MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 54659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002951	TAT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651109
2	NC_002951	CAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651109
3	NC_002951	TGT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651109
4	NC_002951	TAC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651109
5	NC_002951	GAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
6	NC_002951	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651109
7	NC_002951	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651109
8	NC_002951	AAC	2	6	852	857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651109
9	NC_002951	AG	3	6	880	885	50 %	0 %	50 %	0 %	57651109
10	NC_002951	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651109
11	NC_002951	ATGC	2	8	1039	1046	25 %	25 %	25 %	25 %	57651109
12	NC_002951	TCA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651109
13	NC_002951	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651109
14	NC_002951	TTA	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651109
15	NC_002951	TTA	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651109
16	NC_002951	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651109
17	NC_002951	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
18	NC_002951	ACC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57651109
19	NC_002951	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
20	NC_002951	TTG	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651109
21	NC_002951	CCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57651109
22	NC_002951	AGA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
23	NC_002951	GAA	3	9	1426	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
24	NC_002951	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57651109
25	NC_002951	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	57651109
26	NC_002951	CAAAT	2	10	1472	1481	60 %	20 %	0 %	20 %	57651109
27	NC_002951	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651109
28	NC_002951	CTG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651109
29	NC_002951	A	6	6	1637	1642	100 %	0 %	0 %	0 %	57651109
30	NC_002951	A	7	7	1686	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	57651109
31	NC_002951	AG	3	6	1741	1746	50 %	0 %	50 %	0 %	57651109
32	NC_002951	GAA	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
33	NC_002951	TGG	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651109
34	NC_002951	TCAT	2	8	1808	1815	25 %	50 %	0 %	25 %	57651109
35	NC_002951	A	6	6	1823	1828	100 %	0 %	0 %	0 %	57651109
36	NC_002951	AGA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
37	NC_002951	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651109
38	NC_002951	TAAT	2	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	57651110
39	NC_002951	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
40	NC_002951	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
41	NC_002951	AAC	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651110
42	NC_002951	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651110
43	NC_002951	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651110
44	NC_002951	A	7	7	2443	2449	100 %	0 %	0 %	0 %	57651110
45	NC_002951	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	57651110
46	NC_002951	AATTT	2	10	2520	2529	40 %	60 %	0 %	0 %	57651110
47	NC_002951	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
48	NC_002951	CAATT	2	10	2586	2595	40 %	40 %	0 %	20 %	57651110
49	NC_002951	CAAA	2	8	2627	2634	75 %	0 %	0 %	25 %	57651110
50	NC_002951	GACT	2	8	2719	2726	25 %	25 %	25 %	25 %	57651110
51	NC_002951	AGA	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651110
52	NC_002951	TCA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651110
53	NC_002951	TAAA	2	8	2814	2821	75 %	25 %	0 %	0 %	57651110
54	NC_002951	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651110
55	NC_002951	TCT	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651110
56	NC_002951	TTTA	2	8	2875	2882	25 %	75 %	0 %	0 %	57651110
57	NC_002951	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
58	NC_002951	ACA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651110
59	NC_002951	AAATT	2	10	2964	2973	60 %	40 %	0 %	0 %	57651110
60	NC_002951	TTA	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
61	NC_002951	GGT	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651110
62	NC_002951	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651110
63	NC_002951	TGA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651110
64	NC_002951	GTT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651110
65	NC_002951	TCT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651110
66	NC_002951	AGA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651110
67	NC_002951	GGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651110
68	NC_002951	TTCA	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	57651110
69	NC_002951	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	57651110
70	NC_002951	GATG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	50 %	0 %	57651110
71	NC_002951	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651110
72	NC_002951	GTTGAA	2	12	3218	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651110
73	NC_002951	TTC	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651110
74	NC_002951	GAC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651110
75	NC_002951	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	57651110
76	NC_002951	ATT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651111
77	NC_002951	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651111
78	NC_002951	GTA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651111
79	NC_002951	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651111
80	NC_002951	TGG	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651111
81	NC_002951	ATTA	2	8	3819	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	57651111
82	NC_002951	TTCT	2	8	3909	3916	0 %	75 %	0 %	25 %	57651111
