MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187135	GGC	2	6	50700	50705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248411
1002	NT_187135	GTCT	2	8	50835	50842	0 %	50 %	25 %	25 %	409248411
1003	NT_187135	ATG	2	6	50852	50857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248411
1004	NT_187135	GAC	2	6	50884	50889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248411
1005	NT_187135	CTC	3	9	50945	50953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248411
1006	NT_187135	GAA	2	6	50992	50997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248411
1007	NT_187135	CG	3	6	51009	51014	0 %	0 %	50 %	50 %	409248411
1008	NT_187135	AAT	2	6	51125	51130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248411
1009	NT_187135	AGT	2	6	51266	51271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248412
1010	NT_187135	CCAT	2	8	51347	51354	25 %	25 %	0 %	50 %	409248412
1011	NT_187135	GCT	2	6	51366	51371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1012	NT_187135	TCA	2	6	51395	51400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248412
1013	NT_187135	GCCT	2	8	51451	51458	0 %	25 %	25 %	50 %	409248412
1014	NT_187135	ATG	2	6	51515	51520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248412
1015	NT_187135	GTA	2	6	51571	51576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248412
1016	NT_187135	CGG	2	6	51657	51662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248412
1017	NT_187135	CTG	2	6	51731	51736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1018	NT_187135	CTG	2	6	51745	51750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1019	NT_187135	TCC	2	6	51767	51772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248412
1020	NT_187135	TC	3	6	51811	51816	0 %	50 %	0 %	50 %	409248412
1021	NT_187135	TGA	2	6	51840	51845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248412
1022	NT_187135	CTT	2	6	51901	51906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248412
1023	NT_187135	TCC	2	6	51935	51940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248412
1024	NT_187135	CAG	2	6	51955	51960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1025	NT_187135	CGTT	2	8	51967	51974	0 %	50 %	25 %	25 %	409248412
1026	NT_187135	GC	3	6	52038	52043	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
1027	NT_187135	GGTC	2	8	52060	52067	0 %	25 %	50 %	25 %	409248412
1028	NT_187135	GAAC	2	8	52100	52107	50 %	0 %	25 %	25 %	409248412
1029	NT_187135	GCCG	2	8	52122	52129	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
1030	NT_187135	TCG	2	6	52181	52186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1031	NT_187135	CG	3	6	52203	52208	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
1032	NT_187135	CGCTT	2	10	52349	52358	0 %	40 %	20 %	40 %	409248412
1033	NT_187135	GA	3	6	52394	52399	50 %	0 %	50 %	0 %	409248412
1034	NT_187135	ACG	3	9	52400	52408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248412
1035	NT_187135	GTTT	2	8	52410	52417	0 %	75 %	25 %	0 %	409248412
1036	NT_187135	CAC	2	6	52521	52526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248413
1037	NT_187135	AG	3	6	52553	52558	50 %	0 %	50 %	0 %	409248413
1038	NT_187135	GCA	2	6	52580	52585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248413
1039	NT_187135	ACC	2	6	52684	52689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248413
1040	NT_187135	GAA	2	6	52745	52750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NT_187135	TCC	3	9	52794	52802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248414
1042	NT_187135	CGG	2	6	52810	52815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248414
1043	NT_187135	CCG	2	6	52831	52836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248414
1044	NT_187135	TA	3	6	52933	52938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NT_187135	TAT	2	6	52942	52947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248415
1046	NT_187135	AAG	2	6	52969	52974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248415
1047	NT_187135	GCG	2	6	53168	53173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NT_187135	GTC	2	6	53268	53273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248417
1049	NT_187135	CAG	2	6	53287	53292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248417
1050	NT_187135	TCCT	2	8	53326	53333	0 %	50 %	0 %	50 %	409248417
1051	NT_187135	GGT	2	6	53354	53359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248417
1052	NT_187135	CCGT	2	8	53473	53480	0 %	25 %	25 %	50 %	409248417
1053	NT_187135	GCCG	2	8	53509	53516	0 %	0 %	50 %	50 %	409248417
1054	NT_187135	TGA	2	6	53535	53540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248417
1055	NT_187135	CCA	2	6	53554	53559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248417
1056	NT_187135	CAG	2	6	53617	53622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248417
1057	NT_187135	CTT	2	6	53694	53699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248417
1058	NT_187135	CTC	2	6	53719	53724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248417
1059	NT_187135	ACCG	2	8	53745	53752	25 %	0 %	25 %	50 %	409248417
1060	NT_187135	TTCAG	2	10	53803	53812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1061	NT_187135	GCC	2	6	53849	53854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NT_187135	CGT	2	6	53956	53961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248418
