MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 58461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329172
2	NC_000911	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329172
3	NC_000911	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329172
4	NC_000911	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	16329172
5	NC_000911	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329172
6	NC_000911	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329172
7	NC_000911	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	16329172
8	NC_000911	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329172
9	NC_000911	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329172
10	NC_000911	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	16329172
11	NC_000911	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329173
12	NC_000911	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329173
13	NC_000911	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	16329173
14	NC_000911	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
15	NC_000911	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	16329173
16	NC_000911	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329173
17	NC_000911	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329173
18	NC_000911	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
19	NC_000911	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
20	NC_000911	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329173
21	NC_000911	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	16329173
22	NC_000911	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	16329174
23	NC_000911	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329174
24	NC_000911	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	16329174
25	NC_000911	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329174
26	NC_000911	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329174
27	NC_000911	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329174
28	NC_000911	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	16329174
29	NC_000911	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329174
30	NC_000911	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329174
31	NC_000911	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329175
32	NC_000911	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	16329175
33	NC_000911	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329175
34	NC_000911	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329175
35	NC_000911	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329175
36	NC_000911	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329175
37	NC_000911	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329175
38	NC_000911	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	16329175
39	NC_000911	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329175
40	NC_000911	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329175
41	NC_000911	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329175
42	NC_000911	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329175
43	NC_000911	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329175
44	NC_000911	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329176
45	NC_000911	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329176
46	NC_000911	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
47	NC_000911	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329176
48	NC_000911	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
49	NC_000911	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
50	NC_000911	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329176
51	NC_000911	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
52	NC_000911	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
53	NC_000911	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	16329176
54	NC_000911	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	16329176
55	NC_000911	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
56	NC_000911	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329176
57	NC_000911	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	16329176
58	NC_000911	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	16329176
59	NC_000911	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329176
60	NC_000911	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	16329176
61	NC_000911	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329177
62	NC_000911	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329177
63	NC_000911	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329177
64	NC_000911	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329177
65	NC_000911	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329177
66	NC_000911	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	16329177
67	NC_000911	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329177
68	NC_000911	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329177
69	NC_000911	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329177
70	NC_000911	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329177
71	NC_000911	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329177
72	NC_000911	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329177
73	NC_000911	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329177
74	NC_000911	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329177
75	NC_000911	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329177
76	NC_000911	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
77	NC_000911	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	16329178
78	NC_000911	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329178
79	NC_000911	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329178
80	NC_000911	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
81	NC_000911	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
82	NC_000911	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	16329178
83	NC_000911	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
84	NC_000911	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
85	NC_000911	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329178
86	NC_000911	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
87	NC_000911	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329178
88	NC_000911	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329178
89	NC_000911	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329178
90	NC_000911	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	16329178
91	NC_000911	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
92	NC_000911	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329178
93	NC_000911	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329178
94	NC_000911	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329178
95	NC_000911	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329178
96	NC_000911	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
97	NC_000911	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
98	NC_000911	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
99	NC_000911	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
100	NC_000911	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
101	NC_000911	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
102	NC_000911	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329178
103	NC_000911	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329179
104	NC_000911	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329179
105	NC_000911	A	8	8	8543	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	16329179
106	NC_000911	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329179
107	NC_000911	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329179
108	NC_000911	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	16329179
109	NC_000911	TC	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	16329179
110	NC_000911	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329179
111	NC_000911	TGG	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329179
112	NC_000911	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	16329179
113	NC_000911	GTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329179
114	NC_000911	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329179
115	NC_000911	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329179
116	NC_000911	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329179
117	NC_000911	CAT	4	12	9076	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329179
118	NC_000911	AAC	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329179
119	NC_000911	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329179
120	NC_000911	TC	3	6	9123	9128	0 %	50 %	0 %	50 %	16329179
121	NC_000911	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329179
122	NC_000911	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329179
123	NC_000911	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	16329179
124	NC_000911	G	6	6	9430	9435	0 %	0 %	100 %	0 %	16329179
125	NC_000911	ACA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329179
126	NC_000911	GGC	2	6	9523	9528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329179
127	NC_000911	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	16329179
128	NC_000911	GCA	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329179
129	NC_000911	C	6	6	9668	9673	0 %	0 %	0 %	100 %	16329179
130	NC_000911	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	16329179
131	NC_000911	ATG	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329179
132	NC_000911	TAG	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329179
133	NC_000911	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329179
134	NC_000911	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329179
135	NC_000911	TTA	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329179
136	NC_000911	ATTT	2	8	10221	10228	25 %	75 %	0 %	0 %	16329179
137	NC_000911	ACT	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329179
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150	NC_000911	TGGCT	2	10	11014	11023	0 %	40 %	40 %	20 %	16329180
151	NC_000911	GGC	2	6	11141	11146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329180
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260	NC_000911	GCAG	2	8	17381	17388	25 %	0 %	50 %	25 %	16329185
261	NC_000911	GCA	2	6	17524	17529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329185
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267	NC_000911	GCG	2	6	17896	17901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329186
268	NC_000911	ACC	2	6	17935	17940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329186
269	NC_000911	AGT	2	6	17945	17950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329186
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272	NC_000911	C	6	6	18244	18249	0 %	0 %	0 %	100 %	16329186
273	NC_000911	TGG	2	6	18281	18286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329186
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395	NC_000911	AGGT	2	8	24691	24698	25 %	25 %	50 %	0 %	16329190
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