MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_003098	TGA	2	6	875768	875773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902928
14503	NC_003098	A	6	6	875773	875778	100 %	0 %	0 %	0 %	15902928
14504	NC_003098	TGG	2	6	875789	875794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902928
14505	NC_003098	A	6	6	875841	875846	100 %	0 %	0 %	0 %	15902928
14506	NC_003098	CGCTTT	2	12	875849	875860	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15902928
14507	NC_003098	CA	3	6	875900	875905	50 %	0 %	0 %	50 %	15902928
14508	NC_003098	ATC	2	6	875957	875962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902928
14509	NC_003098	TGA	2	6	875969	875974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902928
14510	NC_003098	AGC	2	6	876062	876067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902928
14511	NC_003098	AT	3	6	876113	876118	50 %	50 %	0 %	0 %	15902928
14512	NC_003098	GGT	2	6	876120	876125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902928
14513	NC_003098	TCAAGC	2	12	876132	876143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15902928
14514	NC_003098	AGT	2	6	876144	876149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902928
14515	NC_003098	TGAT	2	8	877386	877393	25 %	50 %	25 %	0 %	15902931
14516	NC_003098	AAG	2	6	877394	877399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902931
14517	NC_003098	GAA	2	6	877487	877492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902931
14518	NC_003098	TTG	2	6	877689	877694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902931
14519	NC_003098	CAG	2	6	877814	877819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902931
14520	NC_003098	GAA	2	6	877916	877921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902931
14521	NC_003098	GAG	2	6	877922	877927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902931
14522	NC_003098	CTT	2	6	877955	877960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902931
14523	NC_003098	TCC	2	6	878013	878018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902932
14524	NC_003098	CGA	2	6	878068	878073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902932
14525	NC_003098	ATT	2	6	878180	878185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902932
14526	NC_003098	GTT	2	6	878205	878210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902932
14527	NC_003098	T	6	6	878209	878214	0 %	100 %	0 %	0 %	15902932
14528	NC_003098	T	6	6	878243	878248	0 %	100 %	0 %	0 %	15902932
14529	NC_003098	CGGTC	2	10	878315	878324	0 %	20 %	40 %	40 %	15902932
14530	NC_003098	TGA	2	6	878415	878420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902932
14531	NC_003098	GCT	2	6	878427	878432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902932
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14533	NC_003098	T	7	7	878458	878464	0 %	100 %	0 %	0 %	15902932
14534	NC_003098	T	7	7	878474	878480	0 %	100 %	0 %	0 %	15902932
14535	NC_003098	ATT	2	6	878484	878489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902932
14536	NC_003098	TCC	2	6	878498	878503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902933
14537	NC_003098	AGA	2	6	878544	878549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902933
14538	NC_003098	GAT	2	6	878554	878559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902933
14539	NC_003098	GAT	2	6	878656	878661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902933
14540	NC_003098	GTT	2	6	878686	878691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902933
14541	NC_003098	A	6	6	878715	878720	100 %	0 %	0 %	0 %	15902933
14542	NC_003098	TGCACC	2	12	878731	878742	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15902933
14543	NC_003098	AAG	2	6	878756	878761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902933
14544	NC_003098	AAGT	2	8	878824	878831	50 %	25 %	25 %	0 %	15902933
14545	NC_003098	AATC	2	8	878985	878992	50 %	25 %	0 %	25 %	15902933
14546	NC_003098	GAG	2	6	879025	879030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902933
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14548	NC_003098	ATA	2	6	879069	879074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902933
14549	NC_003098	TGC	2	6	879238	879243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902933
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14551	NC_003098	AT	3	6	879326	879331	50 %	50 %	0 %	0 %	15902933
14552	NC_003098	A	7	7	879432	879438	100 %	0 %	0 %	0 %	15902934
14553	NC_003098	TCT	2	6	879453	879458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902934
14554	NC_003098	T	6	6	879462	879467	0 %	100 %	0 %	0 %	15902934
14555	NC_003098	GA	3	6	879472	879477	50 %	0 %	50 %	0 %	15902934
14556	NC_003098	TTC	2	6	879644	879649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902934
14557	NC_003098	GCA	2	6	879795	879800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902934
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14560	NC_003098	GCCA	2	8	880042	880049	25 %	0 %	25 %	50 %	15902934
14561	NC_003098	AAT	2	6	880058	880063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902934
14562	NC_003098	TGA	2	6	880153	880158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902934
14563	NC_003098	CAT	2	6	880169	880174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902934
14564	NC_003098	A	7	7	880181	880187	100 %	0 %	0 %	0 %	15902934
14565	NC_003098	TAAA	2	8	880189	880196	75 %	25 %	0 %	0 %	15902934
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14572	NC_003098	ATG	2	6	880612	880617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902935
14573	NC_003098	AC	3	6	880647	880652	50 %	0 %	0 %	50 %	15902935
14574	NC_003098	TTGA	2	8	880705	880712	25 %	50 %	25 %	0 %	15902935
14575	NC_003098	ATCA	2	8	880720	880727	50 %	25 %	0 %	25 %	15902935
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14588	NC_003098	TGCTAT	2	12	881664	881675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15902935
14589	NC_003098	GTC	2	6	881684	881689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902935
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14593	NC_003098	GATTT	2	10	881866	881875	20 %	60 %	20 %	0 %	15902936
14594	NC_003098	CTGT	2	8	881888	881895	0 %	50 %	25 %	25 %	15902936
14595	NC_003098	GAA	2	6	882043	882048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902936
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14602	NC_003098	TCC	2	6	882377	882382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902937
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14605	NC_003098	CGT	2	6	882516	882521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902937
14606	NC_003098	TGAAA	2	10	882639	882648	60 %	20 %	20 %	0 %	15902938
14607	NC_003098	ATT	2	6	882655	882660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902938
14608	NC_003098	GCT	2	6	882661	882666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902938
14609	NC_003098	AGA	2	6	882672	882677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902938
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14611	NC_003098	GTT	2	6	882721	882726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902938
14612	NC_003098	TTA	2	6	882854	882859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902938
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14614	NC_003098	TTG	2	6	883016	883021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902938
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14616	NC_003098	TTG	2	6	883094	883099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902938
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14619	NC_003098	TAT	2	6	883272	883277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902938
14620	NC_003098	TTG	2	6	883306	883311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902938
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14992	NC_003098	TTAT	2	8	905273	905280	25 %	75 %	0 %	0 %	15902962
14993	NC_003098	GAT	2	6	905329	905334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902962
14994	NC_003098	GAA	2	6	905345	905350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902962
14995	NC_003098	CAG	2	6	905397	905402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902962
14996	NC_003098	GAA	2	6	905441	905446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902962
14997	NC_003098	CT	3	6	905481	905486	0 %	50 %	0 %	50 %	15902962
14998	NC_003098	CAG	2	6	905490	905495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902962
14999	NC_003098	GTA	3	9	905546	905554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902962
15000	NC_003098	ATA	2	6	905556	905561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902962

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