MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NT_187148	GCC	2	6	117224	117229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2502	NT_187148	CG	3	6	117246	117251	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2503	NT_187148	GAC	2	6	117263	117268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2504	NT_187148	TCG	2	6	117276	117281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2505	NT_187148	TGC	2	6	117313	117318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2506	NT_187148	CGAT	2	8	117423	117430	25 %	25 %	25 %	25 %	399995437
2507	NT_187148	CTC	3	9	117437	117445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995437
2508	NT_187148	CG	3	6	117466	117471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2509	NT_187148	CGGC	2	8	117532	117539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2510	NT_187148	TCG	2	6	117546	117551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2511	NT_187148	GCAA	2	8	117607	117614	50 %	0 %	25 %	25 %	399995437
2512	NT_187148	CA	3	6	117626	117631	50 %	0 %	0 %	50 %	399995437
2513	NT_187148	CGA	2	6	117661	117666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2514	NT_187148	CGG	2	6	117678	117683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995437
2515	NT_187148	GGT	2	6	117724	117729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995437
2516	NT_187148	GAA	2	6	117737	117742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995437
2517	NT_187148	TCG	2	6	117870	117875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2518	NT_187148	ATG	2	6	117897	117902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995437
2519	NT_187148	TCA	2	6	117984	117989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995437
2520	NT_187148	CGA	2	6	117991	117996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2521	NT_187148	TGC	2	6	118087	118092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2522	NT_187148	CTG	3	9	118097	118105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2523	NT_187148	CTG	2	6	118109	118114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2524	NT_187148	CTT	2	6	118142	118147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995437
2525	NT_187148	CGA	2	6	118225	118230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2526	NT_187148	CG	3	6	118238	118243	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2527	NT_187148	GCCG	2	8	118248	118255	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2528	NT_187148	CTG	2	6	118346	118351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2529	NT_187148	CTG	3	9	118385	118393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2530	NT_187148	TTG	2	6	118394	118399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995437
2531	NT_187148	CGC	2	6	118525	118530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2532	NT_187148	GCT	2	6	118579	118584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2533	NT_187148	TGC	2	6	118596	118601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2534	NT_187148	TCT	2	6	118620	118625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995437
2535	NT_187148	GCA	2	6	118656	118661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2536	NT_187148	CCG	2	6	118665	118670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2537	NT_187148	GC	3	6	118675	118680	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2538	NT_187148	CAC	2	6	118694	118699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NT_187148	CGA	2	6	118731	118736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2540	NT_187148	TGT	2	6	118737	118742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995438
2541	NT_187148	CCG	2	6	118743	118748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2542	NT_187148	CATC	2	8	118758	118765	25 %	25 %	0 %	50 %	399995438
2543	NT_187148	CGT	2	6	118788	118793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2544	NT_187148	CCAG	2	8	118887	118894	25 %	0 %	25 %	50 %	399995438
2545	NT_187148	CTCG	2	8	118918	118925	0 %	25 %	25 %	50 %	399995438
2546	NT_187148	GCC	2	6	118928	118933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2547	NT_187148	TCC	2	6	118987	118992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995438
2548	NT_187148	GC	3	6	118994	118999	0 %	0 %	50 %	50 %	399995438
2549	NT_187148	AG	3	6	119071	119076	50 %	0 %	50 %	0 %	399995438
2550	NT_187148	CAG	2	6	119242	119247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2551	NT_187148	CGC	2	6	119304	119309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2552	NT_187148	TTC	2	6	119311	119316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995438
2553	NT_187148	GCA	3	9	119373	119381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2554	NT_187148	TCG	2	6	119393	119398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2555	NT_187148	TCG	2	6	119405	119410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2556	NT_187148	CAG	2	6	119470	119475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2557	NT_187148	CGG	2	6	119721	119726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995438
2558	NT_187148	CGG	2	6	119742	119747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995438
2559	NT_187148	TGA	2	6	119771	119776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995438
2560	NT_187148	GCC	2	6	119848	119853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2561	NT_187148	AAC	2	6	119870	119875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995438
2562	NT_187148	GCC	2	6	119876	119881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2563	NT_187148	TCG	2	6	119921	119926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2564	NT_187148	GAAA	2	8	119935	119942	75 %	0 %	25 %	0 %	399995438
2565	NT_187148	CCG	2	6	119968	119973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2566	NT_187148	CCT	2	6	120018	120023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995438
2567	NT_187148	CCG	2	6	120048	120053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995438
2568	NT_187148	CGCT	2	8	120082	120089	0 %	25 %	25 %	50 %	399995438
2569	NT_187148	GAT	2	6	120142	120147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995438
2570	NT_187148	CACG	2	8	120165	120172	25 %	0 %	25 %	50 %	399995438
2571	NT_187148	GC	3	6	120177	120182	0 %	0 %	50 %	50 %	399995438
2572	NT_187148	CGA	2	6	120192	120197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995438
2573	NT_187148	TCG	2	6	120293	120298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NT_187148	GAT	2	6	120315	120320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NT_187148	TGA	2	6	120345	120350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NT_187148	GGA	2	6	120402	120407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995439
2577	NT_187148	TCT	2	6	120452	120457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995439
2578	NT_187148	GGT	2	6	120461	120466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995439
2579	NT_187148	CGC	2	6	120505	120510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2580	NT_187148	ACG	2	6	120529	120534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2581	NT_187148	GAA	2	6	120624	120629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995439
