MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 chromosome

Total Repeats: 55366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002952	ACC	2	6	182432	182437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482405
3502	NC_002952	TAA	2	6	182519	182524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482405
3503	NC_002952	TA	3	6	182539	182544	50 %	50 %	0 %	0 %	49482405
3504	NC_002952	ATC	2	6	182602	182607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482405
3505	NC_002952	TAA	2	6	182717	182722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482405
3506	NC_002952	ATT	2	6	182741	182746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482405
3507	NC_002952	ATA	2	6	182782	182787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482405
3508	NC_002952	CAT	2	6	182834	182839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482405
3509	NC_002952	AGT	2	6	182935	182940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482406
3510	NC_002952	GAA	2	6	183062	183067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482406
3511	NC_002952	AAT	2	6	183173	183178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482406
3512	NC_002952	GAT	2	6	183179	183184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482406
3513	NC_002952	ATT	2	6	183263	183268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482406
3514	NC_002952	GATG	2	8	183295	183302	25 %	25 %	50 %	0 %	49482406
3515	NC_002952	ATTT	2	8	183353	183360	25 %	75 %	0 %	0 %	49482406
3516	NC_002952	AGA	2	6	183400	183405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482406
3517	NC_002952	CAT	2	6	183424	183429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482406
3518	NC_002952	CTG	2	6	183519	183524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482406
3519	NC_002952	CAA	2	6	183598	183603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482406
3520	NC_002952	CAAA	2	8	183639	183646	75 %	0 %	0 %	25 %	49482406
3521	NC_002952	TAT	2	6	183718	183723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482406
3522	NC_002952	TAA	2	6	183772	183777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482406
3523	NC_002952	TGT	2	6	183793	183798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482406
3524	NC_002952	ATC	2	6	183815	183820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482406
3525	NC_002952	TGA	2	6	183877	183882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482406
3526	NC_002952	A	6	6	184108	184113	100 %	0 %	0 %	0 %	49482406
3527	NC_002952	TGT	2	6	184114	184119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482406
3528	NC_002952	ATC	2	6	184123	184128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482406
3529	NC_002952	TAT	2	6	184145	184150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482406
3530	NC_002952	AT	3	6	184161	184166	50 %	50 %	0 %	0 %	49482406
3531	NC_002952	AG	3	6	184248	184253	50 %	0 %	50 %	0 %	49482407
3532	NC_002952	A	7	7	184266	184272	100 %	0 %	0 %	0 %	49482407
3533	NC_002952	GT	3	6	184399	184404	0 %	50 %	50 %	0 %	49482407
3534	NC_002952	CAA	2	6	184455	184460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482407
3535	NC_002952	CAT	2	6	184505	184510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482407
3536	NC_002952	TAC	2	6	184550	184555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482407
3537	NC_002952	GCA	2	6	184578	184583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482407
3538	NC_002952	ATC	2	6	184588	184593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482407
3539	NC_002952	GTAA	2	8	184677	184684	50 %	25 %	25 %	0 %	49482407
3540	NC_002952	TGAAT	2	10	184691	184700	40 %	40 %	20 %	0 %	49482407
3541	NC_002952	ACAAAG	2	12	184744	184755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	49482407
3542	NC_002952	AG	3	6	184754	184759	50 %	0 %	50 %	0 %	49482407
3543	NC_002952	TTA	2	6	184765	184770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482407
3544	NC_002952	CAA	2	6	184798	184803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482407
3545	NC_002952	GTTT	2	8	184817	184824	0 %	75 %	25 %	0 %	49482407
3546	NC_002952	ATT	2	6	184830	184835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482407
3547	NC_002952	TCG	2	6	184877	184882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482407
3548	NC_002952	TGT	2	6	184952	184957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482407
3549	NC_002952	AATT	2	8	185035	185042	50 %	50 %	0 %	0 %	49482407
3550	NC_002952	AATC	2	8	185079	185086	50 %	25 %	0 %	25 %	49482407
3551	NC_002952	TGG	2	6	185108	185113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482407
3552	NC_002952	AGG	2	6	185122	185127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49482407
3553	NC_002952	ATTG	2	8	185252	185259	25 %	50 %	25 %	0 %	49482407
3554	NC_002952	GAT	2	6	185262	185267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482407
3555	NC_002952	AAT	2	6	185295	185300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482407
3556	NC_002952	ACG	2	6	185324	185329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482407
3557	NC_002952	ATT	2	6	185350	185355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482407
3558	NC_002952	ATA	2	6	185405	185410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482407
3559	NC_002952	ATA	2	6	185520	185525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482408
3560	NC_002952	TCA	2	6	185546	185551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482408
3561	NC_002952	CTT	2	6	185577	185582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482408
3562	NC_002952	ATT	2	6	185605	185610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482408
3563	NC_002952	TTG	2	6	185692	185697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482408
3564	NC_002952	TTC	2	6	185749	185754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482408
