MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 chromosome

Total Repeats: 55366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002952	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
2	NC_002952	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
3	NC_002952	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482254
4	NC_002952	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482254
5	NC_002952	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
6	NC_002952	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482254
7	NC_002952	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
8	NC_002952	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482254
9	NC_002952	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	49482254
10	NC_002952	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
11	NC_002952	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	49482254
12	NC_002952	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482254
13	NC_002952	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482254
14	NC_002952	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
15	NC_002952	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
16	NC_002952	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482254
17	NC_002952	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
18	NC_002952	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
19	NC_002952	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482254
20	NC_002952	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482254
21	NC_002952	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
22	NC_002952	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
23	NC_002952	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482254
24	NC_002952	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	49482254
25	NC_002952	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	49482254
26	NC_002952	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482254
27	NC_002952	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482254
28	NC_002952	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	49482254
29	NC_002952	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	49482254
30	NC_002952	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	49482254
31	NC_002952	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
32	NC_002952	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482254
33	NC_002952	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	49482254
34	NC_002952	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	49482254
35	NC_002952	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
36	NC_002952	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482254
37	NC_002952	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	49482255
38	NC_002952	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
39	NC_002952	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
40	NC_002952	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482255
41	NC_002952	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
42	NC_002952	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482255
43	NC_002952	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	49482255
44	NC_002952	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	49482255
45	NC_002952	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	49482255
46	NC_002952	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
47	NC_002952	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	49482255
48	NC_002952	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	49482255
49	NC_002952	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
50	NC_002952	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482255
51	NC_002952	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	49482255
52	NC_002952	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
53	NC_002952	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
54	NC_002952	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	49482255
55	NC_002952	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
56	NC_002952	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482255
57	NC_002952	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	49482255
58	NC_002952	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
59	NC_002952	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482255
60	NC_002952	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482255
61	NC_002952	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
62	NC_002952	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482255
63	NC_002952	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
64	NC_002952	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482255
65	NC_002952	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482255
66	NC_002952	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	49482255
67	NC_002952	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	49482255
68	NC_002952	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	49482255
69	NC_002952	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
70	NC_002952	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482255
71	NC_002952	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482255
72	NC_002952	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482255
73	NC_002952	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	49482255
74	NC_002952	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482256
75	NC_002952	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482256
76	NC_002952	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482256
77	NC_002952	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482256
78	NC_002952	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482256
79	NC_002952	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	49482256
80	NC_002952	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	49482256
81	NC_002952	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	49482256
82	NC_002952	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
83	NC_002952	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	49482257
84	NC_002952	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482257
85	NC_002952	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	49482257
86	NC_002952	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
87	NC_002952	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49482257
88	NC_002952	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482257
89	NC_002952	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482257
90	NC_002952	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482257
91	NC_002952	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	49482257
92	NC_002952	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
93	NC_002952	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
94	NC_002952	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482257
95	NC_002952	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482257
96	NC_002952	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
97	NC_002952	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
98	NC_002952	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482257
99	NC_002952	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482257
100	NC_002952	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482258
101	NC_002952	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	49482258
102	NC_002952	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	49482258
103	NC_002952	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482258
104	NC_002952	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	49482258
105	NC_002952	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482258
106	NC_002952	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	49482258
107	NC_002952	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
108	NC_002952	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49482258
109	NC_002952	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
110	NC_002952	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
111	NC_002952	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	49482258
112	NC_002952	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
113	NC_002952	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	49482258
114	NC_002952	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
115	NC_002952	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	49482258
116	NC_002952	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
117	NC_002952	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
118	NC_002952	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
119	NC_002952	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482258
120	NC_002952	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482258
121	NC_002952	TACG	2	8	5888	5895	25 %	25 %	25 %	25 %	49482258
122	NC_002952	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482258
123	NC_002952	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
124	NC_002952	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	49482258
125	NC_002952	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
126	NC_002952	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
127	NC_002952	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49482258
128	NC_002952	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482258
129	NC_002952	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	49482258
130	NC_002952	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482258
131	NC_002952	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
132	NC_002952	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	49482258
133	NC_002952	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	49482258
134	NC_002952	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	49482258
135	NC_002952	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
136	NC_002952	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482258
137	NC_002952	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482258
138	NC_002952	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	49482258
139	NC_002952	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	49482258
140	NC_002952	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482258
141	NC_002952	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482258
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143	NC_002952	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482259
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145	NC_002952	TATC	2	8	7255	7262	25 %	50 %	0 %	25 %	49482259
146	NC_002952	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49482259
147	NC_002952	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482259
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153	NC_002952	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	49482259
154	NC_002952	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482259
155	NC_002952	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	49482259
156	NC_002952	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482259
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159	NC_002952	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482259
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163	NC_002952	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482259
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239	NC_002952	TAT	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482261
240	NC_002952	CT	3	6	11304	11309	0 %	50 %	0 %	50 %	49482261
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250	NC_002952	GGT	2	6	11866	11871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482261
251	NC_002952	ATC	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482261
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253	NC_002952	GAT	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482261
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255	NC_002952	AAG	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482261
256	NC_002952	GCT	2	6	12160	12165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482261
257	NC_002952	ATT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482261
258	NC_002952	GT	3	6	12200	12205	0 %	50 %	50 %	0 %	49482261
259	NC_002952	AGC	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482261
260	NC_002952	ATG	2	6	12287	12292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482261
261	NC_002952	CCAT	2	8	12310	12317	25 %	25 %	0 %	50 %	49482261
262	NC_002952	CAAT	2	8	12373	12380	50 %	25 %	0 %	25 %	49482261
263	NC_002952	ATT	2	6	12797	12802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482262
264	NC_002952	GAT	2	6	12849	12854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482262
265	NC_002952	ACG	2	6	12893	12898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482262
266	NC_002952	ATTA	2	8	12902	12909	50 %	50 %	0 %	0 %	49482262
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268	NC_002952	CGT	2	6	12933	12938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482262
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273	NC_002952	TAA	2	6	13102	13107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482262
274	NC_002952	TGA	2	6	13109	13114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482262
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397	NC_002952	CAAC	2	8	19735	19742	50 %	0 %	0 %	50 %	49482267
398	NC_002952	AAC	2	6	19745	19750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482267
399	NC_002952	TAT	2	6	19788	19793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482267
400	NC_002952	GAT	2	6	19903	19908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482267
401	NC_002952	AATT	2	8	19934	19941	50 %	50 %	0 %	0 %	49482267
402	NC_002952	ATC	2	6	20003	20008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482267
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404	NC_002952	CAT	2	6	20063	20068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482267
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430	NC_002952	ATG	2	6	21131	21136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482269
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432	NC_002952	ATC	2	6	21201	21206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482269
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