1063	NT_187135	CCAG	2	8	53992	53999	25 %	0 %	25 %	50 %	409248419
1064	NT_187135	TCG	2	6	54208	54213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248419
1065	NT_187135	A	6	6	54303	54308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NT_187135	GCTGG	2	10	54516	54525	0 %	20 %	60 %	20 %	409248420
1067	NT_187135	CAC	2	6	54544	54549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248420
1068	NT_187135	CA	3	6	54597	54602	50 %	0 %	0 %	50 %	409248420
1069	NT_187135	GCC	2	6	54655	54660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248420
1070	NT_187135	CGT	2	6	54673	54678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248420
1071	NT_187135	ACG	2	6	54770	54775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248420
1072	NT_187135	TG	3	6	54853	54858	0 %	50 %	50 %	0 %	409248421
1073	NT_187135	GCGG	2	8	54863	54870	0 %	0 %	75 %	25 %	409248421
1074	NT_187135	GGC	2	6	54968	54973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248421
1075	NT_187135	GTT	2	6	55056	55061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248422
1076	NT_187135	CGG	2	6	55112	55117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248422
1077	NT_187135	GGAAT	2	10	55138	55147	40 %	20 %	40 %	0 %	409248422
1078	NT_187135	GGA	2	6	55203	55208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248422
1079	NT_187135	GT	3	6	55226	55231	0 %	50 %	50 %	0 %	409248422
1080	NT_187135	CGG	2	6	55295	55300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248422
1081	NT_187135	CTG	2	6	55315	55320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248422
1082	NT_187135	ATC	2	6	55373	55378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248422
1083	NT_187135	GCG	2	6	55414	55419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248422
1084	NT_187135	A	6	6	55438	55443	100 %	0 %	0 %	0 %	409248422
1085	NT_187135	CGC	2	6	55455	55460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NT_187135	GCG	2	6	55465	55470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NT_187135	GC	3	6	55543	55548	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
1088	NT_187135	ATGG	2	8	55565	55572	25 %	25 %	50 %	0 %	409248423
1089	NT_187135	GGAT	2	8	55618	55625	25 %	25 %	50 %	0 %	409248423
1090	NT_187135	CTG	2	6	55666	55671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248423
1091	NT_187135	ATT	2	6	55747	55752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248423
1092	NT_187135	CGC	2	6	55778	55783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248423
1093	NT_187135	GGA	2	6	55791	55796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248423
1094	NT_187135	GC	3	6	55915	55920	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
1095	NT_187135	GGC	2	6	55929	55934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248423
1096	NT_187135	CG	3	6	55943	55948	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
1097	NT_187135	CTG	2	6	56013	56018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248423
1098	NT_187135	GAT	2	6	56026	56031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248423
1099	NT_187135	GGT	2	6	56043	56048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248423
1100	NT_187135	TGC	2	6	56153	56158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248423
1101	NT_187135	TGGA	2	8	56185	56192	25 %	25 %	50 %	0 %	409248423
1102	NT_187135	GCG	2	6	56294	56299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NT_187135	AAGGAT	2	12	56319	56330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NT_187135	TCC	2	6	56356	56361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NT_187135	GTT	2	6	56364	56369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NT_187135	TTTA	2	8	56488	56495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NT_187135	CCG	2	6	56507	56512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NT_187135	CGT	2	6	56519	56524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NT_187135	CCTGCT	2	12	56559	56570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248424
1110	NT_187135	T	6	6	56570	56575	0 %	100 %	0 %	0 %	409248424
1111	NT_187135	CTGCG	2	10	56577	56586	0 %	20 %	40 %	40 %	409248424
1112	NT_187135	TCC	2	6	56607	56612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248424
1113	NT_187135	TGTCG	2	10	56627	56636	0 %	40 %	40 %	20 %	409248424
1114	NT_187135	GAC	2	6	56659	56664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NT_187135	T	6	6	56680	56685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NT_187135	ACC	2	6	56698	56703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248425
1117	NT_187135	GCA	2	6	56747	56752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248425
1118	NT_187135	GGA	2	6	56793	56798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248425
1119	NT_187135	CGC	2	6	56919	56924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248425
1120	NT_187135	GAA	2	6	56938	56943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248425
1121	NT_187135	TGA	2	6	57009	57014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248425
1122	NT_187135	GAG	2	6	57040	57045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248425
1123	NT_187135	CAG	2	6	57147	57152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248425
