MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 chromosome

Total Repeats: 55366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002952	AAG	2	6	25752	25757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
502	NC_002952	TTA	2	6	25851	25856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
503	NC_002952	ATT	3	9	25914	25922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
504	NC_002952	CGA	3	9	25924	25932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482272
505	NC_002952	AATC	2	8	25952	25959	50 %	25 %	0 %	25 %	49482272
506	NC_002952	GGT	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482272
507	NC_002952	TA	3	6	26062	26067	50 %	50 %	0 %	0 %	49482272
508	NC_002952	ATA	2	6	26149	26154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482272
509	NC_002952	TTG	2	6	26170	26175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482272
510	NC_002952	ATT	2	6	26189	26194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
511	NC_002952	ACCAA	2	10	26235	26244	60 %	0 %	0 %	40 %	49482272
512	NC_002952	ATG	2	6	26317	26322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482272
513	NC_002952	TAA	2	6	26348	26353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482272
514	NC_002952	AAG	2	6	26371	26376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
515	NC_002952	TAT	2	6	26441	26446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
516	NC_002952	CGT	2	6	26457	26462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482272
517	NC_002952	CGTATT	2	12	26466	26477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49482272
518	NC_002952	AGA	2	6	26516	26521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
519	NC_002952	CAT	2	6	26522	26527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482272
520	NC_002952	GAA	2	6	26577	26582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
521	NC_002952	AAT	2	6	26592	26597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482272
522	NC_002952	TTA	2	6	26607	26612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
523	NC_002952	GAA	3	9	26622	26630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
524	NC_002952	AAC	3	9	26719	26727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482272
525	NC_002952	CGT	2	6	26742	26747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482272
526	NC_002952	TTG	2	6	26752	26757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482272
527	NC_002952	GAA	2	6	26820	26825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
528	NC_002952	GAA	2	6	26877	26882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482272
529	NC_002952	ATCAA	2	10	26947	26956	60 %	20 %	0 %	20 %	49482272
530	NC_002952	TAA	2	6	26987	26992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482272
531	NC_002952	ATT	2	6	26994	26999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482272
532	NC_002952	ACA	2	6	27027	27032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482272
533	NC_002952	GGT	2	6	27294	27299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482272
534	NC_002952	ATCT	2	8	27386	27393	25 %	50 %	0 %	25 %	49482272
535	NC_002952	AAT	2	6	27439	27444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482272
536	NC_002952	TGA	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482273
537	NC_002952	AT	3	6	27504	27509	50 %	50 %	0 %	0 %	49482273
538	NC_002952	AAG	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482273
539	NC_002952	GAAAC	2	10	27568	27577	60 %	0 %	20 %	20 %	49482273
540	NC_002952	ATT	2	6	27631	27636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482273
541	NC_002952	ATC	2	6	27650	27655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482273
542	NC_002952	A	6	6	27708	27713	100 %	0 %	0 %	0 %	49482273
543	NC_002952	GAAGT	2	10	27718	27727	40 %	20 %	40 %	0 %	49482273
544	NC_002952	TCG	2	6	27741	27746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482273
545	NC_002952	TGA	2	6	27758	27763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482273
546	NC_002952	ATT	2	6	27789	27794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482273
547	NC_002952	ATTTCA	2	12	27869	27880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	49482273
548	NC_002952	ATG	2	6	27899	27904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482273
549	NC_002952	TGA	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482273
550	NC_002952	AAC	2	6	27963	27968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482273
551	NC_002952	T	6	6	27987	27992	0 %	100 %	0 %	0 %	49482273
552	NC_002952	A	6	6	28012	28017	100 %	0 %	0 %	0 %	49482273
553	NC_002952	ATC	2	6	28039	28044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482273
554	NC_002952	ACAA	2	8	28045	28052	75 %	0 %	0 %	25 %	49482273
555	NC_002952	ACG	2	6	28069	28074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482273
556	NC_002952	AATG	2	8	28149	28156	50 %	25 %	25 %	0 %	49482273
557	NC_002952	TCGT	2	8	28181	28188	0 %	50 %	25 %	25 %	49482273
558	NC_002952	GTG	2	6	28199	28204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482273
559	NC_002952	ACA	2	6	28214	28219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482273
560	NC_002952	ATA	2	6	28220	28225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482273
561	NC_002952	GAA	2	6	28309	28314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482273
562	NC_002952	TTA	2	6	28337	28342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482273
563	NC_002952	TGG	2	6	28350	28355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482273
