MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA

Total Repeats: 24353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003037	GCTG	2	8	1403	1410	0 %	25 %	50 %	25 %	16262454
2	NC_003037	TGAGGC	2	12	1454	1465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16262454
3	NC_003037	GTC	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
4	NC_003037	GAC	3	9	1499	1507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
5	NC_003037	TCA	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262454
6	NC_003037	CAT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262454
7	NC_003037	ATC	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262454
8	NC_003037	GCG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262454
9	NC_003037	GGA	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262454
10	NC_003037	TGA	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262454
11	NC_003037	GAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
12	NC_003037	CGC	2	6	1871	1876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262454
13	NC_003037	ACC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16262454
14	NC_003037	GC	3	6	1956	1961	0 %	0 %	50 %	50 %	16262454
15	NC_003037	GTC	2	6	2058	2063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
16	NC_003037	GGC	2	6	2067	2072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262454
17	NC_003037	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262454
18	NC_003037	CGACAA	2	12	2255	2266	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16262454
19	NC_003037	CCT	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16262454
20	NC_003037	ACG	2	6	2356	2361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
21	NC_003037	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
22	NC_003037	TCG	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
23	NC_003037	TGAC	2	8	2425	2432	25 %	25 %	25 %	25 %	16262454
24	NC_003037	CTG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
25	NC_003037	TGG	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262454
26	NC_003037	GAT	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262454
27	NC_003037	GCCATG	2	12	2649	2660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16262454
28	NC_003037	GCG	3	9	2692	2700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262454
29	NC_003037	GACT	2	8	2737	2744	25 %	25 %	25 %	25 %	16262454
30	NC_003037	G	6	6	2917	2922	0 %	0 %	100 %	0 %	16262454
31	NC_003037	GCC	2	6	2925	2930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262454
32	NC_003037	ATG	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262454
33	NC_003037	CTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16262454
34	NC_003037	CATC	2	8	3196	3203	25 %	25 %	0 %	50 %	16262454
35	NC_003037	GGA	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262454
36	NC_003037	C	6	6	3306	3311	0 %	0 %	0 %	100 %	16262454
37	NC_003037	AAGCA	2	10	3316	3325	60 %	0 %	20 %	20 %	16262454
38	NC_003037	TCG	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
39	NC_003037	CGATC	2	10	3398	3407	20 %	20 %	20 %	40 %	16262454
40	NC_003037	CGAA	2	8	3436	3443	50 %	0 %	25 %	25 %	16262454
41	NC_003037	GGA	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262454
42	NC_003037	CGGC	2	8	3532	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	16262454
43	NC_003037	GAC	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
44	NC_003037	TG	3	6	3586	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	16262454
45	NC_003037	CAA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16262454
46	NC_003037	CGC	2	6	3642	3647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262454
47	NC_003037	GAC	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262454
48	NC_003037	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262454
49	NC_003037	GCT	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
50	NC_003037	GGGC	2	8	3802	3809	0 %	0 %	75 %	25 %	16262454
51	NC_003037	TCA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262454
52	NC_003037	AGG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262454
53	NC_003037	GACG	2	8	4013	4020	25 %	0 %	50 %	25 %	16262454
54	NC_003037	ACT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262454
55	NC_003037	TTC	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16262454
56	NC_003037	GAA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16262454
57	NC_003037	CGG	2	6	4187	4192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262454
58	NC_003037	AAGGCG	2	12	4227	4238	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16262454
59	NC_003037	GTG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262454
60	NC_003037	TGG	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262454
61	NC_003037	TCG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262454
62	NC_003037	GAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262454
63	NC_003037	ATG	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262454
64	NC_003037	CCG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
65	NC_003037	CCG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
66	NC_003037	CGC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
67	NC_003037	ACC	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16262455
68	NC_003037	GCC	3	9	4558	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
69	NC_003037	TGCG	2	8	4639	4646	0 %	25 %	50 %	25 %	16262455
70	NC_003037	CTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262455
71	NC_003037	TGCA	2	8	4802	4809	25 %	25 %	25 %	25 %	16262455