83	NC_002951	TCAT	2	8	3920	3927	25 %	50 %	0 %	25 %	57651111
84	NC_002951	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651112
85	NC_002951	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	57651112
86	NC_002951	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651112
87	NC_002951	AT	3	6	4256	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	57651112
88	NC_002951	AGA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651112
89	NC_002951	CTC	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57651112
90	NC_002951	GAC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651112
91	NC_002951	CTG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651112
92	NC_002951	AAT	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651112
93	NC_002951	A	7	7	4450	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	57651112
94	NC_002951	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651112
95	NC_002951	AAG	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651112
96	NC_002951	ATT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651112
97	NC_002951	GAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651112
98	NC_002951	ATA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651112
99	NC_002951	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651112
100	NC_002951	TTA	3	9	4875	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651112
101	NC_002951	GAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651112
102	NC_002951	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651112
103	NC_002951	ACA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651113
104	NC_002951	AGC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651113
105	NC_002951	GTAT	2	8	5158	5165	25 %	50 %	25 %	0 %	57651113
106	NC_002951	AG	4	8	5180	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	57651113
107	NC_002951	ATA	2	6	5218	5223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651113
108	NC_002951	CAAAT	2	10	5251	5260	60 %	20 %	0 %	20 %	57651113
109	NC_002951	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651113
110	NC_002951	A	6	6	5335	5340	100 %	0 %	0 %	0 %	57651113
111	NC_002951	TGG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651113
112	NC_002951	TGGCGG	2	12	5396	5407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	57651113
113	NC_002951	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651113
114	NC_002951	TCA	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651113
115	NC_002951	TA	3	6	5501	5506	50 %	50 %	0 %	0 %	57651113
116	NC_002951	TCA	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651113
117	NC_002951	A	6	6	5520	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	57651113
118	NC_002951	AAG	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651113
119	NC_002951	CAG	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651113
120	NC_002951	AG	3	6	5658	5663	50 %	0 %	50 %	0 %	57651113
121	NC_002951	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651113
122	NC_002951	AGA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651113
123	NC_002951	ATG	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651113
124	NC_002951	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651113
125	NC_002951	GAT	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651113
126	NC_002951	GGT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651113
127	NC_002951	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651113
128	NC_002951	TATC	2	8	6061	6068	25 %	50 %	0 %	25 %	57651113
129	NC_002951	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651113
130	NC_002951	TAT	2	6	6218	6223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651113
131	NC_002951	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57651113
132	NC_002951	TGC	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651113
133	NC_002951	A	6	6	6249	6254	100 %	0 %	0 %	0 %	57651113
134	NC_002951	CGT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651113
135	NC_002951	GAA	2	6	6339	6344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651113
136	NC_002951	G	6	6	6378	6383	0 %	0 %	100 %	0 %	57651113
137	NC_002951	TAGA	2	8	6466	6473	50 %	25 %	25 %	0 %	57651113
138	NC_002951	TGGA	2	8	6592	6599	25 %	25 %	50 %	0 %	57651113
139	NC_002951	TTA	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651113
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141	NC_002951	TAT	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651113
142	NC_002951	TGAAT	2	10	6761	6770	40 %	40 %	20 %	0 %	57651113
143	NC_002951	AATG	2	8	6815	6822	50 %	25 %	25 %	0 %	57651113
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147	NC_002951	TCG	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651114
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149	NC_002951	GTTATC	2	12	7324	7335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	57651114
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152	NC_002951	GCA	3	9	7383	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651114
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156	NC_002951	TTA	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651114
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160	NC_002951	GGA	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57651114
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162	NC_002951	TTCAA	2	10	7748	7757	40 %	40 %	0 %	20 %	57651114
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164	NC_002951	TTG	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651114
165	NC_002951	A	6	6	7855	7860	100 %	0 %	0 %	0 %	57651114
166	NC_002951	TCGT	2	8	7870	7877	0 %	50 %	25 %	25 %	57651114
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183	NC_002951	AGTT	2	8	8431	8438	25 %	50 %	25 %	0 %	57651114
184	NC_002951	TGA	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651114
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238	NC_002951	TAT	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651116
239	NC_002951	TAC	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651116
