MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187128	CCAT	2	8	183	190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187128	GCA	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187128	TCA	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187128	TTC	2	6	318	323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187128	TAGC	2	8	392	399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187128	GACT	2	8	433	440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187128	AAGC	2	8	443	450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187128	TTA	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187128	A	8	8	506	513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187128	AAT	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187128	TTAA	2	8	540	547	50 %	50 %	0 %	0 %	409248207
12	NT_187128	TAT	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248207
13	NT_187128	GAT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187128	ATC	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187128	CTT	2	6	719	724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248208
16	NT_187128	CTGC	2	8	730	737	0 %	25 %	25 %	50 %	409248208
17	NT_187128	GAC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248208
18	NT_187128	GAC	2	6	807	812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248208
19	NT_187128	CTCC	2	8	813	820	0 %	25 %	0 %	75 %	409248208
20	NT_187128	CCGC	2	8	827	834	0 %	0 %	25 %	75 %	409248208
21	NT_187128	CAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248208
22	NT_187128	CAGT	2	8	874	881	25 %	25 %	25 %	25 %	409248208
23	NT_187128	GCC	2	6	915	920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248208
24	NT_187128	CGC	2	6	957	962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187128	GA	3	6	982	987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187128	ATC	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187128	TTC	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187128	CAAG	2	8	1045	1052	50 %	0 %	25 %	25 %	409248209
29	NT_187128	AGCG	2	8	1089	1096	25 %	0 %	50 %	25 %	409248209
30	NT_187128	AGC	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248209
31	NT_187128	GCC	2	6	1317	1322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248209
32	NT_187128	TGG	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248209
33	NT_187128	A	7	7	1396	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	409248209
34	NT_187128	GCA	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248209
35	NT_187128	CT	3	6	1504	1509	0 %	50 %	0 %	50 %	409248209
36	NT_187128	AGC	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248209
37	NT_187128	AGC	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248209
38	NT_187128	TCA	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248209
39	NT_187128	GTG	2	6	1742	1747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248209
40	NT_187128	TGG	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248209
41	NT_187128	GTT	2	6	1786	1791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248209
42	NT_187128	AGG	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248209
43	NT_187128	GC	3	6	2003	2008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187128	TGG	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187128	CAT	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.