3565	NC_002952	TGTAAT	2	12	185768	185779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49482408
3566	NC_002952	CTC	2	6	185809	185814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49482409
3567	NC_002952	TAT	2	6	185820	185825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482409
3568	NC_002952	CCA	2	6	185916	185921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482409
3569	NC_002952	TGT	2	6	185975	185980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482409
3570	NC_002952	TAAA	2	8	185998	186005	75 %	25 %	0 %	0 %	49482409
3571	NC_002952	T	6	6	186030	186035	0 %	100 %	0 %	0 %	49482409
3572	NC_002952	TAA	2	6	186039	186044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482409
3573	NC_002952	CAAAA	2	10	186075	186084	80 %	0 %	0 %	20 %	49482409
3574	NC_002952	A	6	6	186081	186086	100 %	0 %	0 %	0 %	49482409
3575	NC_002952	A	6	6	186098	186103	100 %	0 %	0 %	0 %	49482409
3576	NC_002952	TA	3	6	186637	186642	50 %	50 %	0 %	0 %	49482410
3577	NC_002952	TTTA	2	8	186657	186664	25 %	75 %	0 %	0 %	49482410
3578	NC_002952	AAAGAT	2	12	186757	186768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49482410
3579	NC_002952	AAT	2	6	186910	186915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482410
3580	NC_002952	ACA	2	6	186934	186939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482410
3581	NC_002952	TGC	2	6	186957	186962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482410
3582	NC_002952	ATT	2	6	186974	186979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482410
3583	NC_002952	AGA	2	6	186999	187004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482410
3584	NC_002952	CGT	2	6	187065	187070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482410
3585	NC_002952	TGT	2	6	187077	187082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482410
3586	NC_002952	GCCA	2	8	187125	187132	25 %	0 %	25 %	50 %	49482410
3587	NC_002952	TGC	2	6	187134	187139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482410
3588	NC_002952	ATG	2	6	187286	187291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482410
3589	NC_002952	TGG	2	6	187386	187391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482410
3590	NC_002952	GAT	2	6	187414	187419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482410
3591	NC_002952	ATT	2	6	187500	187505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482410
3592	NC_002952	A	6	6	187514	187519	100 %	0 %	0 %	0 %	49482410
3593	NC_002952	AT	3	6	187644	187649	50 %	50 %	0 %	0 %	49482410
3594	NC_002952	GCA	2	6	187654	187659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482410
3595	NC_002952	GGT	2	6	187687	187692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482410
3596	NC_002952	TTC	2	6	187726	187731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49482410
3597	NC_002952	ATC	2	6	187763	187768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482410
3598	NC_002952	AAG	2	6	187781	187786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482410
3599	NC_002952	GAT	2	6	187825	187830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482410
3600	NC_002952	AAG	2	6	187832	187837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482410
3601	NC_002952	GGC	2	6	187876	187881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49482410
3602	NC_002952	TGG	2	6	187986	187991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482410
3603	NC_002952	A	6	6	187996	188001	100 %	0 %	0 %	0 %	49482410
3604	NC_002952	CAA	2	6	188047	188052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482410
3605	NC_002952	TCA	2	6	188794	188799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482411
3606	NC_002952	ATC	2	6	188805	188810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482411
3607	NC_002952	A	6	6	188811	188816	100 %	0 %	0 %	0 %	49482411
3608	NC_002952	CAA	2	6	188819	188824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482411
3609	NC_002952	ATC	2	6	188855	188860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482411
3610	NC_002952	TAT	2	6	188865	188870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482411
3611	NC_002952	TTG	2	6	188886	188891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482411
3612	NC_002952	ATTT	2	8	188981	188988	25 %	75 %	0 %	0 %	49482411
3613	NC_002952	AAG	2	6	188996	189001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482411
3614	NC_002952	TAT	2	6	189115	189120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482411
3615	NC_002952	ATT	2	6	189185	189190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482411
3616	NC_002952	AAG	2	6	189222	189227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482411
3617	NC_002952	CAATAT	2	12	189229	189240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	49482411
3618	NC_002952	CAT	2	6	189331	189336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482411
3619	NC_002952	TCA	2	6	189366	189371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482411
3620	NC_002952	GTG	2	6	189378	189383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482411
3621	NC_002952	A	6	6	189469	189474	100 %	0 %	0 %	0 %	49482411
3622	NC_002952	ACA	2	6	189521	189526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482411
3623	NC_002952	ATT	2	6	189531	189536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482411
3624	NC_002952	TGT	2	6	189550	189555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482411
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3997	NC_002952	CTA	2	6	207833	207838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482424
3998	NC_002952	GT	3	6	207865	207870	0 %	50 %	50 %	0 %	49482424
3999	NC_002952	TAA	2	6	207956	207961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482424
4000	NC_002952	CCG	2	6	207970	207975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49482424

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