MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_003198	AGA	2	6	4222468	4222473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762827
74002	NC_003198	TGG	2	6	4222618	4222623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762828
74003	NC_003198	GTAC	2	8	4222641	4222648	25 %	25 %	25 %	25 %	16762828
74004	NC_003198	AGA	2	6	4222649	4222654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762828
74005	NC_003198	GT	3	6	4222657	4222662	0 %	50 %	50 %	0 %	16762828
74006	NC_003198	TGA	2	6	4222667	4222672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762828
74007	NC_003198	TCTGG	2	10	4222725	4222734	0 %	40 %	40 %	20 %	16762828
74008	NC_003198	ACG	2	6	4222792	4222797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762828
74009	NC_003198	TGA	2	6	4222859	4222864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762828
74010	NC_003198	CCGGTA	2	12	4222908	4222919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16762828
74011	NC_003198	GTT	2	6	4223004	4223009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16762828
74012	NC_003198	GAA	3	9	4223028	4223036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762828
74013	NC_003198	GC	3	6	4223059	4223064	0 %	0 %	50 %	50 %	16762828
74014	NC_003198	CAC	3	9	4223070	4223078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16762828
74015	NC_003198	GCT	2	6	4223095	4223100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762828
74016	NC_003198	GGTCAT	2	12	4223106	4223117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16762828
74017	NC_003198	CGG	2	6	4223135	4223140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762828
74018	NC_003198	GCT	2	6	4223146	4223151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762828
74019	NC_003198	GCG	2	6	4223152	4223157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762828
74020	NC_003198	GTG	2	6	4223158	4223163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762828
74021	NC_003198	AAT	2	6	4223378	4223383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16762829
74022	NC_003198	GCG	4	12	4223384	4223395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762829
74023	NC_003198	TCT	2	6	4223398	4223403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16762829
74024	NC_003198	GAT	2	6	4223462	4223467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762829
74025	NC_003198	TTC	2	6	4223517	4223522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16762829
74026	NC_003198	ATG	2	6	4223593	4223598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762829
74027	NC_003198	GCT	2	6	4223837	4223842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74028	NC_003198	ACG	2	6	4223847	4223852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74029	NC_003198	TGC	2	6	4223885	4223890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74030	NC_003198	GCG	2	6	4223895	4223900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762830
74031	NC_003198	AGC	2	6	4223927	4223932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74032	NC_003198	ACG	2	6	4223941	4223946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74033	NC_003198	GCT	2	6	4224147	4224152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74034	NC_003198	CCT	2	6	4224241	4224246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16762830
74035	NC_003198	AGAA	2	8	4224271	4224278	75 %	0 %	25 %	0 %	16762830
74036	NC_003198	AGGCG	2	10	4224284	4224293	20 %	0 %	60 %	20 %	16762830
74037	NC_003198	CG	3	6	4224370	4224375	0 %	0 %	50 %	50 %	16762830
74038	NC_003198	CTGG	2	8	4224412	4224419	0 %	25 %	50 %	25 %	16762830
74039	NC_003198	GCT	2	6	4224545	4224550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74040	NC_003198	TGC	2	6	4224617	4224622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762830
74041	NC_003198	A	6	6	4224624	4224629	100 %	0 %	0 %	0 %	16762830
74042	NC_003198	CG	4	8	4225213	4225220	0 %	0 %	50 %	50 %	16762831
74043	NC_003198	TGA	2	6	4225234	4225239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762831
74044	NC_003198	AGC	2	6	4225270	4225275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762831
74045	NC_003198	CCG	2	6	4225347	4225352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16762831
74046	NC_003198	CCT	2	6	4225387	4225392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16762831
74047	NC_003198	GAA	2	6	4225434	4225439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762831
74048	NC_003198	AC	3	6	4225568	4225573	50 %	0 %	0 %	50 %	16762831
74049	NC_003198	GCG	2	6	4225603	4225608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762831
74050	NC_003198	ATAA	2	8	4225624	4225631	75 %	25 %	0 %	0 %	16762831
74051	NC_003198	CAG	2	6	4225673	4225678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762832
74052	NC_003198	CAG	2	6	4225681	4225686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762832
74053	NC_003198	GCT	2	6	4225708	4225713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762832
74054	NC_003198	GCGA	2	8	4225790	4225797	25 %	0 %	50 %	25 %	16762832
74055	NC_003198	GCA	2	6	4225837	4225842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762832
74056	NC_003198	CGG	2	6	4225869	4225874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762832
74057	NC_003198	TCG	2	6	4225879	4225884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762832
74058	NC_003198	TAT	2	6	4225888	4225893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16762832
74059	NC_003198	TGA	2	6	4225894	4225899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762832
74060	NC_003198	GC	3	6	4225968	4225973	0 %	0 %	50 %	50 %	16762832
74061	NC_003198	TC	3	6	4225985	4225990	0 %	50 %	0 %	50 %	16762832
74062	NC_003198	GTG	2	6	4226003	4226008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762832
74063	NC_003198	CGC	2	6	4226048	4226053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16762833
74064	NC_003198	GCT	2	6	4226088	4226093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762833
74065	NC_003198	T	6	6	4226128	4226133	0 %	100 %	0 %	0 %	16762833
74066	NC_003198	TTA	2	6	4226155	4226160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16762833
74067	NC_003198	ACGCC	2	10	4226303	4226312	20 %	0 %	20 %	60 %	16762833
74068	NC_003198	CGC	2	6	4226332	4226337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16762833
