MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
80001	NC_003198	TAC	2	6	4563302	4563307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763166
80002	NC_003198	GACG	2	8	4563343	4563350	25 %	0 %	50 %	25 %	16763166
80003	NC_003198	CAA	2	6	4563359	4563364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763166
80004	NC_003198	GC	3	6	4563391	4563396	0 %	0 %	50 %	50 %	16763166
80005	NC_003198	CG	4	8	4563397	4563404	0 %	0 %	50 %	50 %	16763166
80006	NC_003198	GCA	2	6	4563412	4563417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763166
80007	NC_003198	GCC	2	6	4563449	4563454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763166
80008	NC_003198	A	6	6	4563805	4563810	100 %	0 %	0 %	0 %	16763167
80009	NC_003198	TGA	2	6	4563834	4563839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763167
80010	NC_003198	TTTA	2	8	4563882	4563889	25 %	75 %	0 %	0 %	16763167
80011	NC_003198	TA	3	6	4563914	4563919	50 %	50 %	0 %	0 %	16763167
80012	NC_003198	T	6	6	4563935	4563940	0 %	100 %	0 %	0 %	16763167
80013	NC_003198	ATG	2	6	4563956	4563961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763167
80014	NC_003198	AGA	2	6	4563988	4563993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763167
80015	NC_003198	AAT	2	6	4564016	4564021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763167
80016	NC_003198	ATGG	2	8	4564081	4564088	25 %	25 %	50 %	0 %	16763167
80017	NC_003198	CGG	2	6	4564095	4564100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80018	NC_003198	GCA	2	6	4564150	4564155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763167
80019	NC_003198	GCT	2	6	4564195	4564200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763167
80020	NC_003198	GAT	2	6	4564213	4564218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763167
80021	NC_003198	GT	3	6	4564228	4564233	0 %	50 %	50 %	0 %	16763167
80022	NC_003198	CGC	2	6	4564234	4564239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763167
80023	NC_003198	CGG	2	6	4564269	4564274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80024	NC_003198	AGTG	2	8	4564318	4564325	25 %	25 %	50 %	0 %	16763167
80025	NC_003198	TTA	2	6	4564337	4564342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763167
80026	NC_003198	TGG	2	6	4564345	4564350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763167
80027	NC_003198	TGT	2	6	4564416	4564421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763167
80028	NC_003198	CGG	2	6	4564450	4564455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80029	NC_003198	CGG	2	6	4564468	4564473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80030	NC_003198	TGG	2	6	4564476	4564481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763167
80031	NC_003198	T	6	6	4564772	4564777	0 %	100 %	0 %	0 %	16763167
80032	NC_003198	ATT	2	6	4564805	4564810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763167
80033	NC_003198	GAC	2	6	4564846	4564851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763167
80034	NC_003198	GTGC	2	8	4564894	4564901	0 %	25 %	50 %	25 %	16763167
80035	NC_003198	CTT	2	6	4565029	4565034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763167
80036	NC_003198	TGG	2	6	4565118	4565123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763167
80037	NC_003198	CAT	2	6	4565146	4565151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763167
80038	NC_003198	CCAG	2	8	4565152	4565159	25 %	0 %	25 %	50 %	16763167
80039	NC_003198	GAT	2	6	4565194	4565199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763167
80040	NC_003198	CGG	2	6	4565200	4565205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80041	NC_003198	TCT	3	9	4565211	4565219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763167
80042	NC_003198	GCT	2	6	4565221	4565226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763167
80043	NC_003198	GGCGAT	2	12	4565227	4565238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16763167
80044	NC_003198	CAG	2	6	4565251	4565256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763167
80045	NC_003198	GCG	2	6	4565282	4565287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763167
80046	NC_003198	TGA	2	6	4565356	4565361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763168
80047	NC_003198	GA	3	6	4565372	4565377	50 %	0 %	50 %	0 %	16763168
80048	NC_003198	TTCT	2	8	4565452	4565459	0 %	75 %	0 %	25 %	16763168
80049	NC_003198	GTA	2	6	4565493	4565498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763168
80050	NC_003198	TGT	2	6	4565573	4565578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763168
80051	NC_003198	TGG	2	6	4565605	4565610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763168
80052	NC_003198	CCTG	2	8	4565651	4565658	0 %	25 %	25 %	50 %	16763168
80053	NC_003198	ATA	2	6	4565675	4565680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763168
80054	NC_003198	CCG	2	6	4565826	4565831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763169
80055	NC_003198	GGC	2	6	4565832	4565837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763169
80056	NC_003198	GTTT	2	8	4565870	4565877	0 %	75 %	25 %	0 %	16763169
80057	NC_003198	CCG	2	6	4565879	4565884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763169
80058	NC_003198	CGG	2	6	4565908	4565913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763169
80059	NC_003198	AGCC	2	8	4565943	4565950	25 %	0 %	25 %	50 %	16763169
80060	NC_003198	TGG	2	6	4565960	4565965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763169
80061	NC_003198	CTG	2	6	4566037	4566042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763169
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80067	NC_003198	CG	3	6	4566171	4566176	0 %	0 %	50 %	50 %	16763169
80068	NC_003198	TGG	3	9	4566267	4566275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763169
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80073	NC_003198	GCAG	2	8	4566584	4566591	25 %	0 %	50 %	25 %	16763169
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80086	NC_003198	CCAGCG	2	12	4567212	4567223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16763169
80087	NC_003198	CGC	2	6	4567224	4567229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763169
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80090	NC_003198	GTA	2	6	4567342	4567347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763169
80091	NC_003198	GGGC	2	8	4567409	4567416	0 %	0 %	75 %	25 %	16763169
80092	NC_003198	GCG	2	6	4567421	4567426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763169
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80101	NC_003198	TTC	2	6	4568086	4568091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763169
80102	NC_003198	GCT	2	6	4568136	4568141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763169
80103	NC_003198	GC	4	8	4568175	4568182	0 %	0 %	50 %	50 %	16763169
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80105	NC_003198	GCT	2	6	4568283	4568288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763169
80106	NC_003198	ATCC	2	8	4568302	4568309	25 %	25 %	0 %	50 %	16763169
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80108	NC_003198	CGA	2	6	4568364	4568369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763169
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80110	NC_003198	GC	3	6	4568421	4568426	0 %	0 %	50 %	50 %	16763169
80111	NC_003198	GTT	2	6	4568545	4568550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763169
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