MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25120	NC_003098	T	6	6	1509303	1509308	0 %	100 %	0 %	0 %	15903574
25121	NC_003098	CAA	2	6	1509314	1509319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903574
25122	NC_003098	ATGA	2	8	1509331	1509338	50 %	25 %	25 %	0 %	15903574
25123	NC_003098	TAT	2	6	1509371	1509376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903574
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25125	NC_003098	ATC	2	6	1509456	1509461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903574
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25133	NC_003098	TC	3	6	1509985	1509990	0 %	50 %	0 %	50 %	15903574
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25149	NC_003098	AATCAA	2	12	1510502	1510513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15903575
25150	NC_003098	ATTC	2	8	1510525	1510532	25 %	50 %	0 %	25 %	15903575
25151	NC_003098	ATTT	2	8	1510615	1510622	25 %	75 %	0 %	0 %	15903575
25152	NC_003098	CTT	2	6	1510642	1510647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903575
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25230	NC_003098	TTG	2	6	1515581	1515586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903579
25231	NC_003098	TC	3	6	1515633	1515638	0 %	50 %	0 %	50 %	15903579
25232	NC_003098	TTC	2	6	1515853	1515858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903579
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25235	NC_003098	ACC	2	6	1516100	1516105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903579
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25237	NC_003098	ATC	2	6	1516219	1516224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903579
25238	NC_003098	GAT	2	6	1516231	1516236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903579
25239	NC_003098	ATT	2	6	1516270	1516275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903579
25240	NC_003098	CGT	2	6	1516419	1516424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903579
25241	NC_003098	ATAG	2	8	1516443	1516450	50 %	25 %	25 %	0 %	15903579
25242	NC_003098	TGTT	2	8	1516482	1516489	0 %	75 %	25 %	0 %	15903579
25243	NC_003098	ACA	2	6	1516568	1516573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903579
25244	NC_003098	T	7	7	1516686	1516692	0 %	100 %	0 %	0 %	15903579
25245	NC_003098	CTT	3	9	1516698	1516706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903579
25246	NC_003098	TTCCC	2	10	1516728	1516737	0 %	40 %	0 %	60 %	15903579
25247	NC_003098	ATAG	2	8	1516753	1516760	50 %	25 %	25 %	0 %	15903579
25248	NC_003098	CGAT	2	8	1516821	1516828	25 %	25 %	25 %	25 %	15903579
25249	NC_003098	TGA	2	6	1516911	1516916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903579
25250	NC_003098	T	8	8	1517104	1517111	0 %	100 %	0 %	0 %	15903579
25251	NC_003098	TTG	2	6	1517222	1517227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903579
25252	NC_003098	ATA	2	6	1517310	1517315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903579
25253	NC_003098	CTG	2	6	1517355	1517360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903579
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25255	NC_003098	TAT	2	6	1517481	1517486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903579
25256	NC_003098	T	6	6	1517515	1517520	0 %	100 %	0 %	0 %	15903579
25257	NC_003098	CT	3	6	1517643	1517648	0 %	50 %	0 %	50 %	15903579
25258	NC_003098	TCT	2	6	1517675	1517680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903579
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25264	NC_003098	CTT	2	6	1517886	1517891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903579
25265	NC_003098	CT	3	6	1518014	1518019	0 %	50 %	0 %	50 %	15903579
25266	NC_003098	AAT	2	6	1518351	1518356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903580
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25268	NC_003098	ATCA	2	8	1518432	1518439	50 %	25 %	0 %	25 %	15903580
25269	NC_003098	A	7	7	1518451	1518457	100 %	0 %	0 %	0 %	15903580
25270	NC_003098	AGT	2	6	1518466	1518471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903580
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25275	NC_003098	TCG	2	6	1519723	1519728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903581
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25292	NC_003098	TCT	2	6	1520767	1520772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903582
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25314	NC_003098	CTG	2	6	1521827	1521832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903582
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25339	NC_003098	TTGG	2	8	1523821	1523828	0 %	50 %	50 %	0 %	15903583
25340	NC_003098	TCC	2	6	1523855	1523860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903583
25341	NC_003098	CCT	2	6	1524027	1524032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903584
25342	NC_003098	TTC	2	6	1524169	1524174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903584
25343	NC_003098	TCT	2	6	1524271	1524276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903585
25344	NC_003098	TGGT	2	8	1524339	1524346	0 %	50 %	50 %	0 %	15903585
25345	NC_003098	GAC	2	6	1524350	1524355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903585
25346	NC_003098	AT	3	6	1524460	1524465	50 %	50 %	0 %	0 %	15903585
25347	NC_003098	TGGT	2	8	1524484	1524491	0 %	50 %	50 %	0 %	15903585
25348	NC_003098	TAG	2	6	1524562	1524567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903585
25349	NC_003098	GGA	2	6	1524608	1524613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15903585
25350	NC_003098	AAGG	2	8	1524663	1524670	50 %	0 %	50 %	0 %	15903585
25351	NC_003098	AGC	2	6	1524684	1524689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903585
25352	NC_003098	CCA	2	6	1524833	1524838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903585
25353	NC_003098	CATCT	2	10	1524861	1524870	20 %	40 %	0 %	40 %	15903585
25354	NC_003098	CTGG	2	8	1524962	1524969	0 %	25 %	50 %	25 %	15903585
25355	NC_003098	CTT	2	6	1525053	1525058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903585
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25357	NC_003098	ATA	2	6	1525159	1525164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903585
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25477	NC_003098	GTA	2	6	1531728	1531733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903592
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