	C	6	6	4798027	4798032	0 %	0 %	0 %	100 %	16763380
84027	NC_003198	TGT	2	6	4798033	4798038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763380
84028	NC_003198	GGC	2	6	4798056	4798061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763380
84029	NC_003198	CTG	2	6	4798071	4798076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763380
84030	NC_003198	TGA	2	6	4798087	4798092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763380
84031	NC_003198	TGG	2	6	4798192	4798197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763380
84032	NC_003198	TCG	2	6	4798444	4798449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763380
84033	NC_003198	GC	3	6	4798464	4798469	0 %	0 %	50 %	50 %	16763380
84034	NC_003198	AG	3	6	4798548	4798553	50 %	0 %	50 %	0 %	16763380
84035	NC_003198	CAGT	2	8	4798577	4798584	25 %	25 %	25 %	25 %	16763380
84036	NC_003198	TTC	2	6	4798720	4798725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763380
84037	NC_003198	CGA	2	6	4798900	4798905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763380
84038	NC_003198	TTG	2	6	4798917	4798922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763380
84039	NC_003198	CTTT	2	8	4798942	4798949	0 %	75 %	0 %	25 %	16763380
84040	NC_003198	CTG	2	6	4798995	4799000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763380
84041	NC_003198	CTG	2	6	4799028	4799033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763380
84042	NC_003198	CGC	2	6	4799078	4799083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763380
84043	NC_003198	TGA	2	6	4799101	4799106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763380
84044	NC_003198	GGC	2	6	4799259	4799264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763380
84045	NC_003198	CT	3	6	4799301	4799306	0 %	50 %	0 %	50 %	16763380
84046	NC_003198	AAAT	2	8	4799361	4799368	75 %	25 %	0 %	0 %	16763380
84047	NC_003198	ATT	2	6	4800548	4800553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763381
84048	NC_003198	GCG	2	6	4800628	4800633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763381
84049	NC_003198	TGG	2	6	4800881	4800886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763381
84050	NC_003198	AG	3	6	4800934	4800939	50 %	0 %	50 %	0 %	16763381
84051	NC_003198	ATG	2	6	4801046	4801051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763381
84052	NC_003198	GGC	2	6	4801074	4801079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763381
84053	NC_003198	GCA	2	6	4801084	4801089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763381
84054	NC_003198	GGC	2	6	4803781	4803786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763382
84055	NC_003198	TGA	2	6	4803811	4803816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763382
84056	NC_003198	ATA	2	6	4803883	4803888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763382
84057	NC_003198	TAA	2	6	4803909	4803914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763382
84058	NC_003198	TTG	2	6	4803940	4803945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763382
84059	NC_003198	ATAA	2	8	4803988	4803995	75 %	25 %	0 %	0 %	16763382
84060	NC_003198	ATC	2	6	4804045	4804050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763382
84061	NC_003198	ATA	2	6	4804178	4804183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763382
84062	NC_003198	ATTG	2	8	4804267	4804274	25 %	50 %	25 %	0 %	16763382
84063	NC_003198	TCA	2	6	4804280	4804285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763382
84064	NC_003198	CAA	3	9	4804317	4804325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763382
84065	NC_003198	T	6	6	4804389	4804394	0 %	100 %	0 %	0 %	16763382
84066	NC_003198	GGC	2	6	4804538	4804543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763383
84067	NC_003198	CTG	2	6	4804558	4804563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763383
84068	NC_003198	CAT	2	6	4804594	4804599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763383
84069	NC_003198	GTTGG	2	10	4804698	4804707	0 %	40 %	60 %	0 %	16763383
84070	NC_003198	ATC	2	6	4804709	4804714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763383
84071	NC_003198	TGG	2	6	4804861	4804866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763383
84072	NC_003198	GAT	2	6	4804982	4804987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763383
84073	NC_003198	TTA	2	6	4804995	4805000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763383
84074	NC_003198	TA	3	6	4805398	4805403	50 %	50 %	0 %	0 %	16763384
84075	NC_003198	CTG	2	6	4805464	4805469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763384
84076	NC_003198	ATA	2	6	4805683	4805688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763384
