MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 chromosome

Total Repeats: 55366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002952	ACC	2	6	135242	135247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482363
2502	NC_002952	ATC	2	6	135253	135258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482363
2503	NC_002952	CAT	2	6	135327	135332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482363
2504	NC_002952	ATC	2	6	135337	135342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482363
2505	NC_002952	AAC	2	6	135380	135385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482363
2506	NC_002952	AAG	2	6	135391	135396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482363
2507	NC_002952	CAA	2	6	135453	135458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482363
2508	NC_002952	ATA	2	6	135487	135492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482363
2509	NC_002952	CAT	2	6	135664	135669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482363
2510	NC_002952	ATT	2	6	135679	135684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482363
2511	NC_002952	AGA	2	6	135731	135736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482363
2512	NC_002952	ATTTT	2	10	135796	135805	20 %	80 %	0 %	0 %	49482363
2513	NC_002952	ATCAA	2	10	135823	135832	60 %	20 %	0 %	20 %	49482363
2514	NC_002952	ATTT	2	8	135960	135967	25 %	75 %	0 %	0 %	49482363
2515	NC_002952	TACG	2	8	136003	136010	25 %	25 %	25 %	25 %	49482363
2516	NC_002952	GAA	2	6	136107	136112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482363
2517	NC_002952	TTA	2	6	136170	136175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482363
2518	NC_002952	ATT	2	6	136250	136255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482363
2519	NC_002952	ATT	2	6	136355	136360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482363
2520	NC_002952	TCTA	2	8	136484	136491	25 %	50 %	0 %	25 %	49482363
2521	NC_002952	TGT	2	6	136526	136531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482363
2522	NC_002952	GCA	2	6	136533	136538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482363
2523	NC_002952	TGT	2	6	136547	136552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482363
2524	NC_002952	ATG	2	6	136561	136566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482363
2525	NC_002952	GTA	2	6	136596	136601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482363
2526	NC_002952	A	6	6	136695	136700	100 %	0 %	0 %	0 %	49482363
2527	NC_002952	TATT	2	8	136720	136727	25 %	75 %	0 %	0 %	49482363
2528	NC_002952	AGA	2	6	136736	136741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482363
2529	NC_002952	TGA	2	6	136780	136785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482363
2530	NC_002952	AGG	2	6	136852	136857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49482363
2531	NC_002952	ATC	2	6	136920	136925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482364
2532	NC_002952	TTAT	2	8	136928	136935	25 %	75 %	0 %	0 %	49482364
2533	NC_002952	TTG	2	6	136943	136948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482364
2534	NC_002952	CTG	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482364
2535	NC_002952	ATCAC	2	10	137056	137065	40 %	20 %	0 %	40 %	49482364
2536	NC_002952	ACA	3	9	137098	137106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482364
2537	NC_002952	GA	3	6	137124	137129	50 %	0 %	50 %	0 %	49482364
2538	NC_002952	ATG	2	6	137153	137158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2539	NC_002952	TTA	2	6	137185	137190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482364
2540	NC_002952	CAGA	2	8	137191	137198	50 %	0 %	25 %	25 %	49482364
2541	NC_002952	CCA	2	6	137239	137244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482364
2542	NC_002952	ATC	2	6	137300	137305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482364
2543	NC_002952	ACG	2	6	137419	137424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482364
2544	NC_002952	TGT	2	6	137436	137441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482364
2545	NC_002952	CAA	2	6	137461	137466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482364
2546	NC_002952	ATG	2	6	137528	137533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2547	NC_002952	GAT	2	6	137538	137543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2548	NC_002952	GAA	2	6	137593	137598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482364
2549	NC_002952	TGA	2	6	137634	137639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2550	NC_002952	CAA	2	6	137653	137658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482364
2551	NC_002952	ATT	2	6	137696	137701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482364
2552	NC_002952	AACGA	2	10	137733	137742	60 %	0 %	20 %	20 %	49482364
2553	NC_002952	CAA	2	6	137806	137811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482364
2554	NC_002952	AAAC	2	8	137899	137906	75 %	0 %	0 %	25 %	49482364
2555	NC_002952	AT	4	8	137945	137952	50 %	50 %	0 %	0 %	49482364
2556	NC_002952	TAA	2	6	138006	138011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482364
2557	NC_002952	CATT	2	8	138023	138030	25 %	50 %	0 %	25 %	49482364
2558	NC_002952	TAT	2	6	138115	138120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482364