1124	NT_187135	CGG	2	6	57201	57206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NT_187135	CCG	2	6	57213	57218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NT_187135	CAC	2	6	57245	57250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248426
1127	NT_187135	CCG	2	6	57294	57299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248426
1128	NT_187135	ACC	2	6	57325	57330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248426
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1133	NT_187135	GA	4	8	57500	57507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NT_187135	CGC	2	6	57511	57516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1151	NT_187135	GGCA	2	8	58232	58239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1250	NT_187135	CAG	2	6	63555	63560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248440
1251	NT_187135	TCGTT	2	10	63593	63602	0 %	60 %	20 %	20 %	409248440
1252	NT_187135	CTGG	2	8	63680	63687	0 %	25 %	50 %	25 %	409248440
1253	NT_187135	GCA	2	6	63746	63751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248440
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1255	NT_187135	ATG	2	6	63835	63840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248440
1256	NT_187135	AGA	2	6	63874	63879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248440
1257	NT_187135	CAGA	2	8	63999	64006	50 %	0 %	25 %	25 %	409248440
1258	NT_187135	A	6	6	64125	64130	100 %	0 %	0 %	0 %	409248440
1259	NT_187135	AGA	2	6	64132	64137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248440
1260	NT_187135	CAA	2	6	64184	64189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248440
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1263	NT_187135	CAG	2	6	64339	64344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248440
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1277	NT_187135	TGC	2	6	65067	65072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248442
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1279	NT_187135	A	6	6	65225	65230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NT_187135	GGCCGT	2	12	65260	65271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1281	NT_187135	GCG	2	6	65282	65287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1282	NT_187135	AAC	2	6	65311	65316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1283	NT_187135	AGC	2	6	65328	65333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1284	NT_187135	A	7	7	65389	65395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1285	NT_187135	AAT	2	6	65407	65412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248443
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1287	NT_187135	GCA	2	6	65441	65446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248443
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1292	NT_187135	CAA	2	6	65767	65772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248443
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1295	NT_187135	CGG	2	6	65829	65834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1297	NT_187135	AAG	2	6	65857	65862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1329	NT_187135	CTG	2	6	67413	67418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NT_187135	CGC	2	6	67426	67431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1331	NT_187135	ATT	3	9	67460	67468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1332	NT_187135	TTC	2	6	67498	67503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1333	NT_187135	T	6	6	67512	67517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1334	NT_187135	TATT	2	8	67520	67527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1335	NT_187135	ATA	2	6	67541	67546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1343	NT_187135	GC	3	6	67890	67895	0 %	0 %	50 %	50 %	409248449
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1360	NT_187135	TTA	2	6	68533	68538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1365	NT_187135	TGT	2	6	68785	68790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248450
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1367	NT_187135	GT	3	6	68834	68839	0 %	50 %	50 %	0 %	409248450
1368	NT_187135	AGT	2	6	68869	68874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248450
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1371	NT_187135	GTAA	2	8	69068	69075	50 %	25 %	25 %	0 %	409248450
1372	NT_187135	AG	3	6	69129	69134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1373	NT_187135	GGA	2	6	69171	69176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1374	NT_187135	TATT	2	8	69177	69184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1375	NT_187135	TCA	2	6	69239	69244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NT_187135	ATT	2	6	69246	69251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248451
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1379	NT_187135	TCA	2	6	69334	69339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248451
1380	NT_187135	AGC	2	6	69351	69356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248451
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1382	NT_187135	GTG	2	6	69441	69446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248451
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