MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 53990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_003106	TCT	2	6	2639269	2639274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922954
53502	NC_003106	TAAT	2	8	2639290	2639297	50 %	50 %	0 %	0 %	15922954
53503	NC_003106	AGA	2	6	2639484	2639489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922955
53504	NC_003106	ATTA	2	8	2639515	2639522	50 %	50 %	0 %	0 %	15922955
53505	NC_003106	TAG	2	6	2639523	2639528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922955
53506	NC_003106	T	6	6	2639534	2639539	0 %	100 %	0 %	0 %	15922955
53507	NC_003106	TAC	2	6	2639549	2639554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922955
53508	NC_003106	TAG	2	6	2639619	2639624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922955
53509	NC_003106	TAT	2	6	2639693	2639698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922955
53510	NC_003106	TTGC	2	8	2639714	2639721	0 %	50 %	25 %	25 %	15922955
53511	NC_003106	AAC	2	6	2639744	2639749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922955
53512	NC_003106	AATG	2	8	2639815	2639822	50 %	25 %	25 %	0 %	15922955
53513	NC_003106	CTAT	2	8	2639877	2639884	25 %	50 %	0 %	25 %	15922955
53514	NC_003106	TA	3	6	2639953	2639958	50 %	50 %	0 %	0 %	15922955
53515	NC_003106	CAA	2	6	2640006	2640011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922955
53516	NC_003106	TAA	2	6	2640013	2640018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922955
53517	NC_003106	CGG	2	6	2640058	2640063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15922955
53518	NC_003106	AAT	2	6	2640094	2640099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922955
53519	NC_003106	AT	3	6	2640109	2640114	50 %	50 %	0 %	0 %	15922955
53520	NC_003106	ATA	2	6	2640155	2640160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922955
53521	NC_003106	AT	3	6	2640167	2640172	50 %	50 %	0 %	0 %	15922955
53522	NC_003106	TCA	2	6	2640179	2640184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922955
53523	NC_003106	AGG	2	6	2640202	2640207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922955
53524	NC_003106	TTC	2	6	2640209	2640214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922955
53525	NC_003106	ACTA	2	8	2640215	2640222	50 %	25 %	0 %	25 %	15922955
53526	NC_003106	ATT	2	6	2640313	2640318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922955
53527	NC_003106	CTA	2	6	2640442	2640447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922956
53528	NC_003106	TAA	2	6	2640512	2640517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53529	NC_003106	CAG	2	6	2640520	2640525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922956
53530	NC_003106	TATC	2	8	2640550	2640557	25 %	50 %	0 %	25 %	15922956
53531	NC_003106	TCC	2	6	2640605	2640610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15922956
53532	NC_003106	AGA	2	6	2640623	2640628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922956
53533	NC_003106	AGA	2	6	2640647	2640652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922956
53534	NC_003106	TTA	2	6	2640715	2640720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922956
53535	NC_003106	TAA	2	6	2640727	2640732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53536	NC_003106	TAA	2	6	2640789	2640794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53537	NC_003106	ATA	2	6	2640831	2640836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
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53539	NC_003106	TA	3	6	2640854	2640859	50 %	50 %	0 %	0 %	15922956
53540	NC_003106	ATA	3	9	2640911	2640919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53541	NC_003106	TCT	2	6	2640960	2640965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922956
53542	NC_003106	GAA	2	6	2641037	2641042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922956
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53544	NC_003106	TTC	2	6	2641098	2641103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922956
53545	NC_003106	ATAC	2	8	2641189	2641196	50 %	25 %	0 %	25 %	15922956
53546	NC_003106	AGC	2	6	2641244	2641249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922956
53547	NC_003106	GCT	2	6	2641260	2641265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922956
53548	NC_003106	TCC	2	6	2641286	2641291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15922956
53549	NC_003106	CAG	2	6	2641357	2641362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922956
53550	NC_003106	CCA	2	6	2641371	2641376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922956
53551	NC_003106	CTA	2	6	2641387	2641392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922956
53552	NC_003106	CTAA	2	8	2641398	2641405	50 %	25 %	0 %	25 %	15922956
53553	NC_003106	ATA	2	6	2641423	2641428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53554	NC_003106	CCTAAA	2	12	2641479	2641490	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15922956
53555	NC_003106	ATT	2	6	2641497	2641502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922956
53556	NC_003106	CCTA	2	8	2641514	2641521	25 %	25 %	0 %	50 %	15922956
53557	NC_003106	GA	3	6	2641577	2641582	50 %	0 %	50 %	0 %	15922956
53558	NC_003106	TAT	2	6	2641592	2641597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922956
53559	NC_003106	TAA	2	6	2641610	2641615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53560	NC_003106	TAA	2	6	2641631	2641636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922956
53561	NC_003106	TAG	2	6	2641691	2641696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922956
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53563	NC_003106	CTT	2	6	2643543	2643548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922957
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53565	NC_003106	GAAA	2	8	2643617	2643624	75 %	0 %	25 %	0 %	15922957
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53569	NC_003106	ATCA	2	8	2644250	2644257	50 %	25 %	0 %	25 %	15922958
53570	NC_003106	CAA	2	6	2644287	2644292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922958
53571	NC_003106	A	6	6	2644367	2644372	100 %	0 %	0 %	0 %	15922958
53572	NC_003106	CGGAA	2	10	2644509	2644518	40 %	0 %	40 %	20 %	15922958
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53588	NC_003106	ACCA	2	8	2646228	2646235	50 %	0 %	0 %	50 %	15922960
53589	NC_003106	CCA	2	6	2646251	2646256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922960
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53593	NC_003106	ACCTC	2	10	2647148	2647157	20 %	20 %	0 %	60 %	15922961
53594	NC_003106	TAA	2	6	2647167	2647172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922961
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53601	NC_003106	TA	3	6	2647551	2647556	50 %	50 %	0 %	0 %	15922961
53602	NC_003106	TACA	2	8	2647573	2647580	50 %	25 %	0 %	25 %	15922961
53603	NC_003106	CCTT	2	8	2647646	2647653	0 %	50 %	0 %	50 %	15922961
53604	NC_003106	TCA	2	6	2647671	2647676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922961
53605	NC_003106	TCT	3	9	2649066	2649074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922962
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53608	NC_003106	TAT	2	6	2649105	2649110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922962
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