MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187147	GAT	2	6	49716	49721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995070
1002	NT_187147	TCC	3	9	49859	49867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NT_187147	AGG	2	6	49928	49933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NT_187147	CGG	2	6	49952	49957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NT_187147	CTG	2	6	49986	49991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NT_187147	CGCA	2	8	50005	50012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NT_187147	CGG	2	6	50028	50033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NT_187147	CCG	2	6	50049	50054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NT_187147	GCG	2	6	50097	50102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995071
1010	NT_187147	ACC	2	6	50129	50134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995071
1011	NT_187147	AGC	2	6	50141	50146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995071
1012	NT_187147	ATG	2	6	50225	50230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995071
1013	NT_187147	GCT	2	6	50266	50271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995071
1014	NT_187147	TCTT	2	8	50367	50374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NT_187147	CGG	2	6	50398	50403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NT_187147	GCT	2	6	50412	50417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NT_187147	CGA	2	6	50420	50425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NT_187147	AGC	2	6	50450	50455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NT_187147	TCG	2	6	50474	50479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NT_187147	GAC	2	6	50537	50542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NT_187147	ACG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NT_187147	GAA	2	6	50627	50632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NT_187147	GTC	2	6	50730	50735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995072
1024	NT_187147	AAGG	2	8	50768	50775	50 %	0 %	50 %	0 %	399995072
1025	NT_187147	TGC	3	9	50944	50952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995073
1026	NT_187147	CG	3	6	50962	50967	0 %	0 %	50 %	50 %	399995073
1027	NT_187147	TTG	2	6	50987	50992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995073
1028	NT_187147	CAT	2	6	51075	51080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995073
1029	NT_187147	CGG	2	6	51099	51104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995073
1030	NT_187147	AAG	2	6	51124	51129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995073
1031	NT_187147	CT	3	6	51139	51144	0 %	50 %	0 %	50 %	399995073
1032	NT_187147	GC	3	6	51181	51186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NT_187147	GATC	2	8	51214	51221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NT_187147	TCG	2	6	51258	51263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NT_187147	GA	3	6	51340	51345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NT_187147	GAA	2	6	51383	51388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NT_187147	CCT	2	6	51395	51400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NT_187147	TCC	2	6	51455	51460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995074
1039	NT_187147	CGC	2	6	51461	51466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995074
1040	NT_187147	GAG	2	6	51472	51477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995074
1041	NT_187147	GC	4	8	51484	51491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
1042	NT_187147	CCG	2	6	51719	51724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995074
1043	NT_187147	GCC	2	6	51730	51735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995074
1044	NT_187147	TC	3	6	51751	51756	0 %	50 %	0 %	50 %	399995074
1045	NT_187147	TTC	2	6	51815	51820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995074
1046	NT_187147	CTC	2	6	51863	51868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995074
1047	NT_187147	TCGGCC	2	12	51942	51953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995074
1048	NT_187147	ACC	2	6	51969	51974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995074
1049	NT_187147	CG	3	6	51975	51980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
1050	NT_187147	GGC	2	6	51984	51989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995074
1051	NT_187147	GAC	2	6	52010	52015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995074
1052	NT_187147	TCT	2	6	52033	52038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995074
1053	NT_187147	CAC	2	6	52081	52086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995074
1054	NT_187147	CGA	2	6	52125	52130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995074
1055	NT_187147	TTC	2	6	52169	52174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995074
1056	NT_187147	CAG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NT_187147	CGTT	2	8	52259	52266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NT_187147	AGCG	2	8	52319	52326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1059	NT_187147	CG	3	6	52362	52367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NT_187147	GCAC	2	8	52377	52384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1061	NT_187147	GACC	2	8	52525	52532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NT_187147	CAG	2	6	52539	52544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NT_187147	GC	3	6	52556	52561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NT_187147	CCA	2	6	52571	52576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NT_187147	CCA	2	6	52581	52586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NT_187147	TCG	2	6	52614	52619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NT_187147	GCCG	2	8	52668	52675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NT_187147	GCA	2	6	52692	52697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NT_187147	CCA	2	6	52758	52763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NT_187147	GGC	2	6	52814	52819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NT_187147	CGA	2	6	52878	52883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NT_187147	TCGA	2	8	52920	52927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NT_187147	GAT	2	6	52936	52941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995075