2582	NT_187148	TTCC	2	8	120655	120662	0 %	50 %	0 %	50 %	399995439
2583	NT_187148	CCT	2	6	120668	120673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995439
2584	NT_187148	ATC	2	6	120771	120776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995439
2585	NT_187148	TTC	2	6	120801	120806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995439
2586	NT_187148	TCG	2	6	120826	120831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2587	NT_187148	CGG	2	6	120863	120868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995439
2588	NT_187148	TGG	2	6	120871	120876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995439
2589	NT_187148	CG	3	6	120885	120890	0 %	0 %	50 %	50 %	399995439
2590	NT_187148	CA	3	6	120930	120935	50 %	0 %	0 %	50 %	399995439
2591	NT_187148	GTT	2	6	120942	120947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995439
2592	NT_187148	CGC	2	6	121007	121012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2593	NT_187148	CGA	2	6	121045	121050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2594	NT_187148	GCC	2	6	121065	121070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995439
2595	NT_187148	CGT	2	6	121100	121105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2596	NT_187148	GAA	2	6	121148	121153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995439
2597	NT_187148	TCG	2	6	121162	121167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995439
2598	NT_187148	TC	3	6	121182	121187	0 %	50 %	0 %	50 %	399995439
2599	NT_187148	GCG	2	6	121257	121262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NT_187148	GCG	2	6	121362	121367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NT_187148	GA	3	6	121388	121393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NT_187148	TGAG	2	8	121400	121407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NT_187148	GAA	2	6	121477	121482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995440
2604	NT_187148	GCG	2	6	121505	121510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995440
2605	NT_187148	GCGA	2	8	121526	121533	25 %	0 %	50 %	25 %	399995440
2606	NT_187148	CGA	2	6	121602	121607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2607	NT_187148	CCG	3	9	121643	121651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995440
2608	NT_187148	TAT	2	6	121722	121727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995440
2609	NT_187148	TCA	2	6	121740	121745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995440
2610	NT_187148	AAG	2	6	121792	121797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995440
2611	NT_187148	TCG	2	6	121835	121840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2612	NT_187148	TCA	2	6	121860	121865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995440
2613	NT_187148	CAC	2	6	121872	121877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995440
2614	NT_187148	CGG	2	6	121878	121883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995440
2615	NT_187148	GAT	2	6	121903	121908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995440
2616	NT_187148	CG	3	6	121932	121937	0 %	0 %	50 %	50 %	399995440
2617	NT_187148	GAC	2	6	121951	121956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2618	NT_187148	ACG	2	6	121979	121984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2619	NT_187148	GCT	2	6	121985	121990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2620	NT_187148	CTC	2	6	122020	122025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995440
2621	NT_187148	CGA	2	6	122068	122073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995440
2622	NT_187148	AAC	2	6	122074	122079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995440
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2626	NT_187148	AAATG	2	10	122149	122158	60 %	20 %	20 %	0 %	399995440
2627	NT_187148	CGC	2	6	122260	122265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995440
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2634	NT_187148	CTGC	2	8	122618	122625	0 %	25 %	25 %	50 %	399995440
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2638	NT_187148	GC	3	6	122891	122896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2642	NT_187148	CAT	2	6	123079	123084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995441
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2645	NT_187148	CTC	2	6	123569	123574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2646	NT_187148	ATG	2	6	123584	123589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2648	NT_187148	TGA	2	6	123616	123621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2706	NT_187148	CG	4	8	126322	126329	0 %	0 %	50 %	50 %	399995443
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2727	NT_187148	GA	4	8	127255	127262	50 %	0 %	50 %	0 %	399995444
2728	NT_187148	CAG	2	6	127263	127268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2729	NT_187148	GCA	2	6	127316	127321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2732	NT_187148	GCT	2	6	127415	127420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2735	NT_187148	AAG	2	6	127599	127604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995445
2736	NT_187148	GGC	2	6	127605	127610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995445
2737	NT_187148	GCT	2	6	127622	127627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2739	NT_187148	CTT	2	6	127674	127679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995445
2740	NT_187148	GGT	2	6	127684	127689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995445
2741	NT_187148	GTA	2	6	127723	127728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995445
2742	NT_187148	CGA	2	6	127787	127792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995445
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2744	NT_187148	CTG	2	6	127880	127885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2988	NT_187148	GCA	2	6	138257	138262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995456
2989	NT_187148	CTT	2	6	138298	138303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995456
2990	NT_187148	ATG	2	6	138308	138313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995456
2991	NT_187148	GCATC	2	10	138324	138333	20 %	20 %	20 %	40 %	399995456
2992	NT_187148	GCA	2	6	138352	138357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2993	NT_187148	GGC	2	6	138402	138407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NT_187148	CCT	2	6	138452	138457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2995	NT_187148	CGC	2	6	138482	138487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2996	NT_187148	GA	3	6	138528	138533	50 %	0 %	50 %	0 %	399995457
2997	NT_187148	CCGT	2	8	138561	138568	0 %	25 %	25 %	50 %	399995457
2998	NT_187148	CGC	2	6	138629	138634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995457
2999	NT_187148	GAG	2	6	138650	138655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995457
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