74069	NC_003198	ATG	2	6	4226351	4226356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762833
74070	NC_003198	TGC	2	6	4226382	4226387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762834
74071	NC_003198	TACCT	2	10	4226389	4226398	20 %	40 %	0 %	40 %	16762834
74072	NC_003198	TGC	2	6	4226430	4226435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762834
74073	NC_003198	TGC	2	6	4226463	4226468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762834
74074	NC_003198	AGA	2	6	4226554	4226559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762834
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74076	NC_003198	GTC	2	6	4226600	4226605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762834
74077	NC_003198	TA	3	6	4226903	4226908	50 %	50 %	0 %	0 %	16762835
74078	NC_003198	A	6	6	4226920	4226925	100 %	0 %	0 %	0 %	16762835
74079	NC_003198	GGT	2	6	4226995	4227000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762835
74080	NC_003198	TGATCC	2	12	4227029	4227040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16762835
74081	NC_003198	GC	3	6	4227092	4227097	0 %	0 %	50 %	50 %	16762835
74082	NC_003198	AAGC	2	8	4227124	4227131	50 %	0 %	25 %	25 %	16762835
74083	NC_003198	CGT	2	6	4227270	4227275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762836
74084	NC_003198	CTG	2	6	4227327	4227332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762836
74085	NC_003198	A	6	6	4227366	4227371	100 %	0 %	0 %	0 %	16762836
74086	NC_003198	AATC	2	8	4227382	4227389	50 %	25 %	0 %	25 %	16762836
74087	NC_003198	GC	3	6	4227397	4227402	0 %	0 %	50 %	50 %	16762836
74088	NC_003198	CCG	2	6	4227494	4227499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16762836
74089	NC_003198	GGT	2	6	4227504	4227509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762836
74090	NC_003198	GTCC	2	8	4227534	4227541	0 %	25 %	25 %	50 %	16762836
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74094	NC_003198	ACA	2	6	4227649	4227654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16762836
74095	NC_003198	CAA	2	6	4227704	4227709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16762836
74096	NC_003198	ACA	2	6	4227840	4227845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16762837
74097	NC_003198	ACT	2	6	4227903	4227908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16762837
74098	NC_003198	TGGA	2	8	4227984	4227991	25 %	25 %	50 %	0 %	16762837
74099	NC_003198	GCAGGA	2	12	4227992	4228003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16762837
74100	NC_003198	ACT	2	6	4228032	4228037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16762837
74101	NC_003198	TCTGG	2	10	4228042	4228051	0 %	40 %	40 %	20 %	16762837
74102	NC_003198	CGCAT	2	10	4228072	4228081	20 %	20 %	20 %	40 %	16762837
74103	NC_003198	CAT	2	6	4228085	4228090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16762837
74104	NC_003198	TGG	2	6	4228178	4228183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16762837
74105	NC_003198	CAAA	2	8	4228219	4228226	75 %	0 %	0 %	25 %	16762837
74106	NC_003198	CGTT	2	8	4228246	4228253	0 %	50 %	25 %	25 %	16762837
74107	NC_003198	GTT	2	6	4228290	4228295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16762837
74108	NC_003198	GAA	2	6	4228356	4228361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762837
74109	NC_003198	GTT	2	6	4228374	4228379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16762837
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74112	NC_003198	ACTG	2	8	4228556	4228563	25 %	25 %	25 %	25 %	16762837
74113	NC_003198	AAG	2	6	4228564	4228569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762837
74114	NC_003198	AAC	2	6	4228602	4228607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16762837
74115	NC_003198	ATC	2	6	4228611	4228616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16762837
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74117	NC_003198	CGA	3	9	4228766	4228774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762837
74118	NC_003198	CTT	2	6	4228832	4228837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16762837
74119	NC_003198	GT	3	6	4228840	4228845	0 %	50 %	50 %	0 %	16762837
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74121	NC_003198	GCT	2	6	4228980	4228985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762837
74122	NC_003198	TG	3	6	4229020	4229025	0 %	50 %	50 %	0 %	16762837
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74205	NC_003198	TAAAGG	2	12	4233654	4233665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16762843
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74224	NC_003198	A	6	6	4234631	4234636	100 %	0 %	0 %	0 %	16762845
74225	NC_003198	GCT	2	6	4234690	4234695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762845
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74228	NC_003198	A	6	6	4234798	4234803	100 %	0 %	0 %	0 %	16762845
74229	NC_003198	AAG	2	6	4234820	4234825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762845
74230	NC_003198	TCG	2	6	4234841	4234846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762845
74231	NC_003198	GCG	2	6	4234847	4234852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16762845
74232	NC_003198	GTT	2	6	4234884	4234889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16762846
74233	NC_003198	GTC	2	6	4234912	4234917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762846
74234	NC_003198	CGT	2	6	4234922	4234927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16762846
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74351	NC_003198	AAC	2	6	4241240	4241245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16762860
74352	NC_003198	GCA	2	6	4241254	4241259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762860
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74466	NC_003198	CAG	2	6	4247180	4247185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16762871
74467	NC_003198	ATG	2	6	4247186	4247191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16762871
74468	NC_003198	GTAC	2	8	4247201	4247208	25 %	25 %	25 %	25 %	16762871
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74482	NC_003198	GAA	2	6	4248110	4248115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16762872
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