1074	NT_187147	TCCG	2	8	52955	52962	0 %	25 %	25 %	50 %	399995075
1075	NT_187147	CCG	2	6	52978	52983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995075
1076	NT_187147	CCAT	2	8	52986	52993	25 %	25 %	0 %	50 %	399995075
1077	NT_187147	CCATC	2	10	53021	53030	20 %	20 %	0 %	60 %	399995075
1078	NT_187147	TCT	2	6	53119	53124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995076
1079	NT_187147	GCG	2	6	53138	53143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995076
1080	NT_187147	GTG	2	6	53192	53197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995076
1081	NT_187147	CGA	2	6	53224	53229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NT_187147	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NT_187147	TTC	2	6	53387	53392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NT_187147	ACC	2	6	53430	53435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NT_187147	CCGA	2	8	53544	53551	25 %	0 %	25 %	50 %	399995077
1086	NT_187147	TCA	2	6	53572	53577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995077
1087	NT_187147	GC	3	6	53609	53614	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
1088	NT_187147	ATC	2	6	53619	53624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995077
1089	NT_187147	CTG	2	6	53625	53630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995077
1090	NT_187147	GGT	2	6	53798	53803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995077
1091	NT_187147	CCG	2	6	53823	53828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1092	NT_187147	GAC	2	6	53834	53839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995077
1093	NT_187147	ATG	2	6	53856	53861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995077
1094	NT_187147	CAGCGC	2	12	53879	53890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995077
1095	NT_187147	TCG	2	6	53968	53973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995077
1096	NT_187147	CCG	2	6	54009	54014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1097	NT_187147	GTCG	2	8	54032	54039	0 %	25 %	50 %	25 %	399995077
1098	NT_187147	GAA	2	6	54092	54097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995077
1099	NT_187147	GTT	2	6	54149	54154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995077
1100	NT_187147	GCC	2	6	54156	54161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1101	NT_187147	GCCG	2	8	54257	54264	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
1102	NT_187147	GCC	2	6	54297	54302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1103	NT_187147	GC	3	6	54320	54325	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
1104	NT_187147	CTT	2	6	54401	54406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995077
1105	NT_187147	GCG	2	6	54436	54441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995077
1106	NT_187147	GCC	2	6	54468	54473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1107	NT_187147	CAAC	2	8	54497	54504	50 %	0 %	0 %	50 %	399995077
1108	NT_187147	CCG	2	6	54526	54531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995077
1109	NT_187147	ATC	2	6	54543	54548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995077
1110	NT_187147	TCCA	2	8	54582	54589	25 %	25 %	0 %	50 %	399995077
1111	NT_187147	AGC	2	6	54610	54615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995077
1112	NT_187147	CCCG	2	8	54631	54638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1113	NT_187147	CGT	2	6	54650	54655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NT_187147	AGG	2	6	54685	54690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NT_187147	ACG	2	6	54703	54708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NT_187147	CCG	2	6	54740	54745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NT_187147	GTTC	2	8	54878	54885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NT_187147	CTC	2	6	54886	54891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NT_187147	CG	4	8	54968	54975	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
1120	NT_187147	CGT	2	6	54990	54995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995078
1121	NT_187147	GCT	2	6	55085	55090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995078
1122	NT_187147	GCA	2	6	55097	55102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995078
1123	NT_187147	GCC	2	6	55144	55149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995078
1124	NT_187147	GCG	2	6	55161	55166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995078
1125	NT_187147	GTTCC	2	10	55171	55180	0 %	40 %	20 %	40 %	399995078
1126	NT_187147	GCC	2	6	55194	55199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995078
1127	NT_187147	ATC	2	6	55303	55308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995078
1128	NT_187147	TGC	2	6	55311	55316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995078
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1130	NT_187147	TCG	2	6	55439	55444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995078
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1234	NT_187147	GCG	2	6	61341	61346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1235	NT_187147	A	7	7	61402	61408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1236	NT_187147	TGC	2	6	61431	61436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1239	NT_187147	CAG	2	6	61597	61602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995082
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1241	NT_187147	GCTT	2	8	61673	61680	0 %	50 %	25 %	25 %	399995082
1242	NT_187147	CGAA	2	8	61838	61845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1243	NT_187147	CTA	2	6	61846	61851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NT_187147	CATGA	2	10	61958	61967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1250	NT_187147	CAT	2	6	62220	62225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995083
1251	NT_187147	CG	3	6	62256	62261	0 %	0 %	50 %	50 %	399995083
1252	NT_187147	TC	3	6	62395	62400	0 %	50 %	0 %	50 %	399995083
1253	NT_187147	CTT	2	6	62420	62425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995083
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1255	NT_187147	AC	3	6	62461	62466	50 %	0 %	0 %	50 %	399995083
1256	NT_187147	CGA	2	6	62512	62517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995083
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