MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 53990

< Previous12345678910111213...107108Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003106	TCT	2	6	124475	124480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920278
2002	NC_003106	CAT	2	6	124678	124683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920279
2003	NC_003106	ACAA	2	8	124693	124700	75 %	0 %	0 %	25 %	15920279
2004	NC_003106	TTA	3	9	124782	124790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920279
2005	NC_003106	GAAA	2	8	124797	124804	75 %	0 %	25 %	0 %	15920279
2006	NC_003106	AAGAT	2	10	124824	124833	60 %	20 %	20 %	0 %	15920279
2007	NC_003106	ATG	2	6	124878	124883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920279
2008	NC_003106	A	6	6	124889	124894	100 %	0 %	0 %	0 %	15920279
2009	NC_003106	ATTT	2	8	124958	124965	25 %	75 %	0 %	0 %	15920279
2010	NC_003106	ATA	2	6	124977	124982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920279
2011	NC_003106	GAA	3	9	125006	125014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920279
2012	NC_003106	A	6	6	125034	125039	100 %	0 %	0 %	0 %	15920279
2013	NC_003106	ATA	2	6	125060	125065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920279
2014	NC_003106	A	7	7	125075	125081	100 %	0 %	0 %	0 %	15920279
2015	NC_003106	TGA	2	6	125084	125089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920279
2016	NC_003106	AT	3	6	125178	125183	50 %	50 %	0 %	0 %	15920280
2017	NC_003106	AAC	2	6	125214	125219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920280
2018	NC_003106	TA	3	6	125238	125243	50 %	50 %	0 %	0 %	15920280
2019	NC_003106	AT	3	6	125298	125303	50 %	50 %	0 %	0 %	15920280
2020	NC_003106	TA	4	8	125325	125332	50 %	50 %	0 %	0 %	15920280
2021	NC_003106	AGT	2	6	125400	125405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920280
2022	NC_003106	TAT	2	6	125414	125419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920280
2023	NC_003106	ACC	2	6	125433	125438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920280
2024	NC_003106	TGG	2	6	125457	125462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920280
2025	NC_003106	ACT	2	6	125467	125472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920280
2026	NC_003106	AGC	2	6	125511	125516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920280
2027	NC_003106	AAC	2	6	125523	125528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920280
2028	NC_003106	AATC	2	8	125547	125554	50 %	25 %	0 %	25 %	15920280
2029	NC_003106	T	6	6	125564	125569	0 %	100 %	0 %	0 %	15920280
2030	NC_003106	A	6	6	125776	125781	100 %	0 %	0 %	0 %	15920281
2031	NC_003106	TAA	2	6	125788	125793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920281
2032	NC_003106	TA	4	8	125794	125801	50 %	50 %	0 %	0 %	15920281
2033	NC_003106	AAC	2	6	125818	125823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920281
2034	NC_003106	ATC	2	6	125933	125938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920281
2035	NC_003106	AAG	2	6	125942	125947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920281
2036	NC_003106	AGA	2	6	125986	125991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920281
2037	NC_003106	ATA	2	6	126092	126097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920281
2038	NC_003106	AAT	2	6	126177	126182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920281
2039	NC_003106	A	6	6	126215	126220	100 %	0 %	0 %	0 %	15920281
2040	NC_003106	TAAATG	2	12	126222	126233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920281
2041	NC_003106	GAA	2	6	126258	126263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920281
2042	NC_003106	ATA	2	6	126265	126270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920281
2043	NC_003106	A	6	6	126270	126275	100 %	0 %	0 %	0 %	15920281
2044	NC_003106	GAA	2	6	126296	126301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920282
2045	NC_003106	GAT	2	6	126325	126330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2046	NC_003106	AAT	2	6	126394	126399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920282
2047	NC_003106	ATG	2	6	126400	126405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2048	NC_003106	TAT	2	6	126428	126433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920282
2049	NC_003106	ATA	2	6	126477	126482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920282
2050	NC_003106	GAA	3	9	126512	126520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920282
2051	NC_003106	TAG	2	6	126653	126658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2052	NC_003106	ATT	2	6	126702	126707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920282
2053	NC_003106	GCA	2	6	126765	126770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920282
2054	NC_003106	CCT	2	6	126798	126803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920282
2055	NC_003106	AAG	2	6	127035	127040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920282
2056	NC_003106	ATG	2	6	127132	127137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2057	NC_003106	ATT	2	6	127335	127340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920282
2058	NC_003106	CTC	2	6	127342	127347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920282
2059	NC_003106	ATC	2	6	127380	127385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920282
2060	NC_003106	CTT	2	6	127404	127409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920282
2061	NC_003106	CAA	2	6	127429	127434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920282
2062	NC_003106	CAC	2	6	127480	127485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920282
2063	NC_003106	TAG	2	6	127533	127538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2064	NC_003106	CTA	2	6	127558	127563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920282
2065	NC_003106	AC	3	6	127648	127653	50 %	0 %	0 %	50 %	15920282
2066	NC_003106	CAA	2	6	127666	127671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920282
2067	NC_003106	CAG	2	6	127697	127702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920282
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2069	NC_003106	TATTGC	2	12	127775	127786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920282
2070	NC_003106	GAA	2	6	127800	127805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920282
2071	NC_003106	ATG	2	6	127844	127849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2072	NC_003106	GAT	2	6	127890	127895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
2073	NC_003106	AT	3	6	127983	127988	50 %	50 %	0 %	0 %	15920282
2074	NC_003106	GAA	2	6	128003	128008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920282
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2081	NC_003106	CATA	2	8	128326	128333	50 %	25 %	0 %	25 %	15920282
2082	NC_003106	GA	3	6	128365	128370	50 %	0 %	50 %	0 %	15920282
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2088	NC_003106	GTA	2	6	128550	128555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
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2090	NC_003106	TAA	2	6	128623	128628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920282
2091	NC_003106	TAG	3	9	128668	128676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920282
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2094	NC_003106	TC	3	6	128997	129002	0 %	50 %	0 %	50 %	15920283
2095	NC_003106	GTA	2	6	129029	129034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920283
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2099	NC_003106	CTC	2	6	129088	129093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920283
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2101	NC_003106	CA	3	6	129137	129142	50 %	0 %	0 %	50 %	15920283
2102	NC_003106	TATT	2	8	129171	129178	25 %	75 %	0 %	0 %	15920283
2103	NC_003106	TTTAAT	2	12	129209	129220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920283
2104	NC_003106	TA	3	6	129244	129249	50 %	50 %	0 %	0 %	15920283
2105	NC_003106	TGGA	2	8	129259	129266	25 %	25 %	50 %	0 %	15920283
2106	NC_003106	CATT	2	8	129279	129286	25 %	50 %	0 %	25 %	15920283
2107	NC_003106	CAA	2	6	129290	129295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920283
2108	NC_003106	CA	3	6	129303	129308	50 %	0 %	0 %	50 %	15920283
2109	NC_003106	TAG	2	6	129318	129323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920283
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2113	NC_003106	GTCA	2	8	129432	129439	25 %	25 %	25 %	25 %	15920283
2114	NC_003106	TA	3	6	129450	129455	50 %	50 %	0 %	0 %	15920283
2115	NC_003106	CTG	2	6	129465	129470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920283
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2121	NC_003106	TAA	2	6	129722	129727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920284
2122	NC_003106	GATA	2	8	129729	129736	50 %	25 %	25 %	0 %	15920284
2123	NC_003106	TA	3	6	129810	129815	50 %	50 %	0 %	0 %	15920284
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