MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_003098	TGG	2	6	599793	599798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902627
10003	NC_003098	TTA	2	6	599802	599807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902627
10004	NC_003098	GGAA	2	8	599828	599835	50 %	0 %	50 %	0 %	15902627
10005	NC_003098	CAAG	2	8	599839	599846	50 %	0 %	25 %	25 %	15902627
10006	NC_003098	CTT	2	6	599852	599857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902627
10007	NC_003098	CTG	2	6	599885	599890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902627
10008	NC_003098	A	7	7	599934	599940	100 %	0 %	0 %	0 %	15902627
10009	NC_003098	GTAT	2	8	599942	599949	25 %	50 %	25 %	0 %	15902627
10010	NC_003098	ATG	2	6	599984	599989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902627
10011	NC_003098	GAT	2	6	600015	600020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902627
10012	NC_003098	ATG	2	6	600148	600153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902628
10013	NC_003098	ATT	2	6	600163	600168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902628
10014	NC_003098	TGG	2	6	600180	600185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902628
10015	NC_003098	AAC	2	6	600210	600215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902628
10016	NC_003098	TCAA	2	8	600241	600248	50 %	25 %	0 %	25 %	15902628
10017	NC_003098	TGA	2	6	600282	600287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902628
10018	NC_003098	CTTG	2	8	600318	600325	0 %	50 %	25 %	25 %	15902628
10019	NC_003098	GCA	2	6	600331	600336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902628
10020	NC_003098	CAAA	2	8	600441	600448	75 %	0 %	0 %	25 %	15902628
10021	NC_003098	ATG	2	6	600488	600493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902628
10022	NC_003098	AGC	2	6	600501	600506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902628
10023	NC_003098	AACC	2	8	600538	600545	50 %	0 %	0 %	50 %	15902628
10024	NC_003098	TGG	2	6	600579	600584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902628
10025	NC_003098	TCG	2	6	600590	600595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902628
10026	NC_003098	GCA	2	6	600628	600633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902628
10027	NC_003098	A	6	6	600691	600696	100 %	0 %	0 %	0 %	15902628
10028	NC_003098	TCG	2	6	600744	600749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902628
10029	NC_003098	TTGA	2	8	600790	600797	25 %	50 %	25 %	0 %	15902628
10030	NC_003098	GAA	2	6	600805	600810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902628
10031	NC_003098	GAC	2	6	600850	600855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902628
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10034	NC_003098	GT	3	6	600956	600961	0 %	50 %	50 %	0 %	15902628
10035	NC_003098	CTA	2	6	601037	601042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902628
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10037	NC_003098	AAGG	2	8	601255	601262	50 %	0 %	50 %	0 %	15902629
10038	NC_003098	AAG	2	6	601412	601417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902629
10039	NC_003098	ACT	2	6	601481	601486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902629
10040	NC_003098	GTT	2	6	601540	601545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902629
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10044	NC_003098	GCT	2	6	601656	601661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902629
10045	NC_003098	ATCT	2	8	601711	601718	25 %	50 %	0 %	25 %	15902629
10046	NC_003098	TGG	2	6	601754	601759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902629
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10053	NC_003098	CGA	2	6	602110	602115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902630
10054	NC_003098	GCT	2	6	602116	602121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902630
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10061	NC_003098	A	6	6	602378	602383	100 %	0 %	0 %	0 %	15902632
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10075	NC_003098	TCG	3	9	602843	602851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902632
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10091	NC_003098	CAGG	2	8	603700	603707	25 %	0 %	50 %	25 %	15902633
10092	NC_003098	CGT	2	6	603754	603759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902633
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10099	NC_003098	TC	3	6	604158	604163	0 %	50 %	0 %	50 %	15902633
10100	NC_003098	CAT	2	6	604164	604169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902633
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10104	NC_003098	AG	3	6	604392	604397	50 %	0 %	50 %	0 %	15902633
10105	NC_003098	GAA	2	6	604411	604416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902633
10106	NC_003098	AAAT	2	8	604467	604474	75 %	25 %	0 %	0 %	15902633
10107	NC_003098	AGA	2	6	604482	604487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902633
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10109	NC_003098	GTT	2	6	604622	604627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902634
10110	NC_003098	ATT	2	6	604680	604685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902634
10111	NC_003098	TCAG	2	8	604695	604702	25 %	25 %	25 %	25 %	15902634
10112	NC_003098	TCTG	2	8	604768	604775	0 %	50 %	25 %	25 %	15902634
10113	NC_003098	GAG	2	6	604835	604840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902634
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10117	NC_003098	TA	3	6	605103	605108	50 %	50 %	0 %	0 %	15902634
10118	NC_003098	ATTA	2	8	605112	605119	50 %	50 %	0 %	0 %	15902634
10119	NC_003098	TTA	2	6	605309	605314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902635
10120	NC_003098	CAGA	2	8	605389	605396	50 %	0 %	25 %	25 %	15902635
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10122	NC_003098	CATT	2	8	605478	605485	25 %	50 %	0 %	25 %	15902635
10123	NC_003098	GCT	2	6	605638	605643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902635
10124	NC_003098	GCA	2	6	605722	605727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902635
10125	NC_003098	TGA	2	6	605856	605861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902635
10126	NC_003098	A	6	6	605861	605866	100 %	0 %	0 %	0 %	15902635
10127	NC_003098	CCT	2	6	605937	605942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902635
10128	NC_003098	AAGA	2	8	605992	605999	75 %	0 %	25 %	0 %	15902635
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10156	NC_003098	CATTT	2	10	607670	607679	20 %	60 %	0 %	20 %	15902637
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10229	NC_003098	A	6	6	612223	612228	100 %	0 %	0 %	0 %	15902644
10230	NC_003098	A	6	6	612242	612247	100 %	0 %	0 %	0 %	15902644
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10238	NC_003098	GATGG	2	10	612423	612432	20 %	20 %	60 %	0 %	15902644
10239	NC_003098	CTG	2	6	612456	612461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902644
10240	NC_003098	CCT	2	6	612468	612473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902644
10241	NC_003098	ACTATG	2	12	612516	612527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15902644
10242	NC_003098	CTA	2	6	612598	612603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902645
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