MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_003098	CTT	2	6	1108680	1108685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903151
18503	NC_003098	T	7	7	1108751	1108757	0 %	100 %	0 %	0 %	15903151
18504	NC_003098	TTC	2	6	1108897	1108902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903151
18505	NC_003098	CAT	2	6	1108996	1109001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903151
18506	NC_003098	CTG	2	6	1109133	1109138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903151
18507	NC_003098	CCA	2	6	1109195	1109200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903151
18508	NC_003098	AGTC	2	8	1109202	1109209	25 %	25 %	25 %	25 %	15903151
18509	NC_003098	CTG	2	6	1109215	1109220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903151
18510	NC_003098	AAT	2	6	1109250	1109255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15903151
18511	NC_003098	CTC	2	6	1109287	1109292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903151
18512	NC_003098	GTA	2	6	1109344	1109349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903151
18513	NC_003098	CTG	2	6	1109374	1109379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903151
18514	NC_003098	TCC	2	6	1109424	1109429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903151
18515	NC_003098	TCA	2	6	1109450	1109455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903151
18516	NC_003098	GAAA	2	8	1109479	1109486	75 %	0 %	25 %	0 %	15903151
18517	NC_003098	TCC	2	6	1109495	1109500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903151
18518	NC_003098	GCT	2	6	1109916	1109921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903152
18519	NC_003098	TCT	2	6	1110142	1110147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903152
18520	NC_003098	T	6	6	1110187	1110192	0 %	100 %	0 %	0 %	15903152
18521	NC_003098	AAC	2	6	1110266	1110271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903152
18522	NC_003098	CTG	2	6	1110415	1110420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903152
18523	NC_003098	TCAG	2	8	1110498	1110505	25 %	25 %	25 %	25 %	15903152
18524	NC_003098	CAC	2	6	1110520	1110525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903152
18525	NC_003098	AAC	2	6	1110560	1110565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903152
18526	NC_003098	TGT	2	6	1110677	1110682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903152
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18529	NC_003098	ACC	2	6	1110989	1110994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903152
18530	NC_003098	ACG	2	6	1111058	1111063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903152
18531	NC_003098	TCAA	2	8	1111104	1111111	50 %	25 %	0 %	25 %	15903152
18532	NC_003098	TTG	2	6	1111125	1111130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903152
18533	NC_003098	GCAT	2	8	1111143	1111150	25 %	25 %	25 %	25 %	15903152
18534	NC_003098	CAC	2	6	1111204	1111209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903152
18535	NC_003098	CAG	2	6	1111210	1111215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903152
18536	NC_003098	CAC	2	6	1111216	1111221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15903152
18537	NC_003098	TCG	2	6	1111452	1111457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903152
18538	NC_003098	ACA	2	6	1111479	1111484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903152
18539	NC_003098	CAA	2	6	1111486	1111491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15903152
18540	NC_003098	TTCA	2	8	1111533	1111540	25 %	50 %	0 %	25 %	15903152
18541	NC_003098	GTTT	2	8	1111893	1111900	0 %	75 %	25 %	0 %	15903153
18542	NC_003098	CCTAA	2	10	1111938	1111947	40 %	20 %	0 %	40 %	15903153
18543	NC_003098	TACCAA	2	12	1111961	1111972	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15903153
18544	NC_003098	AAGC	2	8	1112111	1112118	50 %	0 %	25 %	25 %	15903153
18545	NC_003098	ATC	2	6	1112122	1112127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903153
18546	NC_003098	TTC	2	6	1112138	1112143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15903153
18547	NC_003098	TGA	2	6	1112147	1112152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15903153
18548	NC_003098	GGAAT	2	10	1112204	1112213	40 %	20 %	40 %	0 %	15903153
18549	NC_003098	CTG	2	6	1112241	1112246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903153
18550	NC_003098	ATC	2	6	1112263	1112268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903153
18551	NC_003098	ATC	2	6	1112316	1112321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903153
18552	NC_003098	CAG	2	6	1112344	1112349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15903153
18553	NC_003098	TTG	2	6	1112368	1112373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903153
18554	NC_003098	AGA	2	6	1112405	1112410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15903153
18555	NC_003098	CTC	2	6	1112421	1112426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15903153
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18557	NC_003098	A	7	7	1112539	1112545	100 %	0 %	0 %	0 %	15903154
18558	NC_003098	GCT	2	6	1112579	1112584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15903154
18559	NC_003098	A	7	7	1112692	1112698	100 %	0 %	0 %	0 %	15903154
18560	NC_003098	ATTT	2	8	1112703	1112710	25 %	75 %	0 %	0 %	15903154
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18563	NC_003098	CTA	2	6	1112924	1112929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15903154
18564	NC_003098	GAG	2	6	1112949	1112954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15903154
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18567	NC_003098	A	6	6	1113006	1113011	100 %	0 %	0 %	0 %	15903154
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18572	NC_003098	ACGATT	2	12	1113216	1113227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15903155
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18574	NC_003098	CTTA	2	8	1113325	1113332	25 %	50 %	0 %	25 %	15903155
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18583	NC_003098	AT	3	6	1114098	1114103	50 %	50 %	0 %	0 %	15903156
18584	NC_003098	TTTTG	2	10	1114183	1114192	0 %	80 %	20 %	0 %	15903156
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18602	NC_003098	ACCAG	2	10	1115256	1115265	40 %	0 %	20 %	40 %	15903158
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18604	NC_003098	CAGA	2	8	1115325	1115332	50 %	0 %	25 %	25 %	15903158
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18608	NC_003098	T	6	6	1115526	1115531	0 %	100 %	0 %	0 %	15903159
18609	NC_003098	GC	3	6	1115546	1115551	0 %	0 %	50 %	50 %	15903159
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18615	NC_003098	CCAT	2	8	1115741	1115748	25 %	25 %	0 %	50 %	15903159
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18975	NC_003098	ATT	2	6	1135469	1135474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15903173
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18978	NC_003098	TTG	2	6	1135632	1135637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15903173
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