MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 56381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002758	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
2	NC_002758	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
3	NC_002758	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922991
4	NC_002758	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922991
5	NC_002758	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
6	NC_002758	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922991
7	NC_002758	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
8	NC_002758	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
9	NC_002758	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	15922991
10	NC_002758	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922991
11	NC_002758	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
12	NC_002758	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	15922991
13	NC_002758	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	15922991
14	NC_002758	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922991
15	NC_002758	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922991
16	NC_002758	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
17	NC_002758	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
18	NC_002758	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922991
19	NC_002758	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
20	NC_002758	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
21	NC_002758	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
22	NC_002758	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922991
23	NC_002758	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
24	NC_002758	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
25	NC_002758	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
26	NC_002758	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
27	NC_002758	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	15922991
28	NC_002758	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	15922991
29	NC_002758	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
30	NC_002758	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922991
31	NC_002758	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	15922991
32	NC_002758	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	15922991
33	NC_002758	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	15922991
34	NC_002758	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
35	NC_002758	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922991
36	NC_002758	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	15922991
37	NC_002758	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	15922991
38	NC_002758	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
39	NC_002758	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
40	NC_002758	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	15922992
41	NC_002758	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
42	NC_002758	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
43	NC_002758	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922992
44	NC_002758	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
45	NC_002758	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922992
46	NC_002758	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	15922992
47	NC_002758	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	15922992
48	NC_002758	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	15922992
49	NC_002758	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
50	NC_002758	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	15922992
51	NC_002758	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	15922992
52	NC_002758	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
53	NC_002758	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922992
54	NC_002758	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	15922992
55	NC_002758	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
56	NC_002758	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
57	NC_002758	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	15922992
58	NC_002758	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
59	NC_002758	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922992
60	NC_002758	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	15922992
61	NC_002758	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
62	NC_002758	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922992
63	NC_002758	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
64	NC_002758	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
65	NC_002758	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922992
66	NC_002758	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
67	NC_002758	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
68	NC_002758	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922992
69	NC_002758	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	15922992
70	NC_002758	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	15922992
71	NC_002758	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	15922992
72	NC_002758	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
73	NC_002758	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
74	NC_002758	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
75	NC_002758	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922992
76	NC_002758	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	15922992
77	NC_002758	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922993
78	NC_002758	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922993
79	NC_002758	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922993
80	NC_002758	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922993
81	NC_002758	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922993
82	NC_002758	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	15922993
83	NC_002758	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	15922993
84	NC_002758	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	15922993
85	NC_002758	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
86	NC_002758	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	15922994
87	NC_002758	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922994
88	NC_002758	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	15922994
89	NC_002758	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
90	NC_002758	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15922994
91	NC_002758	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922994
92	NC_002758	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922994
93	NC_002758	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922994
94	NC_002758	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	15922994
95	NC_002758	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922994
96	NC_002758	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
97	NC_002758	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
98	NC_002758	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
99	NC_002758	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922994
100	NC_002758	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
101	NC_002758	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
102	NC_002758	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
103	NC_002758	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
104	NC_002758	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922995
105	NC_002758	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	15922995
106	NC_002758	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	15922995
107	NC_002758	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922995
108	NC_002758	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922995
109	NC_002758	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	15922995
110	NC_002758	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
111	NC_002758	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15922995
112	NC_002758	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
113	NC_002758	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
114	NC_002758	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	15922995
115	NC_002758	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
116	NC_002758	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	15922995
117	NC_002758	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
118	NC_002758	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922995
119	NC_002758	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	15922995
120	NC_002758	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
121	NC_002758	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
122	NC_002758	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
123	NC_002758	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
124	NC_002758	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
125	NC_002758	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
126	NC_002758	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
127	NC_002758	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	15922995
128	NC_002758	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
129	NC_002758	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
130	NC_002758	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15922995
131	NC_002758	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922995
132	NC_002758	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	15922995
133	NC_002758	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922995
134	NC_002758	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
135	NC_002758	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	15922995
136	NC_002758	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	15922995
137	NC_002758	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	15922995
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139	NC_002758	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922995
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162	NC_002758	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922996
163	NC_002758	A	6	6	7828	7833	100 %	0 %	0 %	0 %	15922996
164	NC_002758	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	15922996
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257	NC_002758	AATG	2	8	11811	11818	50 %	25 %	25 %	0 %	161375866
258	NC_002758	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161375866
259	NC_002758	ATC	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161375866
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264	NC_002758	GCT	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161375866
265	NC_002758	ATT	2	6	12190	12195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161375866
266	NC_002758	GT	3	6	12209	12214	0 %	50 %	50 %	0 %	161375866
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393	NC_002758	A	6	6	19077	19082	100 %	0 %	0 %	0 %	15923004
394	NC_002758	TTGGTG	2	12	19116	19127	0 %	50 %	50 %	0 %	15923004
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398	NC_002758	AAT	2	6	19418	19423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923004
399	NC_002758	ACG	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15923004
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402	NC_002758	GAT	2	6	19532	19537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923004
403	NC_002758	ATG	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923004
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