MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187132	ATC	2	6	64	69	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187132	GAC	3	9	102	110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187132	TGG	2	6	111	116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187132	GAC	2	6	152	157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187132	TGC	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187132	CTC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187132	GCG	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187132	GCT	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187132	AAC	2	6	286	291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187132	ACG	2	6	326	331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248360
11	NT_187132	GC	3	6	362	367	0 %	0 %	50 %	50 %	409248360
12	NT_187132	GCC	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248360
13	NT_187132	GTG	2	6	426	431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248360
14	NT_187132	ACG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248360
15	NT_187132	GCC	2	6	565	570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248360
16	NT_187132	GCG	2	6	644	649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248360
17	NT_187132	TGG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248360
18	NT_187132	GGCT	2	8	680	687	0 %	25 %	50 %	25 %	409248360
19	NT_187132	GCG	3	9	692	700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248360
20	NT_187132	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248360
21	NT_187132	GGCA	2	8	803	810	25 %	0 %	50 %	25 %	409248360
22	NT_187132	TCG	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248360
23	NT_187132	ATA	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248360
24	NT_187132	TGA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248360
25	NT_187132	TGG	2	6	937	942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248360
26	NT_187132	ACA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248360
27	NT_187132	CAGA	2	8	982	989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187132	TAA	2	6	1024	1029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187132	GCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187132	GCT	2	6	1095	1100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187132	GGT	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187132	GGT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187132	TGG	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187132	GTGG	2	8	1467	1474	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187132	GATTAC	2	12	1485	1496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NT_187132	CA	3	6	1509	1514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187132	TCCC	2	8	1544	1551	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NT_187132	AAC	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187132	GTC	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187132	ATT	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187132	CCG	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187132	CAGC	2	8	1713	1720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187132	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187132	ATT	2	6	1753	1758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187132	AAT	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187132	GTG	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187132	CGGCG	2	10	1902	1911	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NT_187132	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187132	CAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187132	GCA	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187132	CCGTT	2	10	2179	2188	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NT_187132	AGGA	2	8	2203	2210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187132	TGGC	2	8	2253	2260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187132	TGG	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187132	GCT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187132	GTGAT	2	10	2456	2465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187132	CGA	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187132	GGGC	2	8	2502	2509	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187132	CGCC	2	8	2529	2536	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NT_187132	CGT	2	6	2570	2575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187132	CAC	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NT_187132	TGG	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187132	GT	3	6	2745	2750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187132	GAC	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187132	CCG	2	6	2789	2794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NT_187132	GGA	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187132	GC	3	6	2941	2946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187132	AC	3	6	2951	2956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187132	GGC	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187132	AGC	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187132	ACA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187132	CA	3	6	3144	3149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187132	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187132	CAT	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187132	CGC	2	6	3309	3314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187132	CAGGC	2	10	3363	3372	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NT_187132	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187132	GCT	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187132	GGA	2	6	3540	3545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.