564	NC_002952	AAT	2	6	28390	28395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482273
565	NC_002952	TAA	2	6	28446	28451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482273
566	NC_002952	TCG	2	6	28506	28511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49482273
567	NC_002952	TGT	2	6	28530	28535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49482273
568	NC_002952	ATA	2	6	28550	28555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482273
569	NC_002952	AACA	2	8	28626	28633	75 %	0 %	0 %	25 %	49482273
570	NC_002952	ATG	2	6	28727	28732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482273
571	NC_002952	TAA	2	6	28848	28853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482274
572	NC_002952	CA	3	6	28865	28870	50 %	0 %	0 %	50 %	49482274
573	NC_002952	CAA	2	6	28906	28911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482274
574	NC_002952	GAA	2	6	28912	28917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482274
575	NC_002952	TAAA	2	8	28940	28947	75 %	25 %	0 %	0 %	49482274
576	NC_002952	TGG	2	6	29040	29045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49482274
577	NC_002952	ATT	2	6	29049	29054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482274
578	NC_002952	GT	3	6	29129	29134	0 %	50 %	50 %	0 %	49482274
579	NC_002952	GTTCTG	2	12	29168	29179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	49482274
580	NC_002952	AAT	2	6	29218	29223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482274
581	NC_002952	AGA	2	6	29250	29255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482274
582	NC_002952	TAA	2	6	29256	29261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482274
583	NC_002952	CAAT	2	8	29278	29285	50 %	25 %	0 %	25 %	49482274
584	NC_002952	GATG	2	8	29286	29293	25 %	25 %	50 %	0 %	49482274
585	NC_002952	AAG	2	6	29320	29325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482274
586	NC_002952	ATTAT	2	10	29361	29370	40 %	60 %	0 %	0 %	49482274
587	NC_002952	A	6	6	29383	29388	100 %	0 %	0 %	0 %	49482274
588	NC_002952	TGA	2	6	29391	29396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482274
589	NC_002952	TAC	2	6	29419	29424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482274
590	NC_002952	AACGA	2	10	29434	29443	60 %	0 %	20 %	20 %	49482274
591	NC_002952	TACT	2	8	29508	29515	25 %	50 %	0 %	25 %	49482274
592	NC_002952	ATA	2	6	29531	29536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482274
593	NC_002952	ATT	2	6	29545	29550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482274
594	NC_002952	GTA	2	6	29984	29989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482275
595	NC_002952	GAA	2	6	30064	30069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482275
596	NC_002952	GGCA	2	8	30206	30213	25 %	0 %	50 %	25 %	49482275
597	NC_002952	AAAG	2	8	30219	30226	75 %	0 %	25 %	0 %	49482275
598	NC_002952	ATG	2	6	30320	30325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482275
599	NC_002952	ATA	2	6	30353	30358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482275
600	NC_002952	AAG	2	6	30364	30369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482275
601	NC_002952	AAC	2	6	30503	30508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482275
602	NC_002952	ATA	2	6	30617	30622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482275
603	NC_002952	GAAC	2	8	30663	30670	50 %	0 %	25 %	25 %	49482275
604	NC_002952	AAG	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482275
605	NC_002952	AT	3	6	30733	30738	50 %	50 %	0 %	0 %	49482275
606	NC_002952	ATA	2	6	30935	30940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49482276
607	NC_002952	TTA	2	6	30983	30988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49482276
608	NC_002952	AAC	2	6	31090	31095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
609	NC_002952	CAA	2	6	31107	31112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
610	NC_002952	CAA	2	6	31121	31126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
611	NC_002952	CAA	2	6	31134	31139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
612	NC_002952	TCA	2	6	31150	31155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49482276
613	NC_002952	GAA	2	6	31163	31168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482276
614	NC_002952	CAAC	2	8	31173	31180	50 %	0 %	0 %	50 %	49482276
615	NC_002952	ATCAGC	2	12	31183	31194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	49482276
616	NC_002952	TGA	2	6	31207	31212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482276
617	NC_002952	ACAA	2	8	31214	31221	75 %	0 %	0 %	25 %	49482276
618	NC_002952	CAG	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49482276
619	NC_002952	CAA	2	6	31269	31274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
620	NC_002952	AAACG	2	10	31279	31288	60 %	0 %	20 %	20 %	49482276
621	NC_002952	CG	3	6	31287	31292	0 %	0 %	50 %	50 %	49482276
622	NC_002952	ACA	2	6	31303	31308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
623	NC_002952	CAC	2	6	31377	31382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49482276
624	NC_002952	ACA	3	9	31409	31417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49482276
625	NC_002952	TACA	2	8	31428	31435	50 %	25 %	0 %	25 %	49482276
626	NC_002952	GAA	2	6	31460	31465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482276
627	NC_002952	GAA	2	6	31586	31591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49482276
628	NC_002952	ATG	2	6	31620	31625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49482276
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