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243	NC_002951	ACAATT	2	12	11279	11290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57651116
244	NC_002951	T	6	6	11289	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	57651116
245	NC_002951	TAT	2	6	11306	11311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651116
246	NC_002951	CT	3	6	11333	11338	0 %	50 %	0 %	50 %	57651116
247	NC_002951	TAGCAT	2	12	11374	11385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57651116
248	NC_002951	GAA	2	6	11418	11423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651116
249	NC_002951	AAG	2	6	11482	11487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651116
250	NC_002951	TA	3	6	11541	11546	50 %	50 %	0 %	0 %	57651116
251	NC_002951	AGA	2	6	11552	11557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651116
252	NC_002951	TGC	2	6	11582	11587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651116
253	NC_002951	ATG	2	6	11632	11637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651116
254	NC_002951	ACG	2	6	11715	11720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651116
255	NC_002951	CGTTG	2	10	11755	11764	0 %	40 %	40 %	20 %	57651116
256	NC_002951	AATG	2	8	11831	11838	50 %	25 %	25 %	0 %	57651116
257	NC_002951	GGT	2	6	11895	11900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651116
258	NC_002951	ATC	2	6	11935	11940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651116
259	NC_002951	CGT	2	6	11979	11984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651116
260	NC_002951	GAT	2	6	12065	12070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651116
261	NC_002951	TGC	3	9	12080	12088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651116
262	NC_002951	AAG	2	6	12160	12165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651116
263	NC_002951	GCT	2	6	12189	12194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651116
264	NC_002951	ATT	2	6	12210	12215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651116
265	NC_002951	AGC	2	6	12263	12268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651116
266	NC_002951	ATG	2	6	12316	12321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651116
267	NC_002951	CCAT	2	8	12339	12346	25 %	25 %	0 %	50 %	57651116
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269	NC_002951	ATT	2	6	12827	12832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651117
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398	NC_002951	ATG	2	6	19563	19568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651122
399	NC_002951	TTG	2	6	19591	19596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651122
400	NC_002951	TAAA	2	8	19636	19643	75 %	25 %	0 %	0 %	57651122
401	NC_002951	GTT	2	6	19656	19661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651122
402	NC_002951	ATC	2	6	19666	19671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651122
403	NC_002951	GTG	2	6	19678	19683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651122
404	NC_002951	TTG	2	6	19704	19709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651122
405	NC_002951	AT	4	8	19710	19717	50 %	50 %	0 %	0 %	57651122
406	NC_002951	CAAC	2	8	19770	19777	50 %	0 %	0 %	50 %	57651122
407	NC_002951	AAC	2	6	19780	19785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651122
408	NC_002951	TAT	2	6	19823	19828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651122
409	NC_002951	GAT	2	6	19938	19943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651122
410	NC_002951	AATT	2	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	57651122
411	NC_002951	ATC	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651122
412	NC_002951	AGC	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651122
413	NC_002951	CAT	2	6	20098	20103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651122
414	NC_002951	TGT	2	6	20105	20110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651122
415	NC_002951	TGG	2	6	20192	20197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651122
416	NC_002951	ACA	2	6	20267	20272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651122
417	NC_002951	TAAAGG	2	12	20335	20346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	57651123
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419	NC_002951	AAG	2	6	20364	20369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651123
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425	NC_002951	AGTA	2	8	20584	20591	50 %	25 %	25 %	0 %	57651123
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429	NC_002951	GTCT	2	8	20840	20847	0 %	50 %	25 %	25 %	57651124
430	NC_002951	ATT	2	6	20856	20861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651124
431	NC_002951	TAC	2	6	20882	20887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651124
432	NC_002951	ATG	2	6	20949	20954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651124
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434	NC_002951	TGT	2	6	20984	20989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651124
435	NC_002951	TGAA	2	8	21025	21032	50 %	25 %	25 %	0 %	57651124
436	NC_002951	ACG	2	6	21078	21083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651124
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439	NC_002951	GATT	2	8	21136	21143	25 %	50 %	25 %	0 %	57651124
440	NC_002951	ATG	2	6	21166	21171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651124
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442	NC_002951	ATC	2	6	21236	21241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651124
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451	NC_002951	GTG	2	6	21886	21891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651124
452	NC_002951	AAC	2	6	21895	21900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651124
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462	NC_002951	ATA	2	6	22141	22146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651124
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500	NC_002951	AAT	3	9	25176	25184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651127

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