84077	NC_003198	GGT	2	6	4805695	4805700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763384
84078	NC_003198	A	6	6	4805710	4805715	100 %	0 %	0 %	0 %	16763384
84079	NC_003198	TCT	2	6	4805729	4805734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763384
84080	NC_003198	CAC	2	6	4805787	4805792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763384
84081	NC_003198	GATT	2	8	4805861	4805868	25 %	50 %	25 %	0 %	16763384
84082	NC_003198	T	7	7	4805963	4805969	0 %	100 %	0 %	0 %	16763384
84083	NC_003198	CCG	2	6	4805996	4806001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763384
84084	NC_003198	AGCGA	2	10	4806273	4806282	40 %	0 %	40 %	20 %	16763385
84085	NC_003198	GGA	2	6	4806297	4806302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763385
84086	NC_003198	GA	3	6	4806310	4806315	50 %	0 %	50 %	0 %	16763385
84087	NC_003198	GCGG	2	8	4806332	4806339	0 %	0 %	75 %	25 %	16763385
84088	NC_003198	CGC	2	6	4806358	4806363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763385
84089	NC_003198	CTC	2	6	4806373	4806378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763385
84090	NC_003198	GAT	2	6	4806434	4806439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763385
84091	NC_003198	TCA	2	6	4806476	4806481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763385
84092	NC_003198	AGC	2	6	4806637	4806642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763385
84093	NC_003198	TGA	2	6	4806652	4806657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763385
84094	NC_003198	AGC	2	6	4806684	4806689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763385
84095	NC_003198	T	6	6	4806700	4806705	0 %	100 %	0 %	0 %	16763385
84096	NC_003198	CGC	2	6	4806989	4806994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763386
84097	NC_003198	TGG	2	6	4807019	4807024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763386
84098	NC_003198	GAT	2	6	4807026	4807031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763386
84099	NC_003198	ACG	2	6	4807071	4807076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763386
84100	NC_003198	T	7	7	4807127	4807133	0 %	100 %	0 %	0 %	16763386
84101	NC_003198	CAG	2	6	4807134	4807139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763386
84102	NC_003198	GCA	2	6	4807181	4807186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763386
84103	NC_003198	CG	3	6	4807188	4807193	0 %	0 %	50 %	50 %	16763386
84104	NC_003198	ACG	2	6	4807296	4807301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763386
84105	NC_003198	CAG	2	6	4807338	4807343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763386
84106	NC_003198	ATC	2	6	4807395	4807400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763386
84107	NC_003198	AG	3	6	4807560	4807565	50 %	0 %	50 %	0 %	16763386
84108	NC_003198	CAT	2	6	4807604	4807609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763386
84109	NC_003198	CAA	2	6	4807834	4807839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763387
84110	NC_003198	CAT	2	6	4807840	4807845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763387
84111	NC_003198	GCC	2	6	4808381	4808386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763388
84112	NC_003198	ATT	2	6	4808486	4808491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763388
84113	NC_003198	ATA	2	6	4808493	4808498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763388
84114	NC_003198	CGA	2	6	4808553	4808558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763388
84115	NC_003198	TAC	2	6	4808585	4808590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763388
84116	NC_003198	TTA	2	6	4808615	4808620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763388
84117	NC_003198	ACG	2	6	4808688	4808693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763388
84118	NC_003198	GCTGGC	2	12	4808695	4808706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16763388
84119	NC_003198	GGC	2	6	4808731	4808736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763388
84120	NC_003198	TGA	2	6	4808833	4808838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763388
84121	NC_003198	CG	4	8	4808858	4808865	0 %	0 %	50 %	50 %	16763388
84122	NC_003198	GGC	2	6	4808893	4808898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763388
84123	NC_003198	ACA	2	6	4808926	4808931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763388
84124	NC_003198	CTG	2	6	4808942	4808947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763388
84125	NC_003198	A	8	8	4808994	4809001	100 %	0 %	0 %	0 %	16763388

< Previous12...157158159160161162163164165166167168169Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.