MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 1021 chromosome

Total Repeats: 75160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003047	ACT	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963754
2	NC_003047	CGC	2	6	543	548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963754
3	NC_003047	GCT	2	6	559	564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963754
4	NC_003047	TCC	2	6	577	582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15963754
5	NC_003047	AGC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
6	NC_003047	TCG	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963754
7	NC_003047	CGC	3	9	802	810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963754
8	NC_003047	GCA	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
9	NC_003047	GAC	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
10	NC_003047	CGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
11	NC_003047	ATCT	2	8	967	974	25 %	50 %	0 %	25 %	15963754
12	NC_003047	CGA	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
13	NC_003047	TCG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963754
14	NC_003047	CCG	2	6	1082	1087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963754
15	NC_003047	TC	3	6	1092	1097	0 %	50 %	0 %	50 %	15963754
16	NC_003047	ACG	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
17	NC_003047	GCG	2	6	1165	1170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963754
18	NC_003047	GAG	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15963754
19	NC_003047	CGCT	2	8	1195	1202	0 %	25 %	25 %	50 %	15963754
20	NC_003047	GC	4	8	1205	1212	0 %	0 %	50 %	50 %	15963754
21	NC_003047	AAC	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15963754
22	NC_003047	GCA	2	6	1264	1269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963754
23	NC_003047	TAGA	2	8	1293	1300	50 %	25 %	25 %	0 %	15963754
24	NC_003047	TCG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963755
25	NC_003047	GCC	2	6	1431	1436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963755
26	NC_003047	CGA	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963755
27	NC_003047	AGC	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963755
28	NC_003047	CGCTGG	2	12	1501	1512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15963755
29	NC_003047	GCC	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963755
30	NC_003047	ACG	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963755
31	NC_003047	GGC	2	6	1714	1719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963755
32	NC_003047	ATCG	2	8	1767	1774	25 %	25 %	25 %	25 %	15963755
33	NC_003047	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15963755
34	NC_003047	TGC	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963755
35	NC_003047	TC	3	6	1907	1912	0 %	50 %	0 %	50 %	15963755
36	NC_003047	CGAT	2	8	1933	1940	25 %	25 %	25 %	25 %	15963755
37	NC_003047	CGC	2	6	2009	2014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963756
38	NC_003047	TCAT	2	8	2015	2022	25 %	50 %	0 %	25 %	15963756
39	NC_003047	AAGG	2	8	2113	2120	50 %	0 %	50 %	0 %	15963756
40	NC_003047	GCG	2	6	2135	2140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963756
41	NC_003047	AGG	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15963756
42	NC_003047	CG	3	6	2254	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	15963756
43	NC_003047	TCG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963756
44	NC_003047	GC	3	6	2301	2306	0 %	0 %	50 %	50 %	15963756
45	NC_003047	CGG	2	6	2349	2354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963756
46	NC_003047	CGG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963756
47	NC_003047	GCAC	2	8	2469	2476	25 %	0 %	25 %	50 %	15963756
48	NC_003047	GGC	2	6	2484	2489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963756
49	NC_003047	ACG	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963756
50	NC_003047	GCCGGC	2	12	2556	2567	0 %	0 %	50 %	50 %	15963756
51	NC_003047	CGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963756
52	NC_003047	CGC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963756
53	NC_003047	TCG	2	6	2672	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963756
54	NC_003047	GTC	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963756
55	NC_003047	ATC	3	9	2767	2775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963756
56	NC_003047	ATC	2	6	2799	2804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963756
57	NC_003047	CTG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963757
58	NC_003047	CGA	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963757
59	NC_003047	GTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15963757
60	NC_003047	GCG	2	6	2914	2919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963757
61	NC_003047	TTG	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15963757
62	NC_003047	GC	3	6	3056	3061	0 %	0 %	50 %	50 %	15963757
63	NC_003047	TGC	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963757
64	NC_003047	CTC	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15963757
65	NC_003047	GC	3	6	3153	3158	0 %	0 %	50 %	50 %	15963757
66	NC_003047	TCG	3	9	3169	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963757
67	NC_003047	CCG	2	6	3232	3237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963757
68	NC_003047	GAT	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963757
69	NC_003047	GC	3	6	3284	3289	0 %	0 %	50 %	50 %	15963757
70	NC_003047	TCG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963757
71	NC_003047	GCA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963757
72	NC_003047	TCG	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963757
73	NC_003047	GTTA	2	8	3376	3383	25 %	50 %	25 %	0 %	15963757
74	NC_003047	ATC	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963758
75	NC_003047	CGG	2	6	3642	3647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963758
76	NC_003047	CGA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963758
77	NC_003047	GCC	2	6	3774	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963758
78	NC_003047	TCG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963758
79	NC_003047	TTC	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15963758
80	NC_003047	TCA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963758
81	NC_003047	GCC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963758
82	NC_003047	CGC	2	6	3940	3945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963758
83	NC_003047	GCT	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963758
84	NC_003047	GAT	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963758
85	NC_003047	CGG	2	6	4074	4079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963758