2559	NC_002952	ATG	2	6	138154	138159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2560	NC_002952	TCAT	2	8	138161	138168	25 %	50 %	0 %	25 %	49482364
2561	NC_002952	ATG	2	6	138209	138214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2562	NC_002952	GCT	2	6	138247	138252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482364
2563	NC_002952	A	6	6	138289	138294	100 %	0 %	0 %	0 %	49482364
2564	NC_002952	GAT	2	6	138322	138327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2565	NC_002952	ATG	2	6	138353	138358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482364
2566	NC_002952	TTA	2	6	138368	138373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482364
2567	NC_002952	ATC	2	6	138385	138390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482364
2568	NC_002952	TTAT	2	8	138391	138398	25 %	75 %	0 %	0 %	49482364
2569	NC_002952	CAT	2	6	138450	138455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482364
2570	NC_002952	AAG	2	6	138467	138472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482364
2571	NC_002952	TTTG	2	8	138507	138514	0 %	75 %	25 %	0 %	49482364
2572	NC_002952	ATT	2	6	138552	138557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482364
2573	NC_002952	TCA	2	6	138579	138584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482364
2574	NC_002952	AGG	2	6	138606	138611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49482364
2575	NC_002952	CAA	2	6	138623	138628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482364
2576	NC_002952	TGA	2	6	138699	138704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482365
2577	NC_002952	GCA	2	6	138716	138721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482365
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2579	NC_002952	ATG	2	6	138768	138773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482365
2580	NC_002952	AGC	2	6	138805	138810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482365
2581	NC_002952	GATA	2	8	138844	138851	50 %	25 %	25 %	0 %	49482365
2582	NC_002952	TAT	2	6	138889	138894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482365
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2585	NC_002952	TGG	2	6	138979	138984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482365
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2587	NC_002952	TGA	2	6	139183	139188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482365
2588	NC_002952	TGAAGA	2	12	139264	139275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49482365
2589	NC_002952	GGCA	2	8	139287	139294	25 %	0 %	50 %	25 %	49482365
2590	NC_002952	ATTT	2	8	139309	139316	25 %	75 %	0 %	0 %	49482365
2591	NC_002952	TGA	2	6	139321	139326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482365
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2593	NC_002952	CAT	2	6	139483	139488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482366
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2595	NC_002952	ATT	2	6	139657	139662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482366
2596	NC_002952	TGG	2	6	139665	139670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482366
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2598	NC_002952	AGA	2	6	139773	139778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482366
2599	NC_002952	ACACA	2	10	139789	139798	60 %	0 %	0 %	40 %	49482366
2600	NC_002952	TGA	2	6	139893	139898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482366
2601	NC_002952	TTTCAT	2	12	139945	139956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	49482366
2602	NC_002952	A	6	6	140014	140019	100 %	0 %	0 %	0 %	49482366
2603	NC_002952	TGG	3	9	140070	140078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482366
2604	NC_002952	AGG	2	6	140286	140291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49482366
2605	NC_002952	CAA	2	6	140296	140301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482366
2606	NC_002952	GCA	2	6	140322	140327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482366
2607	NC_002952	ATTT	3	12	140562	140573	25 %	75 %	0 %	0 %	49482366
2608	NC_002952	CAAA	2	8	140578	140585	75 %	0 %	0 %	25 %	49482366
2609	NC_002952	GGA	2	6	140586	140591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49482366
2610	NC_002952	A	6	6	140684	140689	100 %	0 %	0 %	0 %	49482367
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2615	NC_002952	ACA	2	6	140907	140912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482367
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2619	NC_002952	GTT	3	9	141062	141070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482367
2620	NC_002952	AG	3	6	141075	141080	50 %	0 %	50 %	0 %	49482367
2621	NC_002952	CAA	2	6	141112	141117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482367
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2997	NC_002952	GCT	2	6	159496	159501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482386
2998	NC_002952	TGG	2	6	159531	159536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482386
2999	NC_002952	T	6	6	159555	159560	0 %	100 %	0 %	0 %	49482386
3000	NC_002952	CAA	2	6	159575	159580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482386

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