72	NC_003037	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262455
73	NC_003037	GAA	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16262455
74	NC_003037	CCG	2	6	5150	5155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
75	NC_003037	GGC	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262455
76	NC_003037	ATGT	2	8	5177	5184	25 %	50 %	25 %	0 %	16262455
77	NC_003037	CCG	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
78	NC_003037	CGC	2	6	5290	5295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
79	NC_003037	GCC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262455
80	NC_003037	AG	3	6	5371	5376	50 %	0 %	50 %	0 %	16262455
81	NC_003037	TCG	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262455
82	NC_003037	GGA	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262455
83	NC_003037	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262455
84	NC_003037	CCAT	2	8	5458	5465	25 %	25 %	0 %	50 %	16262456
85	NC_003037	CCG	2	6	5472	5477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262456
86	NC_003037	CTG	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262456
87	NC_003037	G	6	6	5610	5615	0 %	0 %	100 %	0 %	16262456
88	NC_003037	TGC	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262456
89	NC_003037	GTG	2	6	5649	5654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262456
90	NC_003037	TTC	2	6	5658	5663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16262456
91	NC_003037	TCT	2	6	5677	5682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16262456
92	NC_003037	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262456
93	NC_003037	TCT	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16262456
94	NC_003037	TCG	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262456
95	NC_003037	TCA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262456
96	NC_003037	TCGA	2	8	5895	5902	25 %	25 %	25 %	25 %	16262456
97	NC_003037	GGC	2	6	5936	5941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262456
98	NC_003037	ATC	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16262456
99	NC_003037	CG	3	6	6006	6011	0 %	0 %	50 %	50 %	16262456
100	NC_003037	CTGG	2	8	6075	6082	0 %	25 %	50 %	25 %	16262456
101	NC_003037	GATC	2	8	6092	6099	25 %	25 %	25 %	25 %	16262456
102	NC_003037	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262457
103	NC_003037	GCC	3	9	6352	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262457
104	NC_003037	GCGTGC	2	12	6388	6399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16262457
105	NC_003037	ATGCC	2	10	6402	6411	20 %	20 %	20 %	40 %	16262457
106	NC_003037	C	6	6	6410	6415	0 %	0 %	0 %	100 %	16262457
107	NC_003037	ATCG	2	8	6416	6423	25 %	25 %	25 %	25 %	16262457
108	NC_003037	G	7	7	6433	6439	0 %	0 %	100 %	0 %	16262457
109	NC_003037	GCA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262457
110	NC_003037	T	6	6	6470	6475	0 %	100 %	0 %	0 %	16262457
111	NC_003037	GCC	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262457
112	NC_003037	CGG	2	6	6537	6542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262457
113	NC_003037	GAT	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262457
114	NC_003037	GAC	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262457
115	NC_003037	CAC	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16262457
116	NC_003037	TGC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262457
117	NC_003037	GGC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262457
118	NC_003037	GC	3	6	6650	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	16262457
119	NC_003037	GCA	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262457
120	NC_003037	GCG	2	6	6717	6722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262457
121	NC_003037	GC	4	8	6768	6775	0 %	0 %	50 %	50 %	16262457
122	NC_003037	CTG	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262457
123	NC_003037	CGT	2	6	6970	6975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262457
124	NC_003037	GAT	2	6	6980	6985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262457
125	NC_003037	TGA	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262457
126	NC_003037	GCGG	2	8	7033	7040	0 %	0 %	75 %	25 %	16262457
127	NC_003037	CGG	2	6	7129	7134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262458
128	NC_003037	CGC	2	6	7141	7146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262458
129	NC_003037	AGC	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262458
130	NC_003037	GTG	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262458
131	NC_003037	TTG	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16262458
132	NC_003037	CTG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262458
133	NC_003037	GCT	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262458
134	NC_003037	AGG	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262458
135	NC_003037	GCC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262458
136	NC_003037	GCG	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262458
137	NC_003037	CTG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262458
138	NC_003037	GGA	2	6	7496	7501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16262458
139	NC_003037	CGT	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262458
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142	NC_003037	CGG	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262458
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148	NC_003037	GCT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262458
