MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_003098	ACG	2	6	1169113	1169118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903209
19503	NC_003098	TTG	2	6	1169237	1169242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903209
19504	NC_003098	ATC	2	6	1169255	1169260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903209
19505	NC_003098	TCT	2	6	1169346	1169351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903209
19506	NC_003098	TCAA	2	8	1169399	1169406	50 %	25 %	0 %	25 %	15903209
19507	NC_003098	ACAG	2	8	1169528	1169535	50 %	0 %	25 %	25 %	15903209
19508	NC_003098	AGC	2	6	1169536	1169541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903209
19509	NC_003098	ACC	2	6	1169542	1169547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903209
19510	NC_003098	GCT	2	6	1169624	1169629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903209
19511	NC_003098	CAAG	2	8	1169655	1169662	50 %	0 %	25 %	25 %	15903209
19512	NC_003098	TCAT	2	8	1169702	1169709	25 %	50 %	0 %	25 %	15903209
19513	NC_003098	GAG	2	6	1169710	1169715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15903209
19514	NC_003098	TCA	2	6	1169717	1169722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903209
19515	NC_003098	ATCA	2	8	1169743	1169750	50 %	25 %	0 %	25 %	15903209
19516	NC_003098	TGT	2	6	1169852	1169857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903209
19517	NC_003098	CCG	2	6	1169901	1169906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15903209
19518	NC_003098	TCT	2	6	1169930	1169935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903209
19519	NC_003098	TTG	2	6	1169945	1169950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903209
19520	NC_003098	GTT	2	6	1169969	1169974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903209
19521	NC_003098	ACCA	2	8	1169992	1169999	50 %	0 %	0 %	50 %	15903209
19522	NC_003098	ATG	3	9	1170002	1170010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903209
19523	NC_003098	TCA	2	6	1170074	1170079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903209
19524	NC_003098	TAA	2	6	1170087	1170092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903209
19525	NC_003098	ACA	2	6	1170170	1170175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903209
19526	NC_003098	GGCAA	2	10	1170176	1170185	40 %	0 %	40 %	20 %	15903209
19527	NC_003098	T	6	6	1170256	1170261	0 %	100 %	0 %	0 %	15903209
19528	NC_003098	TAT	2	6	1170335	1170340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903210
19529	NC_003098	GAC	2	6	1170512	1170517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903210
19530	NC_003098	CTC	2	6	1170528	1170533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903210
19531	NC_003098	ATC	2	6	1170555	1170560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903210
19532	NC_003098	GTA	2	6	1170564	1170569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903210
19533	NC_003098	T	6	6	1170644	1170649	0 %	100 %	0 %	0 %	15903210
19534	NC_003098	ATA	2	6	1170862	1170867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903211
19535	NC_003098	ACTATC	2	12	1170906	1170917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903211
19536	NC_003098	TCA	2	6	1170959	1170964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903211
19537	NC_003098	ACT	2	6	1170991	1170996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903211
19538	NC_003098	TTTTCC	2	12	1170997	1171008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903211
19539	NC_003098	CAT	2	6	1171058	1171063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903211
19540	NC_003098	TCA	2	6	1171090	1171095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903211
19541	NC_003098	CTA	2	6	1171155	1171160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903212
19542	NC_003098	AAT	2	6	1171247	1171252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903212
19543	NC_003098	ATC	2	6	1171256	1171261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903212
19544	NC_003098	AAC	2	6	1171308	1171313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903212
19545	NC_003098	TC	3	6	1171359	1171364	0 %	50 %	0 %	50 %	15903212
19546	NC_003098	ACG	2	6	1171390	1171395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903212
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19548	NC_003098	GGAAT	2	10	1171429	1171438	40 %	20 %	40 %	0 %	15903212
19549	NC_003098	TC	3	6	1171448	1171453	0 %	50 %	0 %	50 %	15903212
19550	NC_003098	GCT	2	6	1171466	1171471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903212
19551	NC_003098	ATT	2	6	1171556	1171561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903212
19552	NC_003098	TAA	2	6	1171654	1171659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903212
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19554	NC_003098	TCT	2	6	1171921	1171926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903212
19555	NC_003098	CCT	2	6	1171987	1171992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903212
19556	NC_003098	A	7	7	1172004	1172010	100 %	0 %	0 %	0 %	15903212
19557	NC_003098	TGAC	2	8	1172019	1172026	25 %	25 %	25 %	25 %	15903212
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19559	NC_003098	TGA	2	6	1172049	1172054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903212
19560	NC_003098	ATCGC	2	10	1172107	1172116	20 %	20 %	20 %	40 %	15903212
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19563	NC_003098	A	7	7	1172313	1172319	100 %	0 %	0 %	0 %	15903212
19564	NC_003098	CT	3	6	1172336	1172341	0 %	50 %	0 %	50 %	15903212
19565	NC_003098	GAAA	2	8	1172407	1172414	75 %	0 %	25 %	0 %	15903212
19566	NC_003098	TTGA	2	8	1172465	1172472	25 %	50 %	25 %	0 %	15903212
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19571	NC_003098	CATG	2	8	1172833	1172840	25 %	25 %	25 %	25 %	15903213
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19599	NC_003098	AG	3	6	1174533	1174538	50 %	0 %	50 %	0 %	15903216
19600	NC_003098	CTGG	2	8	1174559	1174566	0 %	25 %	50 %	25 %	15903216
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19603	NC_003098	CTT	2	6	1174769	1174774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903217
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19975	NC_003098	TTG	2	6	1198241	1198246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903245
19976	NC_003098	TAA	2	6	1198272	1198277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903245
19977	NC_003098	TAT	2	6	1198370	1198375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903245
19978	NC_003098	TGA	2	6	1198390	1198395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903245
19979	NC_003098	AT	3	6	1198415	1198420	50 %	50 %	0 %	0 %	15903245
19980	NC_003098	TA	4	8	1198483	1198490	50 %	50 %	0 %	0 %	15903246
19981	NC_003098	ATG	2	6	1198520	1198525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903246
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19983	NC_003098	TAT	2	6	1198630	1198635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903246
19984	NC_003098	T	6	6	1198663	1198668	0 %	100 %	0 %	0 %	15903246
19985	NC_003098	TAC	2	6	1198690	1198695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903246
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19989	NC_003098	T	6	6	1198758	1198763	0 %	100 %	0 %	0 %	15903246
19990	NC_003098	ATC	2	6	1198781	1198786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903246
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19993	NC_003098	ATTA	2	8	1198937	1198944	50 %	50 %	0 %	0 %	15903246
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19998	NC_003098	TGA	2	6	1199084	1199089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903246
19999	NC_003098	TTA	2	6	1199103	1199108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903246
20000	NC_003098	TTC	2	6	1199130	1199135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903246

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