86	NC_003047	GTG	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15963758
87	NC_003047	GAC	2	6	4138	4143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963758
88	NC_003047	GTC	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963758
89	NC_003047	CGC	2	6	4206	4211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963758
90	NC_003047	GCG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963758
91	NC_003047	TCG	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963758
92	NC_003047	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	15963759
93	NC_003047	GATC	2	8	4497	4504	25 %	25 %	25 %	25 %	15963759
94	NC_003047	GCG	2	6	4509	4514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963759
95	NC_003047	GCC	2	6	4519	4524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963759
96	NC_003047	GC	3	6	4552	4557	0 %	0 %	50 %	50 %	15963759
97	NC_003047	AGG	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15963759
98	NC_003047	AGC	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963759
99	NC_003047	GCA	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963759
100	NC_003047	CGC	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963759
101	NC_003047	CATTGA	3	18	4743	4760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15963759
102	NC_003047	CTG	3	9	4867	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963759
103	NC_003047	TGCCGT	2	12	4881	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963759
104	NC_003047	GTC	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963759
105	NC_003047	CGG	3	9	5100	5108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963760
106	NC_003047	GTC	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963760
107	NC_003047	TCG	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963760
108	NC_003047	GATC	2	8	5153	5160	25 %	25 %	25 %	25 %	15963760
109	NC_003047	GCT	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963760
110	NC_003047	GGA	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15963760
111	NC_003047	GCT	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963760
112	NC_003047	GGC	2	6	5328	5333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963760
113	NC_003047	GC	3	6	5338	5343	0 %	0 %	50 %	50 %	15963760
114	NC_003047	CGA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963760
115	NC_003047	TGA	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963760
116	NC_003047	GCG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963760
117	NC_003047	CCG	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963760
118	NC_003047	CGC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963760
119	NC_003047	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963760
120	NC_003047	GAA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15963760
121	NC_003047	CGA	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963760
122	NC_003047	TCA	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963761
123	NC_003047	T	8	8	5816	5823	0 %	100 %	0 %	0 %	15963761
124	NC_003047	AGCG	2	8	5885	5892	25 %	0 %	50 %	25 %	15963761
125	NC_003047	CCT	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15963761
126	NC_003047	CGG	2	6	5985	5990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963761
127	NC_003047	TCG	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963761
128	NC_003047	GAT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963761
129	NC_003047	GGT	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15963761
130	NC_003047	TCG	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963761
131	NC_003047	ATC	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15963761
132	NC_003047	GC	3	6	6431	6436	0 %	0 %	50 %	50 %	15963761
133	NC_003047	GAC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963762
134	NC_003047	TCGCT	2	10	6584	6593	0 %	40 %	20 %	40 %	15963762
135	NC_003047	GCTC	2	8	6641	6648	0 %	25 %	25 %	50 %	15963762
136	NC_003047	TCGG	2	8	6655	6662	0 %	25 %	50 %	25 %	15963762
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259	NC_003047	GC	3	6	11697	11702	0 %	0 %	50 %	50 %	15963766
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267	NC_003047	GCG	2	6	12188	12193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963767
268	NC_003047	CGG	2	6	12213	12218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963767
269	NC_003047	TGC	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963767
270	NC_003047	TGA	2	6	12240	12245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963767
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272	NC_003047	GCG	2	6	12364	12369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963767
273	NC_003047	TGA	2	6	12420	12425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15963767
274	NC_003047	AGC	2	6	12426	12431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963767
275	NC_003047	CGT	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963767
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397	NC_003047	CGGCG	2	10	17594	17603	0 %	0 %	60 %	40 %	15963771
398	NC_003047	CGC	3	9	17615	17623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963771
399	NC_003047	CGG	2	6	17624	17629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963771
400	NC_003047	CTG	2	6	17676	17681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15963771
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402	NC_003047	CTCG	2	8	17768	17775	0 %	25 %	25 %	50 %	15963771
403	NC_003047	AAT	2	6	17778	17783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15963771
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405	NC_003047	GAC	2	6	17813	17818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963771
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430	NC_003047	GC	3	6	19087	19092	0 %	0 %	50 %	50 %	15963772
431	NC_003047	GCC	2	6	19142	19147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15963772
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444	NC_003047	CGA	2	6	20061	20066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963773
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482	NC_003047	CG	3	6	21693	21698	0 %	0 %	50 %	50 %	15963774
483	NC_003047	CG	3	6	21713	21718	0 %	0 %	50 %	50 %	15963774
484	NC_003047	AGG	2	6	21720	21725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15963774
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487	NC_003047	CGG	2	6	21802	21807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15963774
488	NC_003047	CAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15963774
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499	NC_003047	CGGC	2	8	22344	22351	0 %	0 %	50 %	50 %	15963775
500	NC_003047	TCGG	2	8	22361	22368	0 %	25 %	50 %	25 %	15963775

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