149	NC_003037	GGCT	2	8	8101	8108	0 %	25 %	50 %	25 %	16262458
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152	NC_003037	CTGT	2	8	8408	8415	0 %	50 %	25 %	25 %	16262458
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157	NC_003037	GCC	2	6	8734	8739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193782525
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159	NC_003037	GCTG	2	8	8846	8853	0 %	25 %	50 %	25 %	193782525
160	NC_003037	CTG	3	9	8851	8859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193782525
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256	NC_003037	GAG	2	6	16189	16194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193782527
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260	NC_003037	CTC	2	6	16367	16372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193782528
261	NC_003037	CCCA	2	8	16405	16412	25 %	0 %	0 %	75 %	193782528
262	NC_003037	CGG	2	6	16457	16462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193782528
263	NC_003037	TTC	2	6	16482	16487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	193782528
264	NC_003037	TGC	2	6	16564	16569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193782528
265	NC_003037	CGG	2	6	16610	16615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193782528
266	NC_003037	CGGG	2	8	16645	16652	0 %	0 %	75 %	25 %	193782528
267	NC_003037	CGG	2	6	16658	16663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193782528
268	NC_003037	GCGA	2	8	16669	16676	25 %	0 %	50 %	25 %	193782528
269	NC_003037	GCC	2	6	16707	16712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193782528
270	NC_003037	CGC	2	6	16751	16756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193782528
271	NC_003037	TGC	2	6	16912	16917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	193782528
272	NC_003037	GCG	2	6	16933	16938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	193782528
273	NC_003037	CTTG	2	8	16941	16948	0 %	50 %	25 %	25 %	193782528
274	NC_003037	CG	3	6	16961	16966	0 %	0 %	50 %	50 %	193782528
275	NC_003037	GGA	2	6	17040	17045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	193782528
276	NC_003037	GAC	2	6	17127	17132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193782528
277	NC_003037	ACG	2	6	17196	17201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193782528
278	NC_003037	CCT	2	6	17222	17227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	193782528
279	NC_003037	GCC	2	6	17244	17249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193782528
280	NC_003037	GCA	2	6	17284	17289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	193782528
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282	NC_003037	CAG	2	6	17425	17430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262466
283	NC_003037	TCGG	2	8	17431	17438	0 %	25 %	50 %	25 %	16262466
284	NC_003037	CG	3	6	17504	17509	0 %	0 %	50 %	50 %	16262466
285	NC_003037	CGG	2	6	17514	17519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262466
286	NC_003037	GC	3	6	17570	17575	0 %	0 %	50 %	50 %	16262466
287	NC_003037	TCC	2	6	17583	17588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16262466
288	NC_003037	G	6	6	17646	17651	0 %	0 %	100 %	0 %	16262466
289	NC_003037	CT	3	6	17693	17698	0 %	50 %	0 %	50 %	16262466
290	NC_003037	CCA	2	6	17821	17826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16262466
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292	NC_003037	CAG	2	6	17988	17993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262467
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294	NC_003037	GTC	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262467
295	NC_003037	TGA	2	6	18104	18109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16262467
296	NC_003037	AAG	2	6	18142	18147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16262467
297	NC_003037	CGG	2	6	18260	18265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262467
298	NC_003037	AGC	2	6	18289	18294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16262467
299	NC_003037	GTC	2	6	18295	18300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16262467
300	NC_003037	GGC	2	6	18328	18333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262467
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302	NC_003037	CGC	2	6	18413	18418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262467
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304	NC_003037	CTCG	2	8	18432	18439	0 %	25 %	25 %	50 %	16262467
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312	NC_003037	AAG	2	6	18825	18830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16262467
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340	NC_003037	CCG	3	9	20351	20359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262469
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381	NC_003037	GCTG	3	12	22700	22711	0 %	25 %	50 %	25 %	16262470
382	NC_003037	CGG	2	6	22760	22765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16262470
383	NC_003037	CCG	2	6	22806	22811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16262470
384	NC_003037	TCCTCG	2	12	22816	22827	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16262470
385	NC_003037	ACCA	2	8	22836	22843	50 %	0 %	0 %	50 %	16262470
386	NC_003037	ATCA	2	8	22977	22984	50 %	25 %	0 %	25 %	16262470
387	NC_003037	GGT	2	6	22992	22997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16262470
388	NC_003037	GCC	2	6	23423